Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	Q12045	HEM12	YDR047W	1089 nt		10.47	□□□□□ -0.73
VIK1	Q12045	YKR040C	YKR040C	504 nt		10.47	□□□□□ -0.73
VIK1	Q12045	CMP2	YML057W	1815 nt		10.47	□□□□□ -0.73
VIK1	Q12045	PBP1	YGR178C	2169 nt		10.46	□□□□□ -0.73
VIK1	Q12045	CCA1	YER168C	1641 nt		10.46	□□□□□ -0.74
VIK1	Q12045	FRD1	YEL047C	1413 nt		10.45	□□□□□ -0.74
VIK1	Q12045	LPX1	YOR084W	1164 nt		10.44	□□□□□ -0.74
VIK1	Q12045	YFL067W	YFL067W	528 nt		10.43	□□□□□ -0.74
VIK1	Q12045	ATF2	YGR177C	1608 nt		10.43	□□□□□ -0.74
VIK1	Q12045	RAX1	YOR301W	1308 nt		10.42	□□□□□ -0.74
VIK1	Q12045	SNF1	YDR477W	1902 nt		10.42	□□□□□ -0.74
VIK1	Q12045	YKR005C	YKR005C	1578 nt		10.42	□□□□□ -0.74
VIK1	Q12045	MIC10	YCL057C-A	294 nt		10.41	□□□□□ -0.74
VIK1	Q12045	FTR1	YER145C	1215 nt		10.4	□□□□□ -0.74
VIK1	Q12045	SNG1	YGR197C	1644 nt		10.39	□□□□□ -0.75
VIK1	Q12045	DIC1	YLR348C	897 nt		10.36	□□□□□ -0.75
VIK1	Q12045	GAL1	YBR020W	1587 nt		10.35	□□□□□ -0.75
VIK1	Q12045	DDR2	YOL052C-A	186 nt		10.35	□□□□□ -0.75
VIK1	Q12045	TRM5	YHR070W	1500 nt		10.34	□□□□□ -0.75
VIK1	Q12045	IRC24	YIR036C	792 nt		10.31	□□□□□ -0.76
VIK1	Q12045	WSC2	YNL283C	1512 nt		10.3	□□□□□ -0.76
VIK1	Q12045	YDL086C-A	YDL086C-A	435 nt		10.3	□□□□□ -0.76
VIK1	Q12045	YGR259C	YGR259C	441 nt		10.28	□□□□□ -0.76
VIK1	Q12045	AQY1	YPR192W	918 nt		10.28	□□□□□ -0.76
VIK1	Q12045	BNA2	YJR078W	1362 nt		10.26	□□□□□ -0.77
VIK1	Q12045	ANP1	YEL036C	1503 nt		10.26	□□□□□ -0.77
VIK1	Q12045	HSL7	YBR133C	2484 nt		10.25	□□□□□ -0.77
VIK1	Q12045	NDI1	YML120C	1542 nt		10.21	□□□□□ -0.78
VIK1	Q12045	YCL074W	YCL074W	927 nt		10.2	□□□□□ -0.78
VIK1	Q12045	DUS1	YML080W	1272 nt		10.2	□□□□□ -0.78
VIK1	Q12045	MIC12	YBR262C	321 nt		10.2	□□□□□ -0.78
VIK1	Q12045	STB1	YNL309W	1263 nt		10.19	□□□□□ -0.78
VIK1	Q12045	YDR524C-B	YDR524C-B	201 nt		10.18	□□□□□ -0.78
VIK1	Q12045	SPC25	YER018C	666 nt		10.18	□□□□□ -0.78
VIK1	Q12045	YAT1	YAR035W	2064 nt		10.16	□□□□□ -0.78
VIK1	Q12045	YLR235C	YLR235C	399 nt		10.16	□□□□□ -0.78
VIK1	Q12045	TIM23	YNR017W	669 nt		10.15	□□□□□ -0.78
VIK1	Q12045	FEN2	YCR028C	1539 nt		10.15	□□□□□ -0.78
VIK1	Q12045	GPI16	YHR188C	1833 nt		10.14	□□□□□ -0.79
VIK1	Q12045	PTH1	YHR189W	573 nt		10.13	□□□□□ -0.79
VIK1	Q12045	YLR179C	YLR179C	606 nt		10.12	□□□□□ -0.79
VIK1	Q12045	HHO1	YPL127C	777 nt		10.12	□□□□□ -0.79
VIK1	Q12045	AGP1	YCL025C	1902 nt		10.11	□□□□□ -0.79
VIK1	Q12045	YIR016W	YIR016W	798 nt		10.07	□□□□□ -0.8
VIK1	Q12045	VPS60	YDR486C	690 nt		10.06	□□□□□ -0.8
VIK1	Q12045	YGR201C	YGR201C	678 nt		10.05	□□□□□ -0.8
VIK1	Q12045	SPT20	YOL148C	1815 nt		10.05	□□□□□ -0.8
VIK1	Q12045	CCT4	YDL143W	1587 nt		10.05	□□□□□ -0.8
VIK1	Q12045	HEL2	YDR266C	1920 nt		10.04	□□□□□ -0.8
VIK1	Q12045	AHT1	YHR093W	549 nt		10.03	□□□□□ -0.8
VIK1	Q12045	SPP1	YPL138C	1062 nt		10.02	□□□□□ -0.81
VIK1	Q12045	SWC5	YBR231C	912 nt		10.01	□□□□□ -0.81
VIK1	Q12045	YKL030W	YKL030W	606 nt		9.99	□□□□□ -0.81
VIK1	Q12045	RDN25-1	RDN25-1	3396 nt		9.99	□□□□□ -0.81
VIK1	Q12045	RDN25-2	RDN25-2	3396 nt		9.99	□□□□□ -0.81
VIK1	Q12045	ALG3	YBL082C	1377 nt		9.99	□□□□□ -0.81
VIK1	Q12045	XDJ1	YLR090W	1380 nt		9.98	□□□□□ -0.81
VIK1	Q12045	YPR064W	YPR064W	420 nt		9.97	□□□□□ -0.81
VIK1	Q12045	INA1	YLR413W	2028 nt		9.94	□□□□□ -0.82
VIK1	Q12045	STR3	YGL184C	1398 nt		9.92	□□□□□ -0.82
VIK1	Q12045	RDN18-1	RDN18-1	1800 nt		9.91	□□□□□ -0.82
VIK1	Q12045	RDN18-2	RDN18-2	1800 nt		9.91	□□□□□ -0.82
VIK1	Q12045	RIM8	YGL045W	1629 nt		9.9	□□□□□ -0.82
VIK1	Q12045	TAD3	YLR316C	969 nt		9.89	□□□□□ -0.83
VIK1	Q12045	RPC82	YPR190C	1965 nt		9.88	□□□□□ -0.83
VIK1	Q12045	MOT3	YMR070W	1473 nt		9.88	□□□□□ -0.83
VIK1	Q12045	GOR1	YNL274C	1053 nt		9.88	□□□□□ -0.83
VIK1	Q12045	DUT1	YBR252W	444 nt		9.87	□□□□□ -0.83
VIK1	Q12045	AVT6	YER119C	1347 nt		9.86	□□□□□ -0.83
VIK1	Q12045	AQY2	YLL052C	450 nt		9.85	□□□□□ -0.83
VIK1	Q12045	GDH3	YAL062W	1374 nt		9.85	□□□□□ -0.83
VIK1	Q12045	RTN2	YDL204W	1182 nt		9.84	□□□□□ -0.83
VIK1	Q12045	YGL114W	YGL114W	2178 nt		9.81	□□□□□ -0.84
VIK1	Q12045	YLR415C	YLR415C	339 nt		9.77	□□□□□ -0.85
VIK1	Q12045	BDH1	YAL060W	1149 nt		9.76	□□□□□ -0.85
VIK1	Q12045	SHM2	YLR058C	1410 nt		9.73	□□□□□ -0.85
VIK1	Q12045	MUP1	YGR055W	1725 nt		9.73	□□□□□ -0.85
VIK1	Q12045	TIM17	YJL143W	477 nt		9.72	□□□□□ -0.85
VIK1	Q12045	MAE1	YKL029C	2010 nt		9.72	□□□□□ -0.85
VIK1	Q12045	tL(GAG)G	tL(GAG)G	82 nt		9.7	□□□□□ -0.86
VIK1	Q12045	HIF1	YLL022C	1158 nt		9.7	□□□□□ -0.86
VIK1	Q12045	DAT1	YML113W	747 nt		9.69	□□□□□ -0.86
VIK1	Q12045	MET2	YNL277W	1461 nt		9.68	□□□□□ -0.86
VIK1	Q12045	SSN3	YPL042C	1668 nt		9.67	□□□□□ -0.86
VIK1	Q12045	ALD4	YOR374W	1560 nt		9.67	□□□□□ -0.86
VIK1	Q12045	RTG1	YOL067C	534 nt		9.66	□□□□□ -0.86
VIK1	Q12045	FRE6	YLL051C	2139 nt		9.63	□□□□□ -0.87
VIK1	Q12045	YCR102C	YCR102C	1107 nt		9.62	□□□□□ -0.87
VIK1	Q12045	NIT1	YIL164C	600 nt		9.62	□□□□□ -0.87
VIK1	Q12045	YSP3	YOR003W	1437 nt		9.62	□□□□□ -0.87
VIK1	Q12045	ARP6	YLR085C	1317 nt		9.61	□□□□□ -0.87
VIK1	Q12045	NBP35	YGL091C	987 nt		9.61	□□□□□ -0.87
VIK1	Q12045	PLB1	YMR008C	1995 nt		9.61	□□□□□ -0.87
VIK1	Q12045	HOL1	YNR055C	1761 nt		9.6	□□□□□ -0.87
VIK1	Q12045	PRM5	YIL117C	957 nt		9.58	□□□□□ -0.88
VIK1	Q12045	SGT2	YOR007C	1041 nt		9.57	□□□□□ -0.88
VIK1	Q12045	HUA1	YGR268C	597 nt		9.55	□□□□□ -0.88
VIK1	Q12045	ZRT3	YKL175W	1512 nt		9.55	□□□□□ -0.88
VIK1	Q12045	ACO2	YJL200C	2370 nt		9.53	□□□□□ -0.88
VIK1	Q12045	YNL115C	YNL115C	1935 nt		9.5	□□□□□ -0.89

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