Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9Q2

SREK1IP1, Protein SREK1IP1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREK1IP1Q8N9Q2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SREK1IP1Q8N9Q2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SREK1IP1Q8N9Q2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SREK1IP1Q8N9Q2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SREK1IP1Q8N9Q2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SREK1IP1Q8N9Q2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SREK1IP1Q8N9Q2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SREK1IP1Q8N9Q2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SREK1IP1Q8N9Q2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SREK1IP1Q8N9Q2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SREK1IP1Q8N9Q2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SREK1IP1Q8N9Q2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SREK1IP1Q8N9Q2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SREK1IP1Q8N9Q2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SREK1IP1Q8N9Q2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SREK1IP1Q8N9Q2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SREK1IP1Q8N9Q2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SREK1IP1Q8N9Q2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SREK1IP1Q8N9Q2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SREK1IP1Q8N9Q2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SREK1IP1Q8N9Q2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SREK1IP1Q8N9Q2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SREK1IP1Q8N9Q2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SREK1IP1Q8N9Q2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SREK1IP1Q8N9Q2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SREK1IP1Q8N9Q2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SREK1IP1Q8N9Q2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SREK1IP1Q8N9Q2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SREK1IP1Q8N9Q2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SREK1IP1Q8N9Q2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SREK1IP1Q8N9Q2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SREK1IP1Q8N9Q2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SREK1IP1Q8N9Q2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SREK1IP1Q8N9Q2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SREK1IP1Q8N9Q2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SREK1IP1Q8N9Q2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SREK1IP1Q8N9Q2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SREK1IP1Q8N9Q2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SREK1IP1Q8N9Q2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SREK1IP1Q8N9Q2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SREK1IP1Q8N9Q2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SREK1IP1Q8N9Q2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SREK1IP1Q8N9Q2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SREK1IP1Q8N9Q2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SREK1IP1Q8N9Q2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SREK1IP1Q8N9Q2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SREK1IP1Q8N9Q2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SREK1IP1Q8N9Q2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SREK1IP1Q8N9Q2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SREK1IP1Q8N9Q2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SREK1IP1Q8N9Q2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SREK1IP1Q8N9Q2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SREK1IP1Q8N9Q2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SREK1IP1Q8N9Q2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SREK1IP1Q8N9Q2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SREK1IP1Q8N9Q2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SREK1IP1Q8N9Q2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SREK1IP1Q8N9Q2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SREK1IP1Q8N9Q2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SREK1IP1Q8N9Q2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SREK1IP1Q8N9Q2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SREK1IP1Q8N9Q2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SREK1IP1Q8N9Q2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SREK1IP1Q8N9Q2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SREK1IP1Q8N9Q2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SREK1IP1Q8N9Q2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SREK1IP1Q8N9Q2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SREK1IP1Q8N9Q2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SREK1IP1Q8N9Q2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SREK1IP1Q8N9Q2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SREK1IP1Q8N9Q2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SREK1IP1Q8N9Q2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SREK1IP1Q8N9Q2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SREK1IP1Q8N9Q2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SREK1IP1Q8N9Q2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SREK1IP1Q8N9Q2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SREK1IP1Q8N9Q2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SREK1IP1Q8N9Q2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SREK1IP1Q8N9Q2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SREK1IP1Q8N9Q2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SREK1IP1Q8N9Q2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SREK1IP1Q8N9Q2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SREK1IP1Q8N9Q2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SREK1IP1Q8N9Q2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SREK1IP1Q8N9Q2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SREK1IP1Q8N9Q2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SREK1IP1Q8N9Q2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SREK1IP1Q8N9Q2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SREK1IP1Q8N9Q2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SREK1IP1Q8N9Q2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SREK1IP1Q8N9Q2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SREK1IP1Q8N9Q2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SREK1IP1Q8N9Q2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SREK1IP1Q8N9Q2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SREK1IP1Q8N9Q2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SREK1IP1Q8N9Q2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SREK1IP1Q8N9Q2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SREK1IP1Q8N9Q2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SREK1IP1Q8N9Q2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SREK1IP1Q8N9Q2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms