Protein–RNA interactions for Protein: O14594

NCAN, Neurocan core protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCANO14594 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCANO14594 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCANO14594 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCANO14594 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCANO14594 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCANO14594 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCANO14594 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCANO14594 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCANO14594 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCANO14594 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCANO14594 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCANO14594 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCANO14594 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCANO14594 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCANO14594 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCANO14594 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCANO14594 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCANO14594 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCANO14594 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCANO14594 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCANO14594 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCANO14594 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCANO14594 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCANO14594 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCANO14594 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCANO14594 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCANO14594 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCANO14594 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCANO14594 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCANO14594 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCANO14594 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCANO14594 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCANO14594 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCANO14594 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCANO14594 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCANO14594 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCANO14594 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCANO14594 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCANO14594 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NCANO14594 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NCANO14594 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NCANO14594 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NCANO14594 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NCANO14594 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NCANO14594 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCANO14594 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCANO14594 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCANO14594 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCANO14594 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCANO14594 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCANO14594 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCANO14594 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCANO14594 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCANO14594 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NCANO14594 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCANO14594 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCANO14594 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCANO14594 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NCANO14594 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCANO14594 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCANO14594 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCANO14594 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCANO14594 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCANO14594 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCANO14594 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCANO14594 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCANO14594 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NCANO14594 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCANO14594 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCANO14594 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCANO14594 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCANO14594 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCANO14594 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCANO14594 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NCANO14594 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCANO14594 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCANO14594 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCANO14594 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCANO14594 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCANO14594 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCANO14594 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCANO14594 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCANO14594 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCANO14594 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCANO14594 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCANO14594 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCANO14594 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCANO14594 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NCANO14594 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCANO14594 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCANO14594 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCANO14594 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCANO14594 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCANO14594 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCANO14594 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCANO14594 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCANO14594 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCANO14594 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCANO14594 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCANO14594 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms