Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BCKDKO14874 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BCKDKO14874 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BCKDKO14874 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BCKDKO14874 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BCKDKO14874 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
BCKDKO14874 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BCKDKO14874 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BCKDKO14874 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BCKDKO14874 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BCKDKO14874 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BCKDKO14874 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BCKDKO14874 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BCKDKO14874 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BCKDKO14874 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BCKDKO14874 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BCKDKO14874 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BCKDKO14874 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BCKDKO14874 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BCKDKO14874 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BCKDKO14874 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BCKDKO14874 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
BCKDKO14874 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
BCKDKO14874 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
BCKDKO14874 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
BCKDKO14874 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms