Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW3

APOBEC3C, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3C, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3CQ9NRW3 MED24-204ENST00000394128 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.673e-13■■■■■ 29.1
APOBEC3CQ9NRW3 RFC4-207ENST00000433496 1111 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.713e-13■■■■■ 29.1
APOBEC3CQ9NRW3 MED24-202ENST00000394126 3896 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.733e-13■■■■■ 29.1
APOBEC3CQ9NRW3 MED24-203ENST00000394127 3456 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.743e-13■■■■■ 29.1
APOBEC3CQ9NRW3 MED24-201ENST00000356271 3446 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.743e-13■■■■■ 29.1
APOBEC3CQ9NRW3 MED24-234ENST00000614384 454 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.943e-13■■■■■ 29.1
APOBEC3CQ9NRW3 RFC4-212ENST00000479307 1043 ntTSL 24.15□□□□□ -1.753e-13■■■■■ 29.1
APOBEC3CQ9NRW3 RFC4-204ENST00000417876 479 ntTSL 23.83□□□□□ -1.83e-13■■■■■ 29.1
APOBEC3CQ9NRW3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.518e-24■■■■■ 29.1
APOBEC3CQ9NRW3 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.113e-10■■■■■ 28.9
APOBEC3CQ9NRW3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.386e-10■■■■■ 28.6
APOBEC3CQ9NRW3 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.086e-10■■■■■ 28.6
APOBEC3CQ9NRW3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.092e-8■■■■■ 28.5
APOBEC3CQ9NRW3 EIPR1-204ENST00000435721 672 ntTSL 320.67■□□□□ 0.92e-8■■■■■ 28.5
APOBEC3CQ9NRW3 EIPR1-203ENST00000406835 738 ntTSL 520.67■□□□□ 0.92e-8■■■■■ 28.5
APOBEC3CQ9NRW3 EIPR1-207ENST00000444776 594 ntTSL 419.14■□□□□ 0.652e-8■■■■■ 28.5
APOBEC3CQ9NRW3 EIPR1-205ENST00000441271 647 ntTSL 518.76■□□□□ 0.592e-8■■■■■ 28.5
APOBEC3CQ9NRW3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.572e-8■■■■■ 28.5
APOBEC3CQ9NRW3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.352e-8■■■■■ 28.5
APOBEC3CQ9NRW3 EIPR1-212ENST00000478754 2932 ntTSL 515.87■□□□□ 0.132e-8■■■■■ 28.5
APOBEC3CQ9NRW3 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.022e-8■■■■■ 28.5
APOBEC3CQ9NRW3 PCNA-201ENST00000379143 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.352e-8■■■■■ 28.5
APOBEC3CQ9NRW3 EIPR1-208ENST00000455162 847 ntTSL 511.09□□□□□ -0.632e-8■■■■■ 28.5
APOBEC3CQ9NRW3 EIPR1-210ENST00000463662 757 ntTSL 39.6□□□□□ -0.872e-8■■■■■ 28.5
APOBEC3CQ9NRW3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.376e-7■■■■■ 28.3
APOBEC3CQ9NRW3 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.166e-7■■■■■ 28.3
APOBEC3CQ9NRW3 FAM178B-202ENST00000470789 722 ntTSL 1 (best)12.32□□□□□ -0.446e-7■■■■■ 28.3
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.336e-13■■■■■ 28.3
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFB7-202ENST00000593353 529 ntTSL 217.14■□□□□ 0.336e-13■■■■■ 28.3
APOBEC3CQ9NRW3 WDR43-202ENST00000407426 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.498e-7■■■■■ 27.9
APOBEC3CQ9NRW3 WDR43-205ENST00000446643 579 ntTSL 48.67□□□□□ -1.028e-7■■■■■ 27.9
APOBEC3CQ9NRW3 HSBP1-202ENST00000567382 889 ntTSL 226.81■■□□□ 1.883e-6■■■■■ 27.7
APOBEC3CQ9NRW3 HSBP1-204ENST00000570259 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.333e-6■■■■■ 27.7
APOBEC3CQ9NRW3 HSBP1-201ENST00000433866 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.643e-6■■■■■ 27.7
APOBEC3CQ9NRW3 HSBP1-203ENST00000569301 551 ntTSL 25.15□□□□□ -1.593e-6■■■■■ 27.7
APOBEC3CQ9NRW3 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.214e-8■■■■■ 27.6
APOBEC3CQ9NRW3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.429e-7■■■■■ 27.5
APOBEC3CQ9NRW3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.359e-7■■■■■ 27.5
APOBEC3CQ9NRW3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.089e-7■■■■■ 27.5
APOBEC3CQ9NRW3 ADARB1-212ENST00000496664 5033 ntTSL 1 (best)21.82■■□□□ 1.089e-7■■■■■ 27.5
APOBEC3CQ9NRW3 ADARB1-203ENST00000389861 5031 ntTSL 1 (best)21.82■■□□□ 1.089e-7■■■■■ 27.5
APOBEC3CQ9NRW3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.069e-7■■■■■ 27.5
APOBEC3CQ9NRW3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.979e-7■■■■■ 27.5
APOBEC3CQ9NRW3 ADARB1-211ENST00000492414 4913 ntTSL 1 (best)20.87■□□□□ 0.939e-7■■■■■ 27.5
APOBEC3CQ9NRW3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.939e-7■■■■■ 27.5
APOBEC3CQ9NRW3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.89e-7■■■■■ 27.5
APOBEC3CQ9NRW3 HBA2-203ENST00000482565 640 ntTSL 1 (best)19.42■□□□□ 0.79e-7■■■■■ 27.5
APOBEC3CQ9NRW3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.699e-7■■■■■ 27.5
APOBEC3CQ9NRW3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.669e-7■■■■■ 27.5
APOBEC3CQ9NRW3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.479e-7■■■■■ 27.5
APOBEC3CQ9NRW3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.49e-7■■■■■ 27.5
APOBEC3CQ9NRW3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.49e-7■■■■■ 27.5
APOBEC3CQ9NRW3 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.399e-7■■■■■ 27.5
APOBEC3CQ9NRW3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.289e-7■■■■■ 27.5
APOBEC3CQ9NRW3 IGF2R-203ENST00000475584 597 ntTSL 316.61■□□□□ 0.259e-7■■■■■ 27.5
APOBEC3CQ9NRW3 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.29e-7■■■■■ 27.5
APOBEC3CQ9NRW3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.069e-7■■■■■ 27.5
APOBEC3CQ9NRW3 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.039e-7■■■■■ 27.5
APOBEC3CQ9NRW3 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.039e-7■■■■■ 27.5
APOBEC3CQ9NRW3 PDCD5-201ENST00000221784 558 ntTSL 315.24■□□□□ 0.039e-7■■■■■ 27.5
APOBEC3CQ9NRW3 AC078923.1-201ENST00000552856 748 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.199e-7■■■■■ 27.5
APOBEC3CQ9NRW3 ADARB1-214ENST00000629643 4583 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.349e-7■■■■■ 27.5
APOBEC3CQ9NRW3 HBA2-202ENST00000397806 513 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.419e-7■■■■■ 27.5
APOBEC3CQ9NRW3 PDIA6-204ENST00000404824 2236 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.459e-7■■■■■ 27.5
APOBEC3CQ9NRW3 PDIA6-208ENST00000617249 2344 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.599e-7■■■■■ 27.5
APOBEC3CQ9NRW3 PDIA6-202ENST00000381611 2534 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.849e-7■■■■■ 27.5
APOBEC3CQ9NRW3 PDIA6-203ENST00000404371 2682 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.869e-7■■■■■ 27.5
APOBEC3CQ9NRW3 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.349e-7■■■■■ 27.5
APOBEC3CQ9NRW3 PDCD5-205ENST00000586316 480 ntTSL 23.7□□□□□ -1.829e-7■■■■■ 27.5
APOBEC3CQ9NRW3 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.144e-9■■■■■ 27.4
APOBEC3CQ9NRW3 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.024e-9■■■■■ 27.4
APOBEC3CQ9NRW3 PHB-206ENST00000504124 796 ntTSL 513.86□□□□□ -0.194e-9■■■■■ 27.4
APOBEC3CQ9NRW3 PHB-214ENST00000614445 1952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.34e-9■■■■■ 27.4
APOBEC3CQ9NRW3 PHB-215ENST00000617874 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.354e-9■■■■■ 27.4
APOBEC3CQ9NRW3 PHB-202ENST00000393345 847 ntTSL 211.75□□□□□ -0.534e-9■■■■■ 27.4
APOBEC3CQ9NRW3 PHB-213ENST00000513412 650 ntTSL 211.46□□□□□ -0.574e-9■■■■■ 27.4
APOBEC3CQ9NRW3 PHB-207ENST00000506273 431 ntTSL 511.19□□□□□ -0.624e-9■■■■■ 27.4
APOBEC3CQ9NRW3 PHB-204ENST00000434917 534 ntTSL 410.94□□□□□ -0.664e-9■■■■■ 27.4
APOBEC3CQ9NRW3 PHB-203ENST00000419140 907 ntTSL 510.4□□□□□ -0.744e-9■■■■■ 27.4
APOBEC3CQ9NRW3 PHB-205ENST00000446735 732 ntTSL 510.2□□□□□ -0.784e-9■■■■■ 27.4
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPA1-214ENST00000551803 372 ntTSL 33.31□□□□□ -1.888e-15■■■■■ 27.2
APOBEC3CQ9NRW3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.543e-22■■■■■ 27.2
APOBEC3CQ9NRW3 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.082e-7■■■■■ 27.1
APOBEC3CQ9NRW3 SRSF5-201ENST00000394366 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.222e-7■■■■■ 27.1
APOBEC3CQ9NRW3 SRSF5-215ENST00000556587 1863 ntTSL 1 (best)12.78□□□□□ -0.362e-7■■■■■ 27.1
APOBEC3CQ9NRW3 SRSF5-205ENST00000553635 1412 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.452e-7■■■■■ 27.1
APOBEC3CQ9NRW3 SRSF5-217ENST00000557154 1500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.652e-7■■■■■ 27.1
APOBEC3CQ9NRW3 SRSF5-216ENST00000556647 644 ntTSL 210.92□□□□□ -0.662e-7■■■■■ 27.1
APOBEC3CQ9NRW3 SRSF5-208ENST00000554929 947 ntTSL 210.92□□□□□ -0.662e-7■■■■■ 27.1
APOBEC3CQ9NRW3 SRSF5-207ENST00000554465 3044 ntTSL 1 (best)8.46□□□□□ -1.062e-7■■■■■ 27.1
APOBEC3CQ9NRW3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.627e-8■■■■■ 27.1
APOBEC3CQ9NRW3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.67e-8■■■■■ 27.1
APOBEC3CQ9NRW3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.31e-8■■■■■ 27
APOBEC3CQ9NRW3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.061e-8■■■■■ 27
APOBEC3CQ9NRW3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.061e-8■■■■■ 27
APOBEC3CQ9NRW3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.941e-8■■■■■ 27
APOBEC3CQ9NRW3 RHOC-210ENST00000425265 866 ntTSL 320.9■□□□□ 0.941e-8■■■■■ 27
APOBEC3CQ9NRW3 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.231e-8■■■■■ 27
APOBEC3CQ9NRW3 RHOC-212ENST00000468093 1042 ntTSL 316.43■□□□□ 0.221e-8■■■■■ 27
APOBEC3CQ9NRW3 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.21e-8■■■■■ 27
Retrieved 100 of 4,302 protein–RNA pairs in 208.8 ms