Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVM2

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GVM2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1B0GVM2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1B0GVM2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1B0GVM2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1B0GVM2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1B0GVM2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1B0GVM2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1B0GVM2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1B0GVM2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1B0GVM2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1B0GVM2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1B0GVM2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1B0GVM2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1B0GVM2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1B0GVM2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1B0GVM2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1B0GVM2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1B0GVM2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1B0GVM2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1B0GVM2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1B0GVM2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1B0GVM2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1B0GVM2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1B0GVM2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1B0GVM2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1B0GVM2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1B0GVM2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A1B0GVM2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A1B0GVM2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A1B0GVM2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A1B0GVM2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A1B0GVM2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A1B0GVM2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A1B0GVM2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A1B0GVM2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms