Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SRGAP3O43295 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SRGAP3O43295 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SRGAP3O43295 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SRGAP3O43295 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SRGAP3O43295 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SRGAP3O43295 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SRGAP3O43295 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SRGAP3O43295 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SRGAP3O43295 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SRGAP3O43295 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms