Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
A8MVJ9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
A8MVJ9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
A8MVJ9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
A8MVJ9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
A8MVJ9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
A8MVJ9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
A8MVJ9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
A8MVJ9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
A8MVJ9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
A8MVJ9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
A8MVJ9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
A8MVJ9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
A8MVJ9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
A8MVJ9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
A8MVJ9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
A8MVJ9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
A8MVJ9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
A8MVJ9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
A8MVJ9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
A8MVJ9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
A8MVJ9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
A8MVJ9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
A8MVJ9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
A8MVJ9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
A8MVJ9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
A8MVJ9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
A8MVJ9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
A8MVJ9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
A8MVJ9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
A8MVJ9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
A8MVJ9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
A8MVJ9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
A8MVJ9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
A8MVJ9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
A8MVJ9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
A8MVJ9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
A8MVJ9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
A8MVJ9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
A8MVJ9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
A8MVJ9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
A8MVJ9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
A8MVJ9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
A8MVJ9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
A8MVJ9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
A8MVJ9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
A8MVJ9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
A8MVJ9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
A8MVJ9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
A8MVJ9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
A8MVJ9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
A8MVJ9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
A8MVJ9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
A8MVJ9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
A8MVJ9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
A8MVJ9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
A8MVJ9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
A8MVJ9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
A8MVJ9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
A8MVJ9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
A8MVJ9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
A8MVJ9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
A8MVJ9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
A8MVJ9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
A8MVJ9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
A8MVJ9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
A8MVJ9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
A8MVJ9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
A8MVJ9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
A8MVJ9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
A8MVJ9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
A8MVJ9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
A8MVJ9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
A8MVJ9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
A8MVJ9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
A8MVJ9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
A8MVJ9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
A8MVJ9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
A8MVJ9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
A8MVJ9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
A8MVJ9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
A8MVJ9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
A8MVJ9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
A8MVJ9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
A8MVJ9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
A8MVJ9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
A8MVJ9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
A8MVJ9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
A8MVJ9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
A8MVJ9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
A8MVJ9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
A8MVJ9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
A8MVJ9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
A8MVJ9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
A8MVJ9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
A8MVJ9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
A8MVJ9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
A8MVJ9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
A8MVJ9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
A8MVJ9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms