Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA3O43365 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA3O43365 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms