Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HACD1B0YJ81 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
HACD1B0YJ81 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HACD1B0YJ81 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms