Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN9

TRAPPC13, Trafficking protein particle complex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13A5PLN9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC13A5PLN9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC13A5PLN9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms