Protein–RNA interactions for Protein: H0Y7S4

PRAMEF26, Putative PRAME family member 26, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF26H0Y7S4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF26H0Y7S4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF26H0Y7S4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF26H0Y7S4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF26H0Y7S4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF26H0Y7S4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF26H0Y7S4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF26H0Y7S4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF26H0Y7S4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF26H0Y7S4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF26H0Y7S4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF26H0Y7S4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF26H0Y7S4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF26H0Y7S4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF26H0Y7S4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF26H0Y7S4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF26H0Y7S4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF26H0Y7S4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF26H0Y7S4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF26H0Y7S4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF26H0Y7S4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF26H0Y7S4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF26H0Y7S4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF26H0Y7S4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF26H0Y7S4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF26H0Y7S4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF26H0Y7S4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF26H0Y7S4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF26H0Y7S4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF26H0Y7S4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF26H0Y7S4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF26H0Y7S4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF26H0Y7S4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF26H0Y7S4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF26H0Y7S4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEF26H0Y7S4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEF26H0Y7S4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEF26H0Y7S4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEF26H0Y7S4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEF26H0Y7S4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF26H0Y7S4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms