Protein–RNA interactions for Protein: A6NDG6

PGP, Glycerol-3-phosphate phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPA6NDG6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGPA6NDG6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGPA6NDG6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGPA6NDG6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGPA6NDG6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGPA6NDG6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGPA6NDG6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGPA6NDG6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGPA6NDG6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGPA6NDG6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGPA6NDG6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGPA6NDG6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGPA6NDG6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGPA6NDG6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PGPA6NDG6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGPA6NDG6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGPA6NDG6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGPA6NDG6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGPA6NDG6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms