Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B9

SUPT16H, FACT complex subunit SPT16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT16HQ9Y5B9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
SUPT16HQ9Y5B9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
SUPT16HQ9Y5B9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
SUPT16HQ9Y5B9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
SUPT16HQ9Y5B9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
SUPT16HQ9Y5B9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
SUPT16HQ9Y5B9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC37.09■■■■□ 3.53
SUPT16HQ9Y5B9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
SUPT16HQ9Y5B9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC37.07■■■■□ 3.53
SUPT16HQ9Y5B9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SUPT16HQ9Y5B9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SUPT16HQ9Y5B9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SUPT16HQ9Y5B9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SUPT16HQ9Y5B9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
SUPT16HQ9Y5B9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
SUPT16HQ9Y5B9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
SUPT16HQ9Y5B9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
SUPT16HQ9Y5B9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SUPT16HQ9Y5B9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
SUPT16HQ9Y5B9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
SUPT16HQ9Y5B9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
SUPT16HQ9Y5B9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
SUPT16HQ9Y5B9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
SUPT16HQ9Y5B9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
SUPT16HQ9Y5B9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
SUPT16HQ9Y5B9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
SUPT16HQ9Y5B9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
SUPT16HQ9Y5B9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
SUPT16HQ9Y5B9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
SUPT16HQ9Y5B9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
SUPT16HQ9Y5B9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SUPT16HQ9Y5B9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC36.87■■■■□ 3.49
SUPT16HQ9Y5B9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
SUPT16HQ9Y5B9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
SUPT16HQ9Y5B9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
SUPT16HQ9Y5B9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
SUPT16HQ9Y5B9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SUPT16HQ9Y5B9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
SUPT16HQ9Y5B9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
SUPT16HQ9Y5B9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
SUPT16HQ9Y5B9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SUPT16HQ9Y5B9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SUPT16HQ9Y5B9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
SUPT16HQ9Y5B9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SUPT16HQ9Y5B9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
SUPT16HQ9Y5B9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SUPT16HQ9Y5B9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SUPT16HQ9Y5B9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
SUPT16HQ9Y5B9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
SUPT16HQ9Y5B9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
SUPT16HQ9Y5B9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SUPT16HQ9Y5B9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SUPT16HQ9Y5B9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SUPT16HQ9Y5B9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
SUPT16HQ9Y5B9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
SUPT16HQ9Y5B9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
SUPT16HQ9Y5B9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SUPT16HQ9Y5B9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SUPT16HQ9Y5B9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
SUPT16HQ9Y5B9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
SUPT16HQ9Y5B9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
SUPT16HQ9Y5B9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
SUPT16HQ9Y5B9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
SUPT16HQ9Y5B9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SUPT16HQ9Y5B9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
SUPT16HQ9Y5B9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
SUPT16HQ9Y5B9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SUPT16HQ9Y5B9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SUPT16HQ9Y5B9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SUPT16HQ9Y5B9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SUPT16HQ9Y5B9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SUPT16HQ9Y5B9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SUPT16HQ9Y5B9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SUPT16HQ9Y5B9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SUPT16HQ9Y5B9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SUPT16HQ9Y5B9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SUPT16HQ9Y5B9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.42
SUPT16HQ9Y5B9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
SUPT16HQ9Y5B9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SUPT16HQ9Y5B9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
SUPT16HQ9Y5B9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SUPT16HQ9Y5B9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SUPT16HQ9Y5B9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SUPT16HQ9Y5B9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SUPT16HQ9Y5B9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SUPT16HQ9Y5B9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SUPT16HQ9Y5B9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SUPT16HQ9Y5B9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SUPT16HQ9Y5B9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
SUPT16HQ9Y5B9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
SUPT16HQ9Y5B9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
SUPT16HQ9Y5B9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SUPT16HQ9Y5B9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SUPT16HQ9Y5B9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SUPT16HQ9Y5B9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SUPT16HQ9Y5B9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
SUPT16HQ9Y5B9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
SUPT16HQ9Y5B9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SUPT16HQ9Y5B9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SUPT16HQ9Y5B9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms