Protein–RNA interactions for Protein: H7C1W4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1W4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
H7C1W4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
H7C1W4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
H7C1W4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
H7C1W4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
H7C1W4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
H7C1W4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
H7C1W4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
H7C1W4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
H7C1W4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
H7C1W4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
H7C1W4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
H7C1W4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
H7C1W4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
H7C1W4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
H7C1W4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
H7C1W4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
H7C1W4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
H7C1W4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
H7C1W4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
H7C1W4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
H7C1W4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
H7C1W4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
H7C1W4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
H7C1W4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
H7C1W4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
H7C1W4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
H7C1W4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
H7C1W4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
H7C1W4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
H7C1W4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
H7C1W4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
H7C1W4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
H7C1W4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
H7C1W4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
H7C1W4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
H7C1W4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
H7C1W4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
H7C1W4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
H7C1W4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
H7C1W4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
H7C1W4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
H7C1W4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
H7C1W4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
H7C1W4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
H7C1W4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
H7C1W4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
H7C1W4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
H7C1W4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
H7C1W4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
H7C1W4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
H7C1W4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
H7C1W4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
H7C1W4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
H7C1W4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
H7C1W4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
H7C1W4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
H7C1W4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
H7C1W4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
H7C1W4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
H7C1W4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
H7C1W4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
H7C1W4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
H7C1W4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
H7C1W4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
H7C1W4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
H7C1W4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
H7C1W4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
H7C1W4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28■■■□□ 2.07
H7C1W4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
H7C1W4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
H7C1W4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
H7C1W4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
H7C1W4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
H7C1W4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
H7C1W4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
H7C1W4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
H7C1W4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
H7C1W4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
H7C1W4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
H7C1W4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
H7C1W4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
H7C1W4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
H7C1W4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
H7C1W4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
H7C1W4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
H7C1W4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
H7C1W4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
H7C1W4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
H7C1W4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
H7C1W4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
H7C1W4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
H7C1W4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
H7C1W4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
H7C1W4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
H7C1W4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
H7C1W4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
H7C1W4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
H7C1W4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
H7C1W4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms