Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCA0

LRRC20, Leucine-rich repeat-containing protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC20Q8TCA0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC20Q8TCA0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC20Q8TCA0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC20Q8TCA0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC20Q8TCA0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC20Q8TCA0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC20Q8TCA0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC20Q8TCA0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC20Q8TCA0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC20Q8TCA0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC20Q8TCA0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC20Q8TCA0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC20Q8TCA0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC20Q8TCA0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC20Q8TCA0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC20Q8TCA0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC20Q8TCA0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC20Q8TCA0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC20Q8TCA0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC20Q8TCA0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC20Q8TCA0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC20Q8TCA0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC20Q8TCA0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC20Q8TCA0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC20Q8TCA0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC20Q8TCA0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC20Q8TCA0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC20Q8TCA0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC20Q8TCA0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC20Q8TCA0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC20Q8TCA0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC20Q8TCA0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC20Q8TCA0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC20Q8TCA0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC20Q8TCA0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC20Q8TCA0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC20Q8TCA0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC20Q8TCA0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC20Q8TCA0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRC20Q8TCA0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC20Q8TCA0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC20Q8TCA0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC20Q8TCA0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC20Q8TCA0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC20Q8TCA0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC20Q8TCA0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC20Q8TCA0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC20Q8TCA0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC20Q8TCA0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC20Q8TCA0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC20Q8TCA0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC20Q8TCA0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC20Q8TCA0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC20Q8TCA0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC20Q8TCA0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC20Q8TCA0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC20Q8TCA0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC20Q8TCA0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC20Q8TCA0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC20Q8TCA0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC20Q8TCA0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC20Q8TCA0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC20Q8TCA0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC20Q8TCA0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC20Q8TCA0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC20Q8TCA0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC20Q8TCA0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC20Q8TCA0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC20Q8TCA0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC20Q8TCA0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC20Q8TCA0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC20Q8TCA0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC20Q8TCA0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC20Q8TCA0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC20Q8TCA0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRC20Q8TCA0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRC20Q8TCA0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRC20Q8TCA0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC20Q8TCA0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRC20Q8TCA0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRC20Q8TCA0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC20Q8TCA0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC20Q8TCA0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC20Q8TCA0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC20Q8TCA0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC20Q8TCA0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC20Q8TCA0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC20Q8TCA0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC20Q8TCA0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC20Q8TCA0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC20Q8TCA0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC20Q8TCA0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC20Q8TCA0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC20Q8TCA0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC20Q8TCA0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC20Q8TCA0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC20Q8TCA0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC20Q8TCA0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC20Q8TCA0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC20Q8TCA0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms