Protein–RNA interactions for Protein: O15111

CHUK, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHUKO15111 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHUKO15111 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHUKO15111 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHUKO15111 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHUKO15111 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHUKO15111 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CHUKO15111 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHUKO15111 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHUKO15111 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHUKO15111 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHUKO15111 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHUKO15111 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHUKO15111 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHUKO15111 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHUKO15111 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHUKO15111 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHUKO15111 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHUKO15111 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHUKO15111 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHUKO15111 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHUKO15111 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHUKO15111 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHUKO15111 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHUKO15111 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHUKO15111 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHUKO15111 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHUKO15111 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHUKO15111 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHUKO15111 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHUKO15111 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHUKO15111 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHUKO15111 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHUKO15111 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHUKO15111 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHUKO15111 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHUKO15111 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHUKO15111 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHUKO15111 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHUKO15111 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHUKO15111 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHUKO15111 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHUKO15111 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHUKO15111 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHUKO15111 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHUKO15111 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHUKO15111 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHUKO15111 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHUKO15111 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHUKO15111 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHUKO15111 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHUKO15111 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHUKO15111 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHUKO15111 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHUKO15111 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHUKO15111 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHUKO15111 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHUKO15111 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHUKO15111 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHUKO15111 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHUKO15111 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHUKO15111 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHUKO15111 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHUKO15111 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHUKO15111 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CHUKO15111 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHUKO15111 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHUKO15111 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHUKO15111 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHUKO15111 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHUKO15111 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHUKO15111 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHUKO15111 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHUKO15111 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHUKO15111 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHUKO15111 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHUKO15111 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHUKO15111 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHUKO15111 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHUKO15111 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHUKO15111 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHUKO15111 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHUKO15111 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHUKO15111 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHUKO15111 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHUKO15111 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHUKO15111 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHUKO15111 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHUKO15111 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHUKO15111 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHUKO15111 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHUKO15111 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHUKO15111 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHUKO15111 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHUKO15111 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHUKO15111 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHUKO15111 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHUKO15111 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHUKO15111 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHUKO15111 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHUKO15111 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms