Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SDR42E2A6NKP2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDR42E2A6NKP2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms