Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PODXLO00592 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PODXLO00592 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PODXLO00592 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PODXLO00592 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PODXLO00592 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PODXLO00592 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PODXLO00592 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PODXLO00592 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PODXLO00592 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PODXLO00592 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PODXLO00592 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PODXLO00592 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PODXLO00592 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PODXLO00592 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PODXLO00592 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PODXLO00592 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PODXLO00592 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PODXLO00592 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PODXLO00592 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PODXLO00592 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PODXLO00592 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PODXLO00592 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PODXLO00592 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PODXLO00592 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PODXLO00592 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PODXLO00592 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PODXLO00592 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PODXLO00592 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PODXLO00592 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PODXLO00592 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PODXLO00592 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PODXLO00592 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PODXLO00592 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PODXLO00592 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PODXLO00592 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PODXLO00592 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PODXLO00592 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PODXLO00592 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PODXLO00592 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PODXLO00592 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PODXLO00592 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PODXLO00592 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PODXLO00592 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PODXLO00592 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PODXLO00592 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PODXLO00592 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PODXLO00592 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PODXLO00592 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PODXLO00592 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PODXLO00592 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PODXLO00592 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PODXLO00592 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PODXLO00592 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PODXLO00592 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PODXLO00592 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PODXLO00592 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PODXLO00592 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PODXLO00592 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PODXLO00592 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PODXLO00592 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PODXLO00592 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PODXLO00592 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PODXLO00592 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PODXLO00592 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PODXLO00592 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PODXLO00592 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PODXLO00592 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PODXLO00592 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PODXLO00592 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PODXLO00592 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PODXLO00592 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PODXLO00592 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PODXLO00592 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PODXLO00592 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PODXLO00592 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PODXLO00592 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PODXLO00592 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PODXLO00592 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PODXLO00592 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PODXLO00592 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PODXLO00592 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PODXLO00592 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PODXLO00592 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PODXLO00592 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PODXLO00592 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PODXLO00592 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PODXLO00592 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PODXLO00592 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PODXLO00592 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PODXLO00592 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PODXLO00592 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PODXLO00592 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PODXLO00592 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PODXLO00592 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PODXLO00592 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PODXLO00592 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PODXLO00592 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PODXLO00592 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PODXLO00592 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms