Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN8

Putative ubiquitin-like protein FUBI-like protein ENSP00000310146, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NDN8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A6NDN8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A6NDN8 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A6NDN8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A6NDN8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A6NDN8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A6NDN8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A6NDN8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A6NDN8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A6NDN8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A6NDN8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
A6NDN8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A6NDN8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
A6NDN8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
A6NDN8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A6NDN8 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A6NDN8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
A6NDN8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
A6NDN8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A6NDN8 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A6NDN8 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A6NDN8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A6NDN8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
A6NDN8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
A6NDN8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A6NDN8 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
A6NDN8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A6NDN8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A6NDN8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A6NDN8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A6NDN8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A6NDN8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
A6NDN8 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A6NDN8 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A6NDN8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
A6NDN8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
A6NDN8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A6NDN8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
A6NDN8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A6NDN8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A6NDN8 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A6NDN8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
A6NDN8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A6NDN8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A6NDN8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A6NDN8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A6NDN8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A6NDN8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A6NDN8 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A6NDN8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A6NDN8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A6NDN8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A6NDN8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A6NDN8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A6NDN8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A6NDN8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A6NDN8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A6NDN8 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A6NDN8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A6NDN8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A6NDN8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
A6NDN8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A6NDN8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A6NDN8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A6NDN8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A6NDN8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A6NDN8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A6NDN8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A6NDN8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A6NDN8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
A6NDN8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A6NDN8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A6NDN8 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
A6NDN8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
A6NDN8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A6NDN8 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A6NDN8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A6NDN8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A6NDN8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
A6NDN8 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NDN8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NDN8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NDN8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NDN8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NDN8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NDN8 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NDN8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NDN8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NDN8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NDN8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NDN8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NDN8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NDN8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NDN8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NDN8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NDN8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A6NDN8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NDN8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NDN8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A6NDN8 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms