Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAMP3Q15836 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAMP3Q15836 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAMP3Q15836 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAMP3Q15836 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAMP3Q15836 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAMP3Q15836 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAMP3Q15836 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VAMP3Q15836 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VAMP3Q15836 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAMP3Q15836 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VAMP3Q15836 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VAMP3Q15836 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAMP3Q15836 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAMP3Q15836 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAMP3Q15836 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VAMP3Q15836 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VAMP3Q15836 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VAMP3Q15836 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAMP3Q15836 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAMP3Q15836 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAMP3Q15836 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VAMP3Q15836 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VAMP3Q15836 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VAMP3Q15836 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAMP3Q15836 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAMP3Q15836 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAMP3Q15836 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAMP3Q15836 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAMP3Q15836 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAMP3Q15836 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAMP3Q15836 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VAMP3Q15836 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VAMP3Q15836 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
VAMP3Q15836 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VAMP3Q15836 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VAMP3Q15836 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
VAMP3Q15836 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VAMP3Q15836 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAMP3Q15836 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAMP3Q15836 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAMP3Q15836 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAMP3Q15836 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
VAMP3Q15836 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAMP3Q15836 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VAMP3Q15836 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VAMP3Q15836 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VAMP3Q15836 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VAMP3Q15836 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VAMP3Q15836 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VAMP3Q15836 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VAMP3Q15836 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VAMP3Q15836 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VAMP3Q15836 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VAMP3Q15836 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VAMP3Q15836 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VAMP3Q15836 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VAMP3Q15836 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VAMP3Q15836 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VAMP3Q15836 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VAMP3Q15836 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VAMP3Q15836 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAMP3Q15836 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
VAMP3Q15836 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAMP3Q15836 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VAMP3Q15836 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VAMP3Q15836 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VAMP3Q15836 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VAMP3Q15836 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VAMP3Q15836 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VAMP3Q15836 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VAMP3Q15836 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VAMP3Q15836 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VAMP3Q15836 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAMP3Q15836 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAMP3Q15836 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VAMP3Q15836 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VAMP3Q15836 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VAMP3Q15836 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VAMP3Q15836 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VAMP3Q15836 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VAMP3Q15836 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VAMP3Q15836 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VAMP3Q15836 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VAMP3Q15836 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VAMP3Q15836 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VAMP3Q15836 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VAMP3Q15836 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VAMP3Q15836 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VAMP3Q15836 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAMP3Q15836 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAMP3Q15836 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAMP3Q15836 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAMP3Q15836 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VAMP3Q15836 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAMP3Q15836 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAMP3Q15836 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAMP3Q15836 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAMP3Q15836 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAMP3Q15836 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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