Protein–RNA interactions for Protein: Q12441

TY1A-DR3, Transposon Ty1-DR3 Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-DR3Q12441 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt9.51□□□□□ -0.89
TY1A-DR3Q12441 YEL076CYEL076C 651 nt9.51□□□□□ -0.89
TY1A-DR3Q12441 YLR464WYLR464W 651 nt9.51□□□□□ -0.89
TY1A-DR3Q12441 DPS1YLL018C 1674 nt9.51□□□□□ -0.89
TY1A-DR3Q12441 YGR021WYGR021W 873 nt9.5□□□□□ -0.89
TY1A-DR3Q12441 SNF1YDR477W 1902 nt9.5□□□□□ -0.89
TY1A-DR3Q12441 SIM1YIL123W 1431 nt9.49□□□□□ -0.89
TY1A-DR3Q12441 BNS1YGR230W 414 nt9.49□□□□□ -0.89
TY1A-DR3Q12441 YTH1YPR107C 627 nt9.47□□□□□ -0.89
TY1A-DR3Q12441 PST2YDR032C 597 nt9.46□□□□□ -0.9
TY1A-DR3Q12441 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt9.46□□□□□ -0.9
TY1A-DR3Q12441 CYT2YKL087C 675 nt9.43□□□□□ -0.9
TY1A-DR3Q12441 YEL074WYEL074W 339 nt9.42□□□□□ -0.9
TY1A-DR3Q12441 CCA1YER168C 1641 nt9.42□□□□□ -0.9
TY1A-DR3Q12441 MNP1YGL068W 585 nt9.41□□□□□ -0.9
TY1A-DR3Q12441 RRD1YIL153W 1182 nt9.41□□□□□ -0.9
TY1A-DR3Q12441 AST1YBL069W 1290 nt9.41□□□□□ -0.9
TY1A-DR3Q12441 PCM1YEL058W 1674 nt9.4□□□□□ -0.9
TY1A-DR3Q12441 REC114YMR133W 1287 nt9.4□□□□□ -0.9
TY1A-DR3Q12441 FTR1YER145C 1215 nt9.39□□□□□ -0.91
TY1A-DR3Q12441 YJL152WYJL152W 360 nt9.39□□□□□ -0.91
TY1A-DR3Q12441 RKM5YLR137W 1104 nt9.39□□□□□ -0.91
TY1A-DR3Q12441 LSM12YHR121W 564 nt9.38□□□□□ -0.91
TY1A-DR3Q12441 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt9.38□□□□□ -0.91
TY1A-DR3Q12441 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.38□□□□□ -0.91
TY1A-DR3Q12441 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.38□□□□□ -0.91
TY1A-DR3Q12441 YGL118CYGL118C 438 nt9.37□□□□□ -0.91
TY1A-DR3Q12441 CMP2YML057W 1815 nt9.37□□□□□ -0.91
TY1A-DR3Q12441 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt9.36□□□□□ -0.91
TY1A-DR3Q12441 MOD5YOR274W 1287 nt9.36□□□□□ -0.91
TY1A-DR3Q12441 Q0142Q0142 177 nt9.35□□□□□ -0.91
TY1A-DR3Q12441 YKR005CYKR005C 1578 nt9.33□□□□□ -0.92
TY1A-DR3Q12441 PIC2YER053C 903 nt9.33□□□□□ -0.92
TY1A-DR3Q12441 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt9.33□□□□□ -0.92
TY1A-DR3Q12441 YBL081WYBL081W 1107 nt9.33□□□□□ -0.92
TY1A-DR3Q12441 DED1YOR204W 1815 nt9.31□□□□□ -0.92
TY1A-DR3Q12441 YHP1YDR451C 1062 nt9.31□□□□□ -0.92
TY1A-DR3Q12441 AIR1YIL079C 1083 nt9.31□□□□□ -0.92
TY1A-DR3Q12441 PUS5YLR165C 765 nt9.31□□□□□ -0.92
TY1A-DR3Q12441 FMT1YBL013W 1206 nt9.31□□□□□ -0.92
TY1A-DR3Q12441 FAF1YIL019W 1041 nt9.3□□□□□ -0.92
TY1A-DR3Q12441 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt9.3□□□□□ -0.92
TY1A-DR3Q12441 HOS2YGL194C 1359 nt9.29□□□□□ -0.92
TY1A-DR3Q12441 YAT1YAR035W 2064 nt9.29□□□□□ -0.92
TY1A-DR3Q12441 Q0255Q0255 1419 nt9.29□□□□□ -0.92
TY1A-DR3Q12441 FMP52YER004W 696 nt9.28□□□□□ -0.92
TY1A-DR3Q12441 FHN1YGR131W 525 nt9.28□□□□□ -0.92
TY1A-DR3Q12441 CRR1YLR213C 1269 nt9.28□□□□□ -0.92
TY1A-DR3Q12441 MIC10YCL057C-A 294 nt9.28□□□□□ -0.92
TY1A-DR3Q12441 MPC1YGL080W 393 nt9.26□□□□□ -0.93
TY1A-DR3Q12441 ATG17YLR423C 1254 nt9.26□□□□□ -0.93
TY1A-DR3Q12441 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt9.26□□□□□ -0.93
TY1A-DR3Q12441 APM1YPL259C 1428 nt9.25□□□□□ -0.93
TY1A-DR3Q12441 SHU1YHL006C 453 nt9.25□□□□□ -0.93
TY1A-DR3Q12441 BMT6YLR063W 1098 nt9.24□□□□□ -0.93
TY1A-DR3Q12441 ADH2YMR303C 1047 nt9.24□□□□□ -0.93
TY1A-DR3Q12441 ERF2YLR246W 1080 nt9.22□□□□□ -0.93
TY1A-DR3Q12441 RAX1YOR301W 1308 nt9.22□□□□□ -0.93
TY1A-DR3Q12441 ICE2YIL090W 1476 nt9.21□□□□□ -0.93
TY1A-DR3Q12441 ATP6Q0085 780 nt9.21□□□□□ -0.94
TY1A-DR3Q12441 NAT5YOR253W 531 nt9.21□□□□□ -0.94
TY1A-DR3Q12441 KTR3YBR205W 1215 nt9.21□□□□□ -0.94
TY1A-DR3Q12441 YNL234WYNL234W 1281 nt9.2□□□□□ -0.94
TY1A-DR3Q12441 BNA3YJL060W 1335 nt9.2□□□□□ -0.94
TY1A-DR3Q12441 FRE6YLL051C 2139 nt9.2□□□□□ -0.94
TY1A-DR3Q12441 AIM41YOR215C 558 nt9.19□□□□□ -0.94
TY1A-DR3Q12441 NEM1YHR004C 1341 nt9.19□□□□□ -0.94
TY1A-DR3Q12441 IRC24YIR036C 792 nt9.18□□□□□ -0.94
TY1A-DR3Q12441 COX16YJL003W 357 nt9.18□□□□□ -0.94
TY1A-DR3Q12441 YLR036CYLR036C 612 nt9.18□□□□□ -0.94
TY1A-DR3Q12441 YML079WYML079W 606 nt9.18□□□□□ -0.94
TY1A-DR3Q12441 YMR147WYMR147W 672 nt9.18□□□□□ -0.94
TY1A-DR3Q12441 WSC2YNL283C 1512 nt9.18□□□□□ -0.94
TY1A-DR3Q12441 YGL188CYGL188C 174 nt9.17□□□□□ -0.94
TY1A-DR3Q12441 HEL2YDR266C 1920 nt9.17□□□□□ -0.94
TY1A-DR3Q12441 ATF2YGR177C 1608 nt9.16□□□□□ -0.94
TY1A-DR3Q12441 STD1YOR047C 1335 nt9.16□□□□□ -0.94
TY1A-DR3Q12441 HEM12YDR047W 1089 nt9.16□□□□□ -0.94
TY1A-DR3Q12441 YGR259CYGR259C 441 nt9.16□□□□□ -0.94
TY1A-DR3Q12441 SNF6YHL025W 999 nt9.16□□□□□ -0.94
TY1A-DR3Q12441 YOR169CYOR169C 465 nt9.16□□□□□ -0.94
TY1A-DR3Q12441 AGP1YCL025C 1902 nt9.15□□□□□ -0.94
TY1A-DR3Q12441 CWP1YKL096W 720 nt9.15□□□□□ -0.94
TY1A-DR3Q12441 SNG1YGR197C 1644 nt9.15□□□□□ -0.94
TY1A-DR3Q12441 SCO2YBR024W 906 nt9.13□□□□□ -0.95
TY1A-DR3Q12441 SWP1YMR149W 861 nt9.11□□□□□ -0.95
TY1A-DR3Q12441 MRPL36YBR122C 534 nt9.11□□□□□ -0.95
TY1A-DR3Q12441 MPS2YGL075C 1164 nt9.1□□□□□ -0.95
TY1A-DR3Q12441 YLL053CYLL053C 459 nt9.1□□□□□ -0.95
TY1A-DR3Q12441 YIH1YCR059C 777 nt9.09□□□□□ -0.95
TY1A-DR3Q12441 UBC12YLR306W 567 nt9.09□□□□□ -0.95
TY1A-DR3Q12441 PEX27YOR193W 1131 nt9.09□□□□□ -0.95
TY1A-DR3Q12441 NDI1YML120C 1542 nt9.09□□□□□ -0.95
TY1A-DR3Q12441 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt9.08□□□□□ -0.96
TY1A-DR3Q12441 SED5YLR026C 1023 nt9.07□□□□□ -0.96
TY1A-DR3Q12441 YCL074WYCL074W 927 nt9.06□□□□□ -0.96
TY1A-DR3Q12441 GET2YER083C 858 nt9.05□□□□□ -0.96
TY1A-DR3Q12441 GBP2YCL011C 1284 nt9.05□□□□□ -0.96
TY1A-DR3Q12441 TCD2YKL027W 1344 nt9.03□□□□□ -0.96
TY1A-DR3Q12441 ARC19YKL013C 516 nt9.02□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 43.8 ms