Protein–RNA interactions for Protein: Q12255

NYV1, Vacuolar v-SNARE NYV1, yeastyeast

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NYV1Q12255 TRM5YHR070W 1500 nt13.47□□□□□ -0.25
NYV1Q12255 SIM1YIL123W 1431 nt13.46□□□□□ -0.26
NYV1Q12255 SSA4YER103W 1929 nt13.45□□□□□ -0.26
NYV1Q12255 THI74YDR438W 1113 nt13.42□□□□□ -0.26
NYV1Q12255 STB1YNL309W 1263 nt13.42□□□□□ -0.26
NYV1Q12255 CCT4YDL143W 1587 nt13.41□□□□□ -0.26
NYV1Q12255 MIR1YJR077C 936 nt13.41□□□□□ -0.26
NYV1Q12255 SPC25YER018C 666 nt13.38□□□□□ -0.27
NYV1Q12255 YMR244WYMR244W 1068 nt13.38□□□□□ -0.27
NYV1Q12255 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt13.36□□□□□ -0.27
NYV1Q12255 DDR2YOL052C-A 186 nt13.33□□□□□ -0.28
NYV1Q12255 ATF2YGR177C 1608 nt13.32□□□□□ -0.28
NYV1Q12255 VPS60YDR486C 690 nt13.32□□□□□ -0.28
NYV1Q12255 SWC5YBR231C 912 nt13.32□□□□□ -0.28
NYV1Q12255 GPI16YHR188C 1833 nt13.3□□□□□ -0.28
NYV1Q12255 VPS75YNL246W 795 nt13.3□□□□□ -0.28
NYV1Q12255 YHL050CYHL050C 2094 nt13.3□□□□□ -0.28
NYV1Q12255 DAT1YML113W 747 nt13.27□□□□□ -0.29
NYV1Q12255 ALG3YBL082C 1377 nt13.27□□□□□ -0.29
NYV1Q12255 YFL067WYFL067W 528 nt13.23□□□□□ -0.29
NYV1Q12255 GLR1YPL091W 1452 nt13.23□□□□□ -0.29
NYV1Q12255 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt13.22□□□□□ -0.29
NYV1Q12255 SPT8YLR055C 1809 nt13.21□□□□□ -0.29
NYV1Q12255 FEN2YCR028C 1539 nt13.21□□□□□ -0.29
NYV1Q12255 ERF2YLR246W 1080 nt13.19□□□□□ -0.3
NYV1Q12255 YGL034CYGL034C 366 nt13.18□□□□□ -0.3
NYV1Q12255 PAU7YAR020C 168 nt13.18□□□□□ -0.3
NYV1Q12255 ANP1YEL036C 1503 nt13.13□□□□□ -0.31
NYV1Q12255 CRR1YLR213C 1269 nt13.13□□□□□ -0.31
NYV1Q12255 UBA4YHR111W 1323 nt13.13□□□□□ -0.31
NYV1Q12255 RBG2YGR173W 1107 nt13.1□□□□□ -0.31
NYV1Q12255 YIR016WYIR016W 798 nt13.09□□□□□ -0.31
NYV1Q12255 NDI1YML120C 1542 nt13.08□□□□□ -0.32
NYV1Q12255 SNG1YGR197C 1644 nt13.07□□□□□ -0.32
NYV1Q12255 SHB17YKR043C 816 nt13.07□□□□□ -0.32
NYV1Q12255 YSR3YKR053C 1215 nt13.05□□□□□ -0.32
NYV1Q12255 XYL2YLR070C 1071 nt13.05□□□□□ -0.32
NYV1Q12255 MIC10YCL057C-A 294 nt13.05□□□□□ -0.32
NYV1Q12255 TIM17YJL143W 477 nt13.04□□□□□ -0.32
NYV1Q12255 RBG1YAL036C 1110 nt13.04□□□□□ -0.32
NYV1Q12255 HEM12YDR047W 1089 nt13.02□□□□□ -0.33
NYV1Q12255 SHM2YLR058C 1410 nt12.97□□□□□ -0.33
NYV1Q12255 YDR010CYDR010C 333 nt12.96□□□□□ -0.33
NYV1Q12255 LYS4YDR234W 2082 nt12.94□□□□□ -0.34
NYV1Q12255 SEC11YIR022W 504 nt12.94□□□□□ -0.34
NYV1Q12255 NCP1YHR042W 2076 nt12.92□□□□□ -0.34
NYV1Q12255 SGT2YOR007C 1041 nt12.89□□□□□ -0.35
NYV1Q12255 XDJ1YLR090W 1380 nt12.89□□□□□ -0.35
NYV1Q12255 PHO89YBR296C 1725 nt12.88□□□□□ -0.35
NYV1Q12255 NIT1YIL164C 600 nt12.87□□□□□ -0.35
NYV1Q12255 RET2YFR051C 1641 nt12.82□□□□□ -0.36
NYV1Q12255 BDF1YLR399C 2061 nt12.81□□□□□ -0.36
NYV1Q12255 YMR226CYMR226C 804 nt12.81□□□□□ -0.36
NYV1Q12255 AIM45YPR004C 1035 nt12.81□□□□□ -0.36
NYV1Q12255 GDH3YAL062W 1374 nt12.81□□□□□ -0.36
NYV1Q12255 PCH2YBR186W 1695 nt12.8□□□□□ -0.36
NYV1Q12255 YCR087WYCR087W 516 nt12.79□□□□□ -0.36
NYV1Q12255 SAM1YLR180W 1149 nt12.78□□□□□ -0.36
NYV1Q12255 RPM1RPM1 483 nt12.78□□□□□ -0.36
NYV1Q12255 BNA2YJR078W 1362 nt12.77□□□□□ -0.37
NYV1Q12255 MIC12YBR262C 321 nt12.72□□□□□ -0.37
NYV1Q12255 MRP20YDR405W 792 nt12.7□□□□□ -0.38
NYV1Q12255 COQ2YNR041C 1119 nt12.7□□□□□ -0.38
NYV1Q12255 GUT2YIL155C 1950 nt12.7□□□□□ -0.38
NYV1Q12255 BOP3YNL042W 1191 nt12.69□□□□□ -0.38
NYV1Q12255 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt12.68□□□□□ -0.38
NYV1Q12255 RAD51YER095W 1203 nt12.66□□□□□ -0.38
NYV1Q12255 HHO1YPL127C 777 nt12.66□□□□□ -0.38
NYV1Q12255 TAT1YBR069C 1860 nt12.65□□□□□ -0.38
NYV1Q12255 YLR111WYLR111W 333 nt12.64□□□□□ -0.39
NYV1Q12255 RTF1YGL244W 1677 nt12.63□□□□□ -0.39
NYV1Q12255 AVT6YER119C 1347 nt12.62□□□□□ -0.39
NYV1Q12255 RAX1YOR301W 1308 nt12.61□□□□□ -0.39
NYV1Q12255 SFA1YDL168W 1161 nt12.6□□□□□ -0.39
NYV1Q12255 YGR201CYGR201C 678 nt12.6□□□□□ -0.39
NYV1Q12255 PIB2YGL023C 1908 nt12.56□□□□□ -0.4
NYV1Q12255 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt12.53□□□□□ -0.4
NYV1Q12255 GOR1YNL274C 1053 nt12.51□□□□□ -0.41
NYV1Q12255 YNR029CYNR029C 1290 nt12.51□□□□□ -0.41
NYV1Q12255 SDH5YOL071W 489 nt12.51□□□□□ -0.41
NYV1Q12255 DUT1YBR252W 444 nt12.49□□□□□ -0.41
NYV1Q12255 YCR102CYCR102C 1107 nt12.48□□□□□ -0.41
NYV1Q12255 RPL4BYDR012W 1089 nt12.48□□□□□ -0.41
NYV1Q12255 RPL4AYBR031W 1089 nt12.48□□□□□ -0.41
NYV1Q12255 PTK1YKL198C 1989 nt12.45□□□□□ -0.42
NYV1Q12255 RPS14BYJL191W 417 nt12.44□□□□□ -0.42
NYV1Q12255 CAB5YDR196C 726 nt12.43□□□□□ -0.42
NYV1Q12255 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt12.43□□□□□ -0.42
NYV1Q12255 STE4YOR212W 1272 nt12.43□□□□□ -0.42
NYV1Q12255 RAD23YEL037C 1197 nt12.41□□□□□ -0.42
NYV1Q12255 CLB6YGR109C 1143 nt12.4□□□□□ -0.42
NYV1Q12255 SHH4YLR164W 507 nt12.4□□□□□ -0.42
NYV1Q12255 YLR349WYLR349W 507 nt12.38□□□□□ -0.43
NYV1Q12255 AGP1YCL025C 1902 nt12.38□□□□□ -0.43
NYV1Q12255 TOM6YOR045W 186 nt12.35□□□□□ -0.43
NYV1Q12255 ADH7YCR105W 1086 nt12.33□□□□□ -0.44
NYV1Q12255 PAU15YIR041W 375 nt12.33□□□□□ -0.44
NYV1Q12255 YGR012WYGR012W 1182 nt12.32□□□□□ -0.44
NYV1Q12255 UTH1YKR042W 1098 nt12.32□□□□□ -0.44
NYV1Q12255 YFL054CYFL054C 1941 nt12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 95.5 ms