Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
POTEFA5A3E0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POTEFA5A3E0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
POTEFA5A3E0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POTEFA5A3E0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POTEFA5A3E0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POTEFA5A3E0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POTEFA5A3E0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
POTEFA5A3E0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POTEFA5A3E0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POTEFA5A3E0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POTEFA5A3E0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
POTEFA5A3E0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POTEFA5A3E0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POTEFA5A3E0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POTEFA5A3E0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POTEFA5A3E0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POTEFA5A3E0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POTEFA5A3E0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POTEFA5A3E0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POTEFA5A3E0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POTEFA5A3E0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POTEFA5A3E0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POTEFA5A3E0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POTEFA5A3E0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POTEFA5A3E0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POTEFA5A3E0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POTEFA5A3E0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POTEFA5A3E0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POTEFA5A3E0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POTEFA5A3E0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
POTEFA5A3E0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POTEFA5A3E0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POTEFA5A3E0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POTEFA5A3E0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POTEFA5A3E0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POTEFA5A3E0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POTEFA5A3E0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POTEFA5A3E0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POTEFA5A3E0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POTEFA5A3E0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POTEFA5A3E0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms