Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CBX3Q13185 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CBX3Q13185 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CBX3Q13185 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CBX3Q13185 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CBX3Q13185 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBX3Q13185 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CBX3Q13185 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBX3Q13185 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBX3Q13185 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBX3Q13185 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBX3Q13185 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBX3Q13185 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBX3Q13185 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBX3Q13185 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CBX3Q13185 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CBX3Q13185 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CBX3Q13185 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CBX3Q13185 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBX3Q13185 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBX3Q13185 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBX3Q13185 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBX3Q13185 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBX3Q13185 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CBX3Q13185 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CBX3Q13185 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CBX3Q13185 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CBX3Q13185 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBX3Q13185 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBX3Q13185 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBX3Q13185 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBX3Q13185 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CBX3Q13185 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBX3Q13185 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CBX3Q13185 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBX3Q13185 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBX3Q13185 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBX3Q13185 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBX3Q13185 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CBX3Q13185 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBX3Q13185 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CBX3Q13185 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CBX3Q13185 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CBX3Q13185 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBX3Q13185 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CBX3Q13185 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CBX3Q13185 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBX3Q13185 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBX3Q13185 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBX3Q13185 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBX3Q13185 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CBX3Q13185 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CBX3Q13185 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CBX3Q13185 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CBX3Q13185 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CBX3Q13185 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CBX3Q13185 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CBX3Q13185 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CBX3Q13185 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CBX3Q13185 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CBX3Q13185 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CBX3Q13185 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CBX3Q13185 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CBX3Q13185 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBX3Q13185 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CBX3Q13185 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CBX3Q13185 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CBX3Q13185 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CBX3Q13185 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CBX3Q13185 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CBX3Q13185 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CBX3Q13185 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBX3Q13185 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CBX3Q13185 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBX3Q13185 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBX3Q13185 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBX3Q13185 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CBX3Q13185 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CBX3Q13185 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CBX3Q13185 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBX3Q13185 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBX3Q13185 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBX3Q13185 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBX3Q13185 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBX3Q13185 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBX3Q13185 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CBX3Q13185 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBX3Q13185 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CBX3Q13185 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CBX3Q13185 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBX3Q13185 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CBX3Q13185 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CBX3Q13185 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CBX3Q13185 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBX3Q13185 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CBX3Q13185 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBX3Q13185 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBX3Q13185 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBX3Q13185 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBX3Q13185 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
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