Protein–RNA interactions for Protein: B4E1Z4

cDNA FLJ55673, highly similar to Complement factor B (EC 3.4.21.47), humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E1Z4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
B4E1Z4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
B4E1Z4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
B4E1Z4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
B4E1Z4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
B4E1Z4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
B4E1Z4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
B4E1Z4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
B4E1Z4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
B4E1Z4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
B4E1Z4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
B4E1Z4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
B4E1Z4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
B4E1Z4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
B4E1Z4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
B4E1Z4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
B4E1Z4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
B4E1Z4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
B4E1Z4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
B4E1Z4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
B4E1Z4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
B4E1Z4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
B4E1Z4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
B4E1Z4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
B4E1Z4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
B4E1Z4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
B4E1Z4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
B4E1Z4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
B4E1Z4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
B4E1Z4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
B4E1Z4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
B4E1Z4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
B4E1Z4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
B4E1Z4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
B4E1Z4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
B4E1Z4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
B4E1Z4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
B4E1Z4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
B4E1Z4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
B4E1Z4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
B4E1Z4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
B4E1Z4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
B4E1Z4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
B4E1Z4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
B4E1Z4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
B4E1Z4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
B4E1Z4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
B4E1Z4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
B4E1Z4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
B4E1Z4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
B4E1Z4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
B4E1Z4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
B4E1Z4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
B4E1Z4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
B4E1Z4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
B4E1Z4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
B4E1Z4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
B4E1Z4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
B4E1Z4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
B4E1Z4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
B4E1Z4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
B4E1Z4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
B4E1Z4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
B4E1Z4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
B4E1Z4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
B4E1Z4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
B4E1Z4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
B4E1Z4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
B4E1Z4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
B4E1Z4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
B4E1Z4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
B4E1Z4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
B4E1Z4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
B4E1Z4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
B4E1Z4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
B4E1Z4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
B4E1Z4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
B4E1Z4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
B4E1Z4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
B4E1Z4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
B4E1Z4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
B4E1Z4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
B4E1Z4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
B4E1Z4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
B4E1Z4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
B4E1Z4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
B4E1Z4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
B4E1Z4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
B4E1Z4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
B4E1Z4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
B4E1Z4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
B4E1Z4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
B4E1Z4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
B4E1Z4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
B4E1Z4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
B4E1Z4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
B4E1Z4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
B4E1Z4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
B4E1Z4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
B4E1Z4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms