Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
H3BQV1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
H3BQV1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
H3BQV1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
H3BQV1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
H3BQV1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
H3BQV1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
H3BQV1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
H3BQV1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
H3BQV1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
H3BQV1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
H3BQV1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
H3BQV1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
H3BQV1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
H3BQV1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
H3BQV1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
H3BQV1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
H3BQV1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
H3BQV1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
H3BQV1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
H3BQV1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
H3BQV1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
H3BQV1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
H3BQV1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
H3BQV1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
H3BQV1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
H3BQV1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
H3BQV1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
H3BQV1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
H3BQV1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
H3BQV1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
H3BQV1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
H3BQV1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
H3BQV1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
H3BQV1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
H3BQV1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
H3BQV1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
H3BQV1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
H3BQV1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
H3BQV1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
H3BQV1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
H3BQV1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
H3BQV1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
H3BQV1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
H3BQV1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
H3BQV1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
H3BQV1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
H3BQV1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
H3BQV1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
H3BQV1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
H3BQV1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
H3BQV1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
H3BQV1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
H3BQV1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
H3BQV1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26■■□□□ 1.75
H3BQV1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
H3BQV1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
H3BQV1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
H3BQV1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
H3BQV1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
H3BQV1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
H3BQV1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
H3BQV1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
H3BQV1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
H3BQV1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
H3BQV1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
H3BQV1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
H3BQV1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
H3BQV1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
H3BQV1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
H3BQV1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
H3BQV1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
H3BQV1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
H3BQV1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
H3BQV1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
H3BQV1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
H3BQV1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
H3BQV1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
H3BQV1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
H3BQV1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
H3BQV1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
H3BQV1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
H3BQV1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
H3BQV1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
H3BQV1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
H3BQV1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
H3BQV1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
H3BQV1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
H3BQV1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
H3BQV1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
H3BQV1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
H3BQV1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
H3BQV1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
H3BQV1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
H3BQV1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
H3BQV1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
H3BQV1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
H3BQV1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
H3BQV1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
H3BQV1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms