Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 SEC31A-220ENST00000507051 458 ntTSL 411.46□□□□□ -0.571e-25■■■■■ 104.8
AATFQ9NY61 THAP9-AS1-204ENST00000504792 2577 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.681e-25■■■■■ 104.8
AATFQ9NY61 THAP9-AS1-210ENST00000511271 516 ntTSL 210.5□□□□□ -0.731e-25■■■■■ 104.8
AATFQ9NY61 SEC31A-222ENST00000507676 551 ntTSL 49.05□□□□□ -0.961e-25■■■■■ 104.8
AATFQ9NY61 THAP9-AS1-211ENST00000512932 971 ntTSL 28.57□□□□□ -1.041e-25■■■■■ 104.8
AATFQ9NY61 SEC31A-211ENST00000503210 553 ntTSL 48.49□□□□□ -1.051e-25■■■■■ 104.8
AATFQ9NY61 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.431e-25■■■■■ 104.8
AATFQ9NY61 STXBP2-210ENST00000595950 552 ntTSL 527.51■■□□□ 1.993e-10■■■■■ 104.3
AATFQ9NY61 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.263e-10■■■■■ 104.3
AATFQ9NY61 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.173e-10■■■■■ 104.3
AATFQ9NY61 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.123e-10■■■■■ 104.3
AATFQ9NY61 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.833e-10■■■■■ 104.3
AATFQ9NY61 AC008763.2-201ENST00000598664 537 ntAPPRIS P5 TSL 518.83■□□□□ 0.63e-10■■■■■ 104.3
AATFQ9NY61 STXBP2-211ENST00000597068 1785 ntTSL 1 (best)18.38■□□□□ 0.533e-10■■■■■ 104.3
AATFQ9NY61 STXBP2-217ENST00000599737 1523 ntTSL 517.77■□□□□ 0.433e-10■■■■■ 104.3
AATFQ9NY61 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.383e-10■■■■■ 104.3
AATFQ9NY61 STXBP2-204ENST00000593535 549 ntTSL 415.98■□□□□ 0.153e-10■■■■■ 104.3
AATFQ9NY61 GAS5-229ENST00000458220 469 ntTSL 24.09□□□□□ -1.752e-46■■■■■ 101.4
AATFQ9NY61 EHMT1-252ENST00000640639 1259 ntTSL 517.42■□□□□ 0.382e-8■■■■■ 98.4
AATFQ9NY61 EHMT1-205ENST00000462942 7842 ntTSL 211.64□□□□□ -0.552e-8■■■■■ 98.4
AATFQ9NY61 EHMT1-206ENST00000465566 503 ntTSL 39.51□□□□□ -0.892e-8■■■■■ 98.4
AATFQ9NY61 STXBP2-207ENST00000595181 632 ntTSL 213.1□□□□□ -0.311e-13■■■■■ 97
AATFQ9NY61 PID1-206ENST00000534952 553 ntTSL 416.48■□□□□ 0.239e-22■■■■■ 96.8
AATFQ9NY61 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.049e-22■■■■■ 96.8
AATFQ9NY61 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.089e-22■■■■■ 96.8
AATFQ9NY61 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.089e-22■■■■■ 96.8
AATFQ9NY61 PID1-201ENST00000354069 839 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.819e-22■■■■■ 96.8
AATFQ9NY61 PID1-205ENST00000482518 479 ntTSL 25.46□□□□□ -1.549e-22■■■■■ 96.8
AATFQ9NY61 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.532e-9■■■■■ 95.5
AATFQ9NY61 SLCO5A1-204ENST00000526750 2650 ntTSL 524.32■■□□□ 1.485e-11■■■■■ 91.9
AATFQ9NY61 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.755e-11■■■■■ 91.9
AATFQ9NY61 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.465e-11■■■■■ 91.9
AATFQ9NY61 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.265e-11■■■■■ 91.9
AATFQ9NY61 GAS5-204ENST00000421068 1060 ntTSL 25.1□□□□□ -1.591e-46■■■■■ 91.8
AATFQ9NY61 ULK1-204ENST00000540647 1211 ntTSL 224.13■■□□□ 1.459e-10■■■■■ 91.2
AATFQ9NY61 RPTOR-209ENST00000575542 5536 ntTSL 1 (best)17.42■□□□□ 0.389e-10■■■■■ 91.2
AATFQ9NY61 RN7SKP290-201ENST00000606842 195 ntBASIC11.17□□□□□ -0.629e-10■■■■■ 91.2
AATFQ9NY61 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.522e-6■■■■■ 90.6
AATFQ9NY61 COX7C-204ENST00000510447 581 ntTSL 313.13□□□□□ -0.312e-8■■■■■ 90.6
AATFQ9NY61 COX7C-201ENST00000247655 666 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.462e-8■■■■■ 90.6
AATFQ9NY61 COX7C-207ENST00000515763 347 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC12.17□□□□□ -0.462e-8■■■■■ 90.6
AATFQ9NY61 COX7C-203ENST00000509578 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.882e-8■■■■■ 90.6
AATFQ9NY61 COX7C-206ENST00000513124 693 ntTSL 55.7□□□□□ -1.52e-8■■■■■ 90.6
AATFQ9NY61 COX7C-202ENST00000505430 496 ntTSL 33.35□□□□□ -1.872e-8■■■■■ 90.6
AATFQ9NY61 COX7C-205ENST00000511472 369 ntTSL 22.69□□□□□ -1.982e-8■■■■■ 90.6
AATFQ9NY61 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.72e-8■■■■■ 90.6
AATFQ9NY61 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.892e-10■■■■■ 89.9
AATFQ9NY61 FN1-201ENST00000323926 8708 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.22e-10■■■■■ 89.9
AATFQ9NY61 FN1-202ENST00000336916 8435 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.232e-10■■■■■ 89.9
AATFQ9NY61 FN1-206ENST00000359671 8524 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.282e-10■■■■■ 89.9
AATFQ9NY61 FN1-212ENST00000446046 7952 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.312e-10■■■■■ 89.9
AATFQ9NY61 FN1-204ENST00000356005 7846 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.382e-10■■■■■ 89.9
AATFQ9NY61 FN1-211ENST00000443816 7762 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.382e-10■■■■■ 89.9
AATFQ9NY61 FN1-205ENST00000357867 7898 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.422e-10■■■■■ 89.9
AATFQ9NY61 FN1-207ENST00000421182 8103 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.422e-10■■■■■ 89.9
AATFQ9NY61 FN1-203ENST00000354785 8905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.432e-10■■■■■ 89.9
AATFQ9NY61 FN1-209ENST00000432072 7759 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.62e-10■■■■■ 89.9
AATFQ9NY61 CCAR1-218ENST00000630771 4540 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.951e-323■■■■■ 89.6
AATFQ9NY61 CCAR1-207ENST00000536012 2447 ntTSL 1 (best)8.02□□□□□ -1.131e-323■■■■■ 89.6
AATFQ9NY61 CCAR1-214ENST00000543225 2407 ntTSL 1 (best)7.43□□□□□ -1.221e-323■■■■■ 89.6
AATFQ9NY61 CCAR1-213ENST00000541012 2432 ntTSL 1 (best)7.37□□□□□ -1.231e-323■■■■■ 89.6
AATFQ9NY61 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.231e-323■■■■■ 89.6
AATFQ9NY61 CCAR1-205ENST00000483264 487 ntTSL 57.17□□□□□ -1.261e-323■■■■■ 89.6
AATFQ9NY61 CCAR1-215ENST00000543229 2475 ntTSL 26.86□□□□□ -1.311e-323■■■■■ 89.6
AATFQ9NY61 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.371e-323■■■■■ 89.6
AATFQ9NY61 CCAR1-211ENST00000539539 3224 ntTSL 24.95□□□□□ -1.621e-323■■■■■ 89.6
AATFQ9NY61 CCAR1-212ENST00000540210 3415 ntTSL 1 (best)4.66□□□□□ -1.661e-323■■■■■ 89.6
AATFQ9NY61 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC1.71□□□□□ -2.141e-323■■■■■ 89.6
AATFQ9NY61 GAK-217ENST00000511980 1768 ntTSL 520.43■□□□□ 0.861e-10■■■■■ 89.4
AATFQ9NY61 GAK-213ENST00000510799 763 ntTSL 1 (best)17.42■□□□□ 0.381e-10■■■■■ 89.4
AATFQ9NY61 GAK-211ENST00000509566 3126 ntTSL 217.02■□□□□ 0.311e-10■■■■■ 89.4
AATFQ9NY61 GAK-221ENST00000515868 3903 ntTSL 213.48□□□□□ -0.251e-10■■■■■ 89.4
AATFQ9NY61 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.326e-7■■■■■ 89.2
AATFQ9NY61 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.36e-7■■■■■ 89.2
AATFQ9NY61 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.286e-7■■■■■ 89.2
AATFQ9NY61 TFDP1-203ENST00000453989 792 ntTSL 329.14■■■□□ 2.263e-10■■■■■ 88.6
AATFQ9NY61 TFDP1-202ENST00000408980 866 ntTSL 528.04■■■□□ 2.083e-10■■■■■ 88.6
AATFQ9NY61 TFDP1-208ENST00000544902 1571 ntTSL 226.97■■□□□ 1.913e-10■■■■■ 88.6
AATFQ9NY61 TFDP1-206ENST00000475254 804 ntTSL 322.84■■□□□ 1.253e-10■■■■■ 88.6
AATFQ9NY61 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.263e-10■■■■■ 88.6
AATFQ9NY61 TFDP1-205ENST00000465174 955 ntTSL 316.58■□□□□ 0.243e-10■■■■■ 88.6
AATFQ9NY61 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.844e-10■■■■■ 87.1
AATFQ9NY61 AHRR-210ENST00000514523 563 ntTSL 421.73■■□□□ 1.073e-7■■■■■ 86.7
AATFQ9NY61 AHRR-206ENST00000510400 576 ntTSL 419.43■□□□□ 0.73e-7■■■■■ 86.7
AATFQ9NY61 TMEM14B-203ENST00000460341 565 ntTSL 419.52■□□□□ 0.722e-12■■■■■ 86
AATFQ9NY61 TMEM14B-206ENST00000463448 1589 ntTSL 1 (best)18.22■□□□□ 0.512e-12■■■■■ 86
AATFQ9NY61 TMEM14B-209ENST00000473166 752 ntTSL 317.94■□□□□ 0.462e-12■■■■■ 86
AATFQ9NY61 TMEM14B-213ENST00000478732 344 ntTSL 515.13■□□□□ 0.012e-12■■■■■ 86
AATFQ9NY61 TMEM14B-211ENST00000473807 559 ntTSL 415.11■□□□□ 0.012e-12■■■■■ 86
AATFQ9NY61 TMEM14B-205ENST00000463100 502 ntTSL 413.09□□□□□ -0.312e-12■■■■■ 86
AATFQ9NY61 TMEM14B-207ENST00000467229 483 ntTSL 37.9□□□□□ -1.142e-12■■■■■ 86
AATFQ9NY61 TMEM14B-217ENST00000489137 374 ntTSL 35.34□□□□□ -1.552e-12■■■■■ 86
AATFQ9NY61 NOP58-208ENST00000488403 871 ntTSL 217.79■□□□□ 0.441e-323■■■■■ 85.5
AATFQ9NY61 NOP58-202ENST00000426814 655 ntTSL 217.74■□□□□ 0.431e-323■■■■■ 85.5
AATFQ9NY61 NOP58-205ENST00000472050 582 ntTSL 313.83□□□□□ -0.21e-323■■■■■ 85.5
AATFQ9NY61 NOP58-204ENST00000467734 638 ntTSL 513.76□□□□□ -0.211e-323■■■■■ 85.5
AATFQ9NY61 NOP58-209ENST00000492688 571 ntTSL 44.41□□□□□ -1.71e-323■■■■■ 85.5
AATFQ9NY61 AHSG-203ENST00000478441 1269 ntTSL 216.12■□□□□ 0.174e-9■■■■■ 85.4
AATFQ9NY61 AHSG-202ENST00000411641 1711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.414e-9■■■■■ 85.4
AATFQ9NY61 AHSG-201ENST00000273784 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.454e-9■■■■■ 85.4
Retrieved 100 of 5,565 protein–RNA pairs in 62.4 ms