Protein–RNA interactions for Protein: E9PQR5

NPIPB8, Nuclear pore complex-interacting protein family member B8, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB8E9PQR5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPIPB8E9PQR5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPB8E9PQR5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms