Protein–RNA interactions for Protein: A6NLX3

SPDYE4, Speedy protein E4, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE4A6NLX3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SPDYE4A6NLX3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPDYE4A6NLX3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPDYE4A6NLX3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPDYE4A6NLX3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPDYE4A6NLX3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPDYE4A6NLX3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPDYE4A6NLX3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPDYE4A6NLX3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPDYE4A6NLX3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SPDYE4A6NLX3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPDYE4A6NLX3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPDYE4A6NLX3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPDYE4A6NLX3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPDYE4A6NLX3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPDYE4A6NLX3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPDYE4A6NLX3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPDYE4A6NLX3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPDYE4A6NLX3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPDYE4A6NLX3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPDYE4A6NLX3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPDYE4A6NLX3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPDYE4A6NLX3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPDYE4A6NLX3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPDYE4A6NLX3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SPDYE4A6NLX3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPDYE4A6NLX3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPDYE4A6NLX3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPDYE4A6NLX3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPDYE4A6NLX3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPDYE4A6NLX3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SPDYE4A6NLX3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPDYE4A6NLX3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPDYE4A6NLX3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPDYE4A6NLX3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPDYE4A6NLX3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPDYE4A6NLX3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms