Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GTW7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GTW7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A1B0GTW7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A1B0GTW7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A1B0GTW7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1B0GTW7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1B0GTW7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1B0GTW7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1B0GTW7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1B0GTW7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1B0GTW7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1B0GTW7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1B0GTW7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1B0GTW7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1B0GTW7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1B0GTW7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1B0GTW7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1B0GTW7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1B0GTW7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1B0GTW7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1B0GTW7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1B0GTW7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1B0GTW7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1B0GTW7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1B0GTW7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1B0GTW7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1B0GTW7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1B0GTW7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1B0GTW7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
A0A1B0GTW7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
A0A1B0GTW7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1B0GTW7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1B0GTW7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1B0GTW7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1B0GTW7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1B0GTW7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1B0GTW7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1B0GTW7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1B0GTW7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1B0GTW7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1B0GTW7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1B0GTW7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1B0GTW7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1B0GTW7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1B0GTW7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1B0GTW7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1B0GTW7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1B0GTW7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1B0GTW7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1B0GTW7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1B0GTW7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1B0GTW7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1B0GTW7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1B0GTW7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1B0GTW7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1B0GTW7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1B0GTW7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1B0GTW7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1B0GTW7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1B0GTW7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1B0GTW7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1B0GTW7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1B0GTW7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1B0GTW7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A1B0GTW7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1B0GTW7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1B0GTW7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1B0GTW7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1B0GTW7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1B0GTW7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1B0GTW7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1B0GTW7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1B0GTW7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1B0GTW7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A1B0GTW7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1B0GTW7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1B0GTW7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1B0GTW7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1B0GTW7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1B0GTW7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1B0GTW7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1B0GTW7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1B0GTW7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A1B0GTW7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A1B0GTW7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms