Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SYNMO15061 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SYNMO15061 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SYNMO15061 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SYNMO15061 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SYNMO15061 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SYNMO15061 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SYNMO15061 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SYNMO15061 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SYNMO15061 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SYNMO15061 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SYNMO15061 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
SYNMO15061 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SYNMO15061 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SYNMO15061 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SYNMO15061 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SYNMO15061 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.84
SYNMO15061 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
SYNMO15061 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
SYNMO15061 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
SYNMO15061 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
SYNMO15061 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
SYNMO15061 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
SYNMO15061 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
SYNMO15061 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SYNMO15061 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SYNMO15061 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SYNMO15061 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SYNMO15061 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SYNMO15061 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SYNMO15061 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SYNMO15061 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SYNMO15061 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SYNMO15061 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SYNMO15061 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SYNMO15061 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SYNMO15061 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SYNMO15061 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SYNMO15061 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SYNMO15061 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SYNMO15061 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SYNMO15061 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SYNMO15061 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SYNMO15061 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SYNMO15061 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SYNMO15061 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SYNMO15061 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SYNMO15061 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SYNMO15061 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SYNMO15061 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SYNMO15061 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SYNMO15061 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SYNMO15061 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SYNMO15061 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SYNMO15061 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SYNMO15061 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SYNMO15061 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SYNMO15061 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SYNMO15061 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SYNMO15061 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SYNMO15061 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SYNMO15061 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SYNMO15061 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SYNMO15061 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
SYNMO15061 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
SYNMO15061 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SYNMO15061 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
SYNMO15061 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
SYNMO15061 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
SYNMO15061 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
SYNMO15061 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
SYNMO15061 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
SYNMO15061 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SYNMO15061 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SYNMO15061 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SYNMO15061 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SYNMO15061 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SYNMO15061 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SYNMO15061 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SYNMO15061 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SYNMO15061 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SYNMO15061 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SYNMO15061 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SYNMO15061 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SYNMO15061 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SYNMO15061 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
SYNMO15061 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SYNMO15061 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SYNMO15061 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SYNMO15061 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
SYNMO15061 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SYNMO15061 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SYNMO15061 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SYNMO15061 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SYNMO15061 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SYNMO15061 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SYNMO15061 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SYNMO15061 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SYNMO15061 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SYNMO15061 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms