Protein–RNA interactions for Protein: Q13319

CDK5R2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R2Q13319 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK5R2Q13319 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK5R2Q13319 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK5R2Q13319 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK5R2Q13319 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK5R2Q13319 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK5R2Q13319 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK5R2Q13319 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK5R2Q13319 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK5R2Q13319 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK5R2Q13319 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK5R2Q13319 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK5R2Q13319 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK5R2Q13319 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK5R2Q13319 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK5R2Q13319 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK5R2Q13319 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK5R2Q13319 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK5R2Q13319 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK5R2Q13319 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK5R2Q13319 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK5R2Q13319 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK5R2Q13319 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK5R2Q13319 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK5R2Q13319 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK5R2Q13319 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK5R2Q13319 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK5R2Q13319 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK5R2Q13319 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK5R2Q13319 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK5R2Q13319 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK5R2Q13319 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK5R2Q13319 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK5R2Q13319 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK5R2Q13319 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK5R2Q13319 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK5R2Q13319 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK5R2Q13319 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK5R2Q13319 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK5R2Q13319 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK5R2Q13319 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK5R2Q13319 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK5R2Q13319 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK5R2Q13319 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK5R2Q13319 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK5R2Q13319 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK5R2Q13319 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK5R2Q13319 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK5R2Q13319 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK5R2Q13319 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK5R2Q13319 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK5R2Q13319 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK5R2Q13319 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK5R2Q13319 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK5R2Q13319 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK5R2Q13319 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK5R2Q13319 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK5R2Q13319 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK5R2Q13319 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK5R2Q13319 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK5R2Q13319 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK5R2Q13319 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK5R2Q13319 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK5R2Q13319 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK5R2Q13319 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK5R2Q13319 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK5R2Q13319 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK5R2Q13319 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK5R2Q13319 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK5R2Q13319 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK5R2Q13319 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK5R2Q13319 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK5R2Q13319 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK5R2Q13319 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK5R2Q13319 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDK5R2Q13319 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CDK5R2Q13319 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDK5R2Q13319 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDK5R2Q13319 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDK5R2Q13319 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK5R2Q13319 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK5R2Q13319 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK5R2Q13319 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK5R2Q13319 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK5R2Q13319 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK5R2Q13319 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK5R2Q13319 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK5R2Q13319 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK5R2Q13319 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK5R2Q13319 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK5R2Q13319 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK5R2Q13319 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK5R2Q13319 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK5R2Q13319 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK5R2Q13319 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK5R2Q13319 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK5R2Q13319 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK5R2Q13319 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK5R2Q13319 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK5R2Q13319 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms