Protein–RNA interactions for Protein: Q12267

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, yeastyeast

Predictions only

Length 1,418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMC4Q12267 MSF1YPR047W 1410 nt17.22■□□□□ 0.35
SMC4Q12267 AQY1YPR192W 918 nt17.21■□□□□ 0.34
SMC4Q12267 MIR1YJR077C 936 nt17.18■□□□□ 0.34
SMC4Q12267 SWC5YBR231C 912 nt17.16■□□□□ 0.34
SMC4Q12267 THI74YDR438W 1113 nt17.14■□□□□ 0.33
SMC4Q12267 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt17.14■□□□□ 0.33
SMC4Q12267 STB1YNL309W 1263 nt17.12■□□□□ 0.33
SMC4Q12267 CCT4YDL143W 1587 nt17.1■□□□□ 0.33
SMC4Q12267 ATF2YGR177C 1608 nt17.05■□□□□ 0.32
SMC4Q12267 VPS60YDR486C 690 nt17.04■□□□□ 0.32
SMC4Q12267 GPI16YHR188C 1833 nt17.03■□□□□ 0.32
SMC4Q12267 SPC25YER018C 666 nt17.02■□□□□ 0.31
SMC4Q12267 DDR2YOL052C-A 186 nt17.01■□□□□ 0.31
SMC4Q12267 YMR244WYMR244W 1068 nt17■□□□□ 0.31
SMC4Q12267 YHL050CYHL050C 2094 nt17■□□□□ 0.31
SMC4Q12267 ALG3YBL082C 1377 nt16.99■□□□□ 0.31
SMC4Q12267 VPS75YNL246W 795 nt16.99■□□□□ 0.31
SMC4Q12267 PAU7YAR020C 168 nt16.93■□□□□ 0.3
SMC4Q12267 DAT1YML113W 747 nt16.92■□□□□ 0.3
SMC4Q12267 ERF2YLR246W 1080 nt16.89■□□□□ 0.29
SMC4Q12267 CRR1YLR213C 1269 nt16.88■□□□□ 0.29
SMC4Q12267 GLR1YPL091W 1452 nt16.88■□□□□ 0.29
SMC4Q12267 SPT8YLR055C 1809 nt16.85■□□□□ 0.29
SMC4Q12267 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt16.83■□□□□ 0.28
SMC4Q12267 YFL067WYFL067W 528 nt16.83■□□□□ 0.28
SMC4Q12267 FEN2YCR028C 1539 nt16.8■□□□□ 0.28
SMC4Q12267 YGL034CYGL034C 366 nt16.79■□□□□ 0.28
SMC4Q12267 SHB17YKR043C 816 nt16.77■□□□□ 0.27
SMC4Q12267 MIC10YCL057C-A 294 nt16.77■□□□□ 0.27
SMC4Q12267 ANP1YEL036C 1503 nt16.76■□□□□ 0.27
SMC4Q12267 NDI1YML120C 1542 nt16.75■□□□□ 0.27
SMC4Q12267 UBA4YHR111W 1323 nt16.75■□□□□ 0.27
SMC4Q12267 TIM17YJL143W 477 nt16.73■□□□□ 0.27
SMC4Q12267 SNG1YGR197C 1644 nt16.73■□□□□ 0.27
SMC4Q12267 RBG1YAL036C 1110 nt16.71■□□□□ 0.27
SMC4Q12267 RBG2YGR173W 1107 nt16.7■□□□□ 0.26
SMC4Q12267 YSR3YKR053C 1215 nt16.7■□□□□ 0.26
SMC4Q12267 XYL2YLR070C 1071 nt16.67■□□□□ 0.26
SMC4Q12267 HEM12YDR047W 1089 nt16.66■□□□□ 0.26
SMC4Q12267 YIR016WYIR016W 798 nt16.6■□□□□ 0.25
SMC4Q12267 SGT2YOR007C 1041 nt16.59■□□□□ 0.25
SMC4Q12267 SHM2YLR058C 1410 nt16.59■□□□□ 0.25
SMC4Q12267 XDJ1YLR090W 1380 nt16.54■□□□□ 0.24
SMC4Q12267 YDR010CYDR010C 333 nt16.53■□□□□ 0.24
SMC4Q12267 PHO89YBR296C 1725 nt16.5■□□□□ 0.23
SMC4Q12267 SEC11YIR022W 504 nt16.5■□□□□ 0.23
SMC4Q12267 LYS4YDR234W 2082 nt16.44■□□□□ 0.22
SMC4Q12267 BDF1YLR399C 2061 nt16.42■□□□□ 0.22
SMC4Q12267 AIM45YPR004C 1035 nt16.42■□□□□ 0.22
SMC4Q12267 NIT1YIL164C 600 nt16.41■□□□□ 0.22
SMC4Q12267 RET2YFR051C 1641 nt16.39■□□□□ 0.21
SMC4Q12267 BNA2YJR078W 1362 nt16.37■□□□□ 0.21
SMC4Q12267 NCP1YHR042W 2076 nt16.36■□□□□ 0.21
SMC4Q12267 YCR087WYCR087W 516 nt16.36■□□□□ 0.21
SMC4Q12267 PCH2YBR186W 1695 nt16.35■□□□□ 0.21
SMC4Q12267 GDH3YAL062W 1374 nt16.31■□□□□ 0.2
SMC4Q12267 TAT1YBR069C 1860 nt16.31■□□□□ 0.2
SMC4Q12267 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt16.26■□□□□ 0.19
SMC4Q12267 SAM1YLR180W 1149 nt16.25■□□□□ 0.19
SMC4Q12267 RAD51YER095W 1203 nt16.24■□□□□ 0.19
SMC4Q12267 YLR111WYLR111W 333 nt16.24■□□□□ 0.19
SMC4Q12267 MRP20YDR405W 792 nt16.22■□□□□ 0.19
SMC4Q12267 COQ2YNR041C 1119 nt16.22■□□□□ 0.19
SMC4Q12267 MIC12YBR262C 321 nt16.21■□□□□ 0.19
SMC4Q12267 BOP3YNL042W 1191 nt16.19■□□□□ 0.18
SMC4Q12267 SDH5YOL071W 489 nt16.19■□□□□ 0.18
SMC4Q12267 AVT6YER119C 1347 nt16.19■□□□□ 0.18
SMC4Q12267 GUT2YIL155C 1950 nt16.18■□□□□ 0.18
SMC4Q12267 YMR226CYMR226C 804 nt16.16■□□□□ 0.18
SMC4Q12267 RTF1YGL244W 1677 nt16.15■□□□□ 0.18
SMC4Q12267 YGR201CYGR201C 678 nt16.13■□□□□ 0.17
SMC4Q12267 HHO1YPL127C 777 nt16.13■□□□□ 0.17
SMC4Q12267 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt16.11■□□□□ 0.17
SMC4Q12267 SFA1YDL168W 1161 nt16.07■□□□□ 0.16
SMC4Q12267 RAX1YOR301W 1308 nt16.05■□□□□ 0.16
SMC4Q12267 RPM1RPM1 483 nt15.96■□□□□ 0.15
SMC4Q12267 DUT1YBR252W 444 nt15.96■□□□□ 0.15
SMC4Q12267 PIB2YGL023C 1908 nt15.95■□□□□ 0.14
SMC4Q12267 GOR1YNL274C 1053 nt15.94■□□□□ 0.14
SMC4Q12267 CAB5YDR196C 726 nt15.94■□□□□ 0.14
SMC4Q12267 RPL4BYDR012W 1089 nt15.93■□□□□ 0.14
SMC4Q12267 RPL4AYBR031W 1089 nt15.93■□□□□ 0.14
SMC4Q12267 RPS14BYJL191W 417 nt15.9■□□□□ 0.14
SMC4Q12267 YNR029CYNR029C 1290 nt15.9■□□□□ 0.14
SMC4Q12267 YCR102CYCR102C 1107 nt15.87■□□□□ 0.13
SMC4Q12267 SHH4YLR164W 507 nt15.87■□□□□ 0.13
SMC4Q12267 AGP1YCL025C 1902 nt15.87■□□□□ 0.13
SMC4Q12267 ADH7YCR105W 1086 nt15.86■□□□□ 0.13
SMC4Q12267 STE4YOR212W 1272 nt15.85■□□□□ 0.13
SMC4Q12267 YLR279WYLR279W 390 nt15.83■□□□□ 0.12
SMC4Q12267 YLR349WYLR349W 507 nt15.82■□□□□ 0.12
SMC4Q12267 PEX2YJL210W 816 nt15.8■□□□□ 0.12
SMC4Q12267 PTK1YKL198C 1989 nt15.8■□□□□ 0.12
SMC4Q12267 YFL054CYFL054C 1941 nt15.79■□□□□ 0.12
SMC4Q12267 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt15.78■□□□□ 0.12
SMC4Q12267 CCA1YER168C 1641 nt15.78■□□□□ 0.12
SMC4Q12267 YGR012WYGR012W 1182 nt15.77■□□□□ 0.12
SMC4Q12267 CLB6YGR109C 1143 nt15.77■□□□□ 0.12
SMC4Q12267 TOM6YOR045W 186 nt15.77■□□□□ 0.11
SMC4Q12267 RAD23YEL037C 1197 nt15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13 ms