Protein–RNA interactions for Protein: A8K0S8

MEIS3P2, Putative homeobox protein Meis3-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P2A8K0S8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEIS3P2A8K0S8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MEIS3P2A8K0S8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MEIS3P2A8K0S8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms