Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MSI1O43347 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MSI1O43347 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MSI1O43347 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MSI1O43347 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MSI1O43347 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MSI1O43347 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MSI1O43347 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MSI1O43347 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MSI1O43347 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MSI1O43347 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MSI1O43347 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MSI1O43347 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MSI1O43347 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MSI1O43347 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MSI1O43347 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MSI1O43347 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MSI1O43347 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MSI1O43347 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MSI1O43347 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MSI1O43347 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MSI1O43347 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MSI1O43347 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MSI1O43347 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MSI1O43347 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MSI1O43347 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MSI1O43347 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MSI1O43347 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MSI1O43347 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MSI1O43347 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSI1O43347 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSI1O43347 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSI1O43347 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSI1O43347 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSI1O43347 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSI1O43347 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSI1O43347 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSI1O43347 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSI1O43347 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MSI1O43347 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSI1O43347 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSI1O43347 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSI1O43347 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSI1O43347 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MSI1O43347 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSI1O43347 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSI1O43347 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSI1O43347 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSI1O43347 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSI1O43347 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MSI1O43347 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSI1O43347 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSI1O43347 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSI1O43347 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSI1O43347 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSI1O43347 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSI1O43347 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MSI1O43347 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MSI1O43347 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MSI1O43347 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MSI1O43347 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSI1O43347 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSI1O43347 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSI1O43347 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSI1O43347 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSI1O43347 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSI1O43347 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSI1O43347 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSI1O43347 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MSI1O43347 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSI1O43347 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSI1O43347 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSI1O43347 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSI1O43347 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSI1O43347 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSI1O43347 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MSI1O43347 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSI1O43347 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSI1O43347 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MSI1O43347 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSI1O43347 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSI1O43347 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSI1O43347 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSI1O43347 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSI1O43347 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSI1O43347 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSI1O43347 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSI1O43347 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MSI1O43347 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSI1O43347 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSI1O43347 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSI1O43347 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSI1O43347 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSI1O43347 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSI1O43347 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSI1O43347 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSI1O43347 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSI1O43347 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSI1O43347 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSI1O43347 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms