Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0U1RQF3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0U1RQF3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms