Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ6

PRM3, Protamine-3, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM3Q9NNZ6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRM3Q9NNZ6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRM3Q9NNZ6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRM3Q9NNZ6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRM3Q9NNZ6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRM3Q9NNZ6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRM3Q9NNZ6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRM3Q9NNZ6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRM3Q9NNZ6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRM3Q9NNZ6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRM3Q9NNZ6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRM3Q9NNZ6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRM3Q9NNZ6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRM3Q9NNZ6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRM3Q9NNZ6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRM3Q9NNZ6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRM3Q9NNZ6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRM3Q9NNZ6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRM3Q9NNZ6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRM3Q9NNZ6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRM3Q9NNZ6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRM3Q9NNZ6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRM3Q9NNZ6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRM3Q9NNZ6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRM3Q9NNZ6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRM3Q9NNZ6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRM3Q9NNZ6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRM3Q9NNZ6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRM3Q9NNZ6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRM3Q9NNZ6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRM3Q9NNZ6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRM3Q9NNZ6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRM3Q9NNZ6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRM3Q9NNZ6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRM3Q9NNZ6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRM3Q9NNZ6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRM3Q9NNZ6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PRM3Q9NNZ6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRM3Q9NNZ6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRM3Q9NNZ6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PRM3Q9NNZ6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRM3Q9NNZ6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRM3Q9NNZ6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRM3Q9NNZ6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRM3Q9NNZ6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRM3Q9NNZ6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRM3Q9NNZ6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRM3Q9NNZ6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRM3Q9NNZ6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRM3Q9NNZ6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PRM3Q9NNZ6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRM3Q9NNZ6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRM3Q9NNZ6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRM3Q9NNZ6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRM3Q9NNZ6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRM3Q9NNZ6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRM3Q9NNZ6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRM3Q9NNZ6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRM3Q9NNZ6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRM3Q9NNZ6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRM3Q9NNZ6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRM3Q9NNZ6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRM3Q9NNZ6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRM3Q9NNZ6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRM3Q9NNZ6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRM3Q9NNZ6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRM3Q9NNZ6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRM3Q9NNZ6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRM3Q9NNZ6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRM3Q9NNZ6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRM3Q9NNZ6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRM3Q9NNZ6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRM3Q9NNZ6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRM3Q9NNZ6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRM3Q9NNZ6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRM3Q9NNZ6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRM3Q9NNZ6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRM3Q9NNZ6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRM3Q9NNZ6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRM3Q9NNZ6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRM3Q9NNZ6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRM3Q9NNZ6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRM3Q9NNZ6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRM3Q9NNZ6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRM3Q9NNZ6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRM3Q9NNZ6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRM3Q9NNZ6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PRM3Q9NNZ6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRM3Q9NNZ6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRM3Q9NNZ6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRM3Q9NNZ6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRM3Q9NNZ6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRM3Q9NNZ6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRM3Q9NNZ6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRM3Q9NNZ6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRM3Q9NNZ6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PRM3Q9NNZ6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRM3Q9NNZ6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRM3Q9NNZ6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRM3Q9NNZ6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms