Protein–RNA interactions for Protein: Q12270

RBD2, Rhomboid protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RBD2Q12270 DPS1YLL018C 1674 nt10.02□□□□□ -0.8
RBD2Q12270 GAL1YBR020W 1587 nt10.01□□□□□ -0.81
RBD2Q12270 YKR040CYKR040C 504 nt10□□□□□ -0.81
RBD2Q12270 TRM5YHR070W 1500 nt10□□□□□ -0.81
RBD2Q12270 LPX1YOR084W 1164 nt9.99□□□□□ -0.81
RBD2Q12270 DDR2YOL052C-A 186 nt9.97□□□□□ -0.81
RBD2Q12270 DIC1YLR348C 897 nt9.96□□□□□ -0.82
RBD2Q12270 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt9.95□□□□□ -0.82
RBD2Q12270 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt9.95□□□□□ -0.82
RBD2Q12270 IMT4tM(CAU)E 72 nt9.95□□□□□ -0.82
RBD2Q12270 IMT3tM(CAU)J3 72 nt9.95□□□□□ -0.82
RBD2Q12270 IMT1tM(CAU)O1 72 nt9.95□□□□□ -0.82
RBD2Q12270 IMT2tM(CAU)P 72 nt9.95□□□□□ -0.82
RBD2Q12270 YKR005CYKR005C 1578 nt9.94□□□□□ -0.82
RBD2Q12270 ANP1YEL036C 1503 nt9.94□□□□□ -0.82
RBD2Q12270 BMT6YLR063W 1098 nt9.94□□□□□ -0.82
RBD2Q12270 NAR1YNL240C 1476 nt9.93□□□□□ -0.82
RBD2Q12270 WSC2YNL283C 1512 nt9.92□□□□□ -0.82
RBD2Q12270 BNA2YJR078W 1362 nt9.91□□□□□ -0.82
RBD2Q12270 MIC12YBR262C 321 nt9.9□□□□□ -0.82
RBD2Q12270 BIO5YNR056C 1686 nt9.9□□□□□ -0.83
RBD2Q12270 SNF1YDR477W 1902 nt9.9□□□□□ -0.83
RBD2Q12270 AGP1YCL025C 1902 nt9.9□□□□□ -0.83
RBD2Q12270 FRE6YLL051C 2139 nt9.87□□□□□ -0.83
RBD2Q12270 AQY1YPR192W 918 nt9.87□□□□□ -0.83
RBD2Q12270 YCL074WYCL074W 927 nt9.86□□□□□ -0.83
RBD2Q12270 DUS1YML080W 1272 nt9.84□□□□□ -0.83
RBD2Q12270 PBP1YGR178C 2169 nt9.83□□□□□ -0.84
RBD2Q12270 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt9.82□□□□□ -0.84
RBD2Q12270 YGR259CYGR259C 441 nt9.82□□□□□ -0.84
RBD2Q12270 STB1YNL309W 1263 nt9.82□□□□□ -0.84
RBD2Q12270 SPC25YER018C 666 nt9.81□□□□□ -0.84
RBD2Q12270 FEN2YCR028C 1539 nt9.81□□□□□ -0.84
RBD2Q12270 IRC24YIR036C 792 nt9.79□□□□□ -0.84
RBD2Q12270 CYT2YKL087C 675 nt9.78□□□□□ -0.84
RBD2Q12270 HHO1YPL127C 777 nt9.78□□□□□ -0.84
RBD2Q12270 GPI16YHR188C 1833 nt9.76□□□□□ -0.85
RBD2Q12270 YIR016WYIR016W 798 nt9.73□□□□□ -0.85
RBD2Q12270 TIM23YNR017W 669 nt9.73□□□□□ -0.85
RBD2Q12270 XDJ1YLR090W 1380 nt9.72□□□□□ -0.85
RBD2Q12270 VPS60YDR486C 690 nt9.71□□□□□ -0.86
RBD2Q12270 YGR201CYGR201C 678 nt9.71□□□□□ -0.86
RBD2Q12270 PTH1YHR189W 573 nt9.71□□□□□ -0.86
RBD2Q12270 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.7□□□□□ -0.86
RBD2Q12270 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.7□□□□□ -0.86
RBD2Q12270 YLR179CYLR179C 606 nt9.7□□□□□ -0.86
RBD2Q12270 YLR235CYLR235C 399 nt9.69□□□□□ -0.86
RBD2Q12270 CCT4YDL143W 1587 nt9.68□□□□□ -0.86
RBD2Q12270 STR3YGL184C 1398 nt9.67□□□□□ -0.86
RBD2Q12270 ALG3YBL082C 1377 nt9.66□□□□□ -0.86
RBD2Q12270 AHT1YHR093W 549 nt9.64□□□□□ -0.87
RBD2Q12270 DUT1YBR252W 444 nt9.63□□□□□ -0.87
RBD2Q12270 SWC5YBR231C 912 nt9.61□□□□□ -0.87
RBD2Q12270 SPP1YPL138C 1062 nt9.58□□□□□ -0.88
RBD2Q12270 CMP2YML057W 1815 nt9.58□□□□□ -0.88
RBD2Q12270 SSN3YPL042C 1668 nt9.56□□□□□ -0.88
RBD2Q12270 AQY2YLL052C 450 nt9.56□□□□□ -0.88
RBD2Q12270 RTN2YDL204W 1182 nt9.55□□□□□ -0.88
RBD2Q12270 YAT1YAR035W 2064 nt9.54□□□□□ -0.88
RBD2Q12270 AVT6YER119C 1347 nt9.54□□□□□ -0.88
RBD2Q12270 GOR1YNL274C 1053 nt9.53□□□□□ -0.88
RBD2Q12270 YPR064WYPR064W 420 nt9.53□□□□□ -0.88
RBD2Q12270 YKL030WYKL030W 606 nt9.51□□□□□ -0.89
RBD2Q12270 GDH3YAL062W 1374 nt9.5□□□□□ -0.89
RBD2Q12270 NDI1YML120C 1542 nt9.46□□□□□ -0.89
RBD2Q12270 TAD3YLR316C 969 nt9.46□□□□□ -0.9
RBD2Q12270 HSL7YBR133C 2484 nt9.46□□□□□ -0.9
RBD2Q12270 BSP1YPR171W 1731 nt9.42□□□□□ -0.9
RBD2Q12270 SHM2YLR058C 1410 nt9.39□□□□□ -0.91
RBD2Q12270 BDH1YAL060W 1149 nt9.39□□□□□ -0.91
RBD2Q12270 PLB1YMR008C 1995 nt9.36□□□□□ -0.91
RBD2Q12270 DAT1YML113W 747 nt9.36□□□□□ -0.91
RBD2Q12270 SPT20YOL148C 1815 nt9.35□□□□□ -0.91
RBD2Q12270 HIF1YLL022C 1158 nt9.35□□□□□ -0.91
RBD2Q12270 YLR415CYLR415C 339 nt9.35□□□□□ -0.91
RBD2Q12270 ARP6YLR085C 1317 nt9.33□□□□□ -0.92
RBD2Q12270 TIM17YJL143W 477 nt9.32□□□□□ -0.92
RBD2Q12270 RPC82YPR190C 1965 nt9.32□□□□□ -0.92
RBD2Q12270 NBP35YGL091C 987 nt9.31□□□□□ -0.92
RBD2Q12270 PRM5YIL117C 957 nt9.31□□□□□ -0.92
RBD2Q12270 ALD4YOR374W 1560 nt9.31□□□□□ -0.92
RBD2Q12270 INA1YLR413W 2028 nt9.31□□□□□ -0.92
RBD2Q12270 NIT1YIL164C 600 nt9.3□□□□□ -0.92
RBD2Q12270 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.27□□□□□ -0.93
RBD2Q12270 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.27□□□□□ -0.93
RBD2Q12270 YCR102CYCR102C 1107 nt9.26□□□□□ -0.93
RBD2Q12270 YSP3YOR003W 1437 nt9.24□□□□□ -0.93
RBD2Q12270 GID7YCL039W 2238 nt9.23□□□□□ -0.93
RBD2Q12270 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt9.23□□□□□ -0.93
RBD2Q12270 SGT2YOR007C 1041 nt9.22□□□□□ -0.93
RBD2Q12270 UBX6YJL048C 1191 nt9.21□□□□□ -0.94
RBD2Q12270 UTR1YJR049C 1593 nt9.2□□□□□ -0.94
RBD2Q12270 RTG1YOL067C 534 nt9.18□□□□□ -0.94
RBD2Q12270 ZRT3YKL175W 1512 nt9.15□□□□□ -0.94
RBD2Q12270 GAP1YKR039W 1809 nt9.12□□□□□ -0.95
RBD2Q12270 LSC2YGR244C 1284 nt9.12□□□□□ -0.95
RBD2Q12270 SAM35YHR083W 990 nt9.12□□□□□ -0.95
RBD2Q12270 HEL2YDR266C 1920 nt9.1□□□□□ -0.95
RBD2Q12270 TIR3YIL011W 810 nt9.1□□□□□ -0.95
RBD2Q12270 YNL115CYNL115C 1935 nt9.09□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.2 ms