Protein–RNA interactions for Protein: A6NGU7

LINC01546, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01546, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01546A6NGU7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01546A6NGU7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01546A6NGU7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01546A6NGU7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01546A6NGU7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01546A6NGU7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01546A6NGU7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01546A6NGU7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01546A6NGU7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01546A6NGU7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01546A6NGU7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01546A6NGU7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01546A6NGU7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01546A6NGU7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01546A6NGU7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01546A6NGU7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01546A6NGU7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01546A6NGU7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01546A6NGU7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01546A6NGU7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01546A6NGU7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01546A6NGU7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01546A6NGU7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01546A6NGU7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01546A6NGU7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01546A6NGU7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01546A6NGU7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01546A6NGU7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01546A6NGU7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01546A6NGU7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01546A6NGU7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01546A6NGU7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01546A6NGU7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01546A6NGU7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01546A6NGU7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01546A6NGU7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01546A6NGU7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01546A6NGU7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01546A6NGU7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01546A6NGU7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01546A6NGU7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01546A6NGU7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01546A6NGU7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01546A6NGU7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01546A6NGU7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01546A6NGU7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01546A6NGU7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01546A6NGU7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01546A6NGU7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01546A6NGU7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01546A6NGU7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01546A6NGU7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01546A6NGU7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01546A6NGU7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01546A6NGU7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01546A6NGU7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01546A6NGU7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01546A6NGU7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01546A6NGU7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01546A6NGU7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01546A6NGU7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01546A6NGU7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01546A6NGU7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01546A6NGU7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01546A6NGU7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01546A6NGU7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01546A6NGU7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01546A6NGU7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01546A6NGU7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01546A6NGU7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01546A6NGU7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01546A6NGU7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01546A6NGU7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01546A6NGU7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01546A6NGU7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01546A6NGU7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01546A6NGU7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01546A6NGU7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01546A6NGU7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01546A6NGU7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01546A6NGU7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01546A6NGU7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01546A6NGU7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01546A6NGU7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01546A6NGU7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01546A6NGU7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01546A6NGU7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01546A6NGU7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01546A6NGU7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01546A6NGU7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01546A6NGU7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01546A6NGU7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01546A6NGU7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01546A6NGU7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01546A6NGU7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01546A6NGU7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01546A6NGU7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01546A6NGU7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01546A6NGU7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01546A6NGU7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms