Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.324e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 PRKACB-214ENST00000450730 944 ntTSL 36.78□□□□□ -1.324e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 PRKACB-209ENST00000413538 730 ntTSL 56.59□□□□□ -1.354e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 SELENOP-213ENST00000514403 653 ntTSL 26.51□□□□□ -1.374e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.384e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.554e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.564e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 SELENOP-207ENST00000510650 580 ntTSL 34.43□□□□□ -1.74e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 PRKACB-212ENST00000436133 648 ntTSL 34.09□□□□□ -1.754e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.784e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.834e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.854e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.854e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.854e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -24e-11■■■■■ 96.3
PABPC4Q13310 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.799e-7■■■■■ 94.9
PABPC4Q13310 CA1-213ENST00000521679 606 ntTSL 36.24□□□□□ -1.411e-323■■■■■ 94.7
PABPC4Q13310 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.253e-12■■■■■ 94.4
PABPC4Q13310 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.393e-12■■■■■ 94.4
PABPC4Q13310 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.632e-7■■■■■ 93.8
PABPC4Q13310 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.572e-7■■■■■ 93.8
PABPC4Q13310 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.132e-7■■■■■ 93.8
PABPC4Q13310 NLRP2-210ENST00000539848 577 ntTSL 515.75■□□□□ 0.111e-7■■■■■ 93.3
PABPC4Q13310 NLRP2-219ENST00000588619 593 ntTSL 513.69□□□□□ -0.221e-7■■■■■ 93.3
PABPC4Q13310 NLRP2-205ENST00000397169 550 ntTSL 412.81□□□□□ -0.361e-7■■■■■ 93.3
PABPC4Q13310 NLRP2-218ENST00000588107 592 ntTSL 412.57□□□□□ -0.41e-7■■■■■ 93.3
PABPC4Q13310 NLRP2-207ENST00000433772 540 ntTSL 511.35□□□□□ -0.591e-7■■■■■ 93.3
PABPC4Q13310 NLRP2-216ENST00000585500 576 ntTSL 58.16□□□□□ -1.11e-7■■■■■ 93.3
PABPC4Q13310 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC7.26□□□□□ -1.251e-7■■■■■ 93.3
PABPC4Q13310 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.681e-7■■■■■ 92.7
PABPC4Q13310 MCTS1-201ENST00000371315 1130 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.485e-39■■■■■ 92
PABPC4Q13310 MCTS1-202ENST00000371317 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.125e-39■■■■■ 92
PABPC4Q13310 MCTS1-203ENST00000424799 632 ntTSL 37.41□□□□□ -1.225e-39■■■■■ 92
PABPC4Q13310 MCTS1-204ENST00000484481 398 ntTSL 25.6□□□□□ -1.515e-39■■■■■ 92
PABPC4Q13310 MCTS1-205ENST00000487133 766 ntTSL 53.12□□□□□ -1.915e-39■■■■■ 92
PABPC4Q13310 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.23e-12■■■■■ 91.2
PABPC4Q13310 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.593e-12■■■■■ 91.2
PABPC4Q13310 FANCD2-204ENST00000421731 3425 ntTSL 1 (best)5.07□□□□□ -1.63e-12■■■■■ 91.2
PABPC4Q13310 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.322e-6■■■■■ 90.1
PABPC4Q13310 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.052e-6■■■■■ 90.1
PABPC4Q13310 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.842e-6■■■■■ 90.1
PABPC4Q13310 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 90.1
PABPC4Q13310 PUF60-204ENST00000456095 1736 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.062e-6■■■■■ 90.1
PABPC4Q13310 AL133368.1-201ENST00000486273 814 ntBASIC12.35□□□□□ -0.433e-10■■■■■ 88.3
PABPC4Q13310 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC7.16□□□□□ -1.263e-10■■■■■ 88.3
PABPC4Q13310 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.654e-7■■■■■ 87.6
PABPC4Q13310 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.134e-7■■■■■ 87.6
PABPC4Q13310 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.114e-15■■■■■ 87.2
PABPC4Q13310 DNAJB6-212ENST00000465908 694 ntTSL 319.28■□□□□ 0.684e-15■■■■■ 87.2
PABPC4Q13310 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.134e-15■■■■■ 87.2
PABPC4Q13310 DNAJB6-216ENST00000487480 5173 ntTSL 1 (best)11.48□□□□□ -0.574e-15■■■■■ 87.2
PABPC4Q13310 MAP4K4-212ENST00000456652 3855 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.973e-18■■■■■ 87.2
PABPC4Q13310 MAP4K4-207ENST00000417294 4251 ntTSL 56.86□□□□□ -1.313e-18■■■■■ 87.2
PABPC4Q13310 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.437e-7■■■■■ 87
PABPC4Q13310 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.277e-7■■■■■ 87
PABPC4Q13310 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.187e-7■■■■■ 87
PABPC4Q13310 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.657e-7■■■■■ 87
PABPC4Q13310 KIF14-201ENST00000367350 7274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.33e-7■■■■■ 86.3
PABPC4Q13310 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.113e-7■■■■■ 86.3
PABPC4Q13310 EMD-205ENST00000471965 800 ntTSL 226.05■■□□□ 1.761e-11■■■■■ 85.6
PABPC4Q13310 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.151e-11■■■■■ 85.6
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PABPC4Q13310 SELENOH-205ENST00000534386 1039 ntTSL 217.72■□□□□ 0.431e-12■■■■■ 84.9
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PABPC4Q13310 IGBP1-202ENST00000356413 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.612e-11■■■■■ 83.9
PABPC4Q13310 MESD-205ENST00000560244 981 ntTSL 511.5□□□□□ -0.572e-62■■■■■ 83.6
PABPC4Q13310 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.841e-19■■■■■ 83.5
PABPC4Q13310 GOSR1-205ENST00000467337 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 01e-19■■■■■ 83.5
PABPC4Q13310 FBXO16-210ENST00000521548 2983 ntTSL 214.37□□□□□ -0.111e-19■■■■■ 83.5
PABPC4Q13310 ZNF395-206ENST00000520535 625 ntTSL 513.17□□□□□ -0.31e-19■■■■■ 83.5
PABPC4Q13310 GOSR1-207ENST00000477885 679 ntTSL 213.09□□□□□ -0.311e-19■■■■■ 83.5
PABPC4Q13310 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.262e-11■■■■■ 83.2
PABPC4Q13310 RCN3-202ENST00000593483 595 ntTSL 518.99■□□□□ 0.632e-11■■■■■ 83.2
PABPC4Q13310 RCN3-205ENST00000598833 607 ntTSL 318.48■□□□□ 0.552e-11■■■■■ 83.2
PABPC4Q13310 SAMHD1-201ENST00000262878 4784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.432e-11■■■■■ 83.2
PABPC4Q13310 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.332e-12■■■■■ 82.5
PABPC4Q13310 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.222e-12■■■■■ 82.5
PABPC4Q13310 NDUFB5-202ENST00000359944 1054 ntTSL 1 (best)17.86■□□□□ 0.454e-31■■■■■ 82.4
PABPC4Q13310 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.374e-31■■■■■ 82.4
PABPC4Q13310 NDUFB5-201ENST00000259037 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.354e-31■■■■■ 82.4
PABPC4Q13310 NDUFB5-214ENST00000493866 4046 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.794e-31■■■■■ 82.4
PABPC4Q13310 NDUFB5-204ENST00000471112 684 ntTSL 37.45□□□□□ -1.224e-31■■■■■ 82.4
PABPC4Q13310 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.545e-9■■■■■ 81.6
PABPC4Q13310 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.265e-9■■■■■ 81.6
PABPC4Q13310 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.641e-6■■■■■ 81.1
PABPC4Q13310 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.541e-6■■■■■ 81.1
PABPC4Q13310 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.391e-6■■■■■ 81.1
PABPC4Q13310 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.251e-6■■■■■ 81.1
PABPC4Q13310 TBRG4-217ENST00000495973 3409 ntTSL 1 (best)12.44□□□□□ -0.421e-6■■■■■ 81.1
PABPC4Q13310 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.555e-11■■■■■ 80.8
PABPC4Q13310 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.455e-11■■■■■ 80.8
PABPC4Q13310 NR2F2-AS1-202ENST00000557863 515 ntTSL 319.02■□□□□ 0.641e-323■■■■■ 80.5
PABPC4Q13310 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.498e-8■■■■■ 80.3
PABPC4Q13310 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.488e-8■■■■■ 80.3
PABPC4Q13310 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.163e-14■■■■■ 80.3
PABPC4Q13310 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.83e-14■■■■■ 80.3
PABPC4Q13310 BCL7B-211ENST00000486818 1404 ntTSL 516.06■□□□□ 0.168e-8■■■■■ 80.3
PABPC4Q13310 BCL7B-213ENST00000493671 1802 ntTSL 215.78■□□□□ 0.128e-8■■■■■ 80.3
PABPC4Q13310 BCL7B-210ENST00000482231 1638 ntTSL 213.35□□□□□ -0.278e-8■■■■■ 80.3
PABPC4Q13310 TNFAIP2-211ENST00000561217 603 ntTSL 312.79□□□□□ -0.363e-14■■■■■ 80.3
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