Protein–RNA interactions for Protein: Q07887

LDB18, Protein LDB18, yeastyeast

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LDB18Q07887 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.07□□□□□ -0.64
LDB18Q07887 TAD3YLR316C 969 nt11.07□□□□□ -0.64
LDB18Q07887 DDR2YOL052C-A 186 nt11.07□□□□□ -0.64
LDB18Q07887 LYS4YDR234W 2082 nt11.04□□□□□ -0.64
LDB18Q07887 STB1YNL309W 1263 nt11.03□□□□□ -0.64
LDB18Q07887 PTK1YKL198C 1989 nt11.03□□□□□ -0.64
LDB18Q07887 SPC25YER018C 666 nt11.01□□□□□ -0.65
LDB18Q07887 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11□□□□□ -0.65
LDB18Q07887 HEM12YDR047W 1089 nt10.99□□□□□ -0.65
LDB18Q07887 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.99□□□□□ -0.65
LDB18Q07887 GPI16YHR188C 1833 nt10.98□□□□□ -0.65
LDB18Q07887 YDR094WYDR094W 336 nt10.98□□□□□ -0.65
LDB18Q07887 CCT4YDL143W 1587 nt10.96□□□□□ -0.65
LDB18Q07887 UBX6YJL048C 1191 nt10.96□□□□□ -0.65
LDB18Q07887 SNG1YGR197C 1644 nt10.95□□□□□ -0.66
LDB18Q07887 ANP1YEL036C 1503 nt10.94□□□□□ -0.66
LDB18Q07887 MIC10YCL057C-A 294 nt10.92□□□□□ -0.66
LDB18Q07887 FEN2YCR028C 1539 nt10.91□□□□□ -0.66
LDB18Q07887 VPS60YDR486C 690 nt10.9□□□□□ -0.66
LDB18Q07887 SWC5YBR231C 912 nt10.9□□□□□ -0.66
LDB18Q07887 YFL054CYFL054C 1941 nt10.88□□□□□ -0.67
LDB18Q07887 YFR018CYFR018C 1092 nt10.87□□□□□ -0.67
LDB18Q07887 BDH1YAL060W 1149 nt10.87□□□□□ -0.67
LDB18Q07887 YLR415CYLR415C 339 nt10.87□□□□□ -0.67
LDB18Q07887 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.84□□□□□ -0.67
LDB18Q07887 ALG3YBL082C 1377 nt10.83□□□□□ -0.68
LDB18Q07887 YIR016WYIR016W 798 nt10.81□□□□□ -0.68
LDB18Q07887 YSP3YOR003W 1437 nt10.81□□□□□ -0.68
LDB18Q07887 BNA2YJR078W 1362 nt10.79□□□□□ -0.68
LDB18Q07887 PEX25YPL112C 1185 nt10.79□□□□□ -0.68
LDB18Q07887 RAX1YOR301W 1308 nt10.79□□□□□ -0.68
LDB18Q07887 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.77□□□□□ -0.69
LDB18Q07887 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.77□□□□□ -0.69
LDB18Q07887 RRT5YFR032C 870 nt10.77□□□□□ -0.69
LDB18Q07887 SPT8YLR055C 1809 nt10.75□□□□□ -0.69
LDB18Q07887 YNL115CYNL115C 1935 nt10.74□□□□□ -0.69
LDB18Q07887 YFL066CYFL066C 1179 nt10.73□□□□□ -0.69
LDB18Q07887 PRE6YOL038W 765 nt10.73□□□□□ -0.69
LDB18Q07887 MIC12YBR262C 321 nt10.72□□□□□ -0.69
LDB18Q07887 PAU16YKL224C 372 nt10.7□□□□□ -0.7
LDB18Q07887 TIM17YJL143W 477 nt10.65□□□□□ -0.7
LDB18Q07887 VPS75YNL246W 795 nt10.65□□□□□ -0.7
LDB18Q07887 HHO1YPL127C 777 nt10.65□□□□□ -0.7
LDB18Q07887 SWE1YJL187C 2460 nt10.63□□□□□ -0.71
LDB18Q07887 XDJ1YLR090W 1380 nt10.63□□□□□ -0.71
LDB18Q07887 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.62□□□□□ -0.71
LDB18Q07887 YGR201CYGR201C 678 nt10.62□□□□□ -0.71
LDB18Q07887 SHM2YLR058C 1410 nt10.59□□□□□ -0.71
LDB18Q07887 GDH3YAL062W 1374 nt10.57□□□□□ -0.72
LDB18Q07887 CCA1YER168C 1641 nt10.57□□□□□ -0.72
LDB18Q07887 GLK1YCL040W 1503 nt10.52□□□□□ -0.73
LDB18Q07887 PAU7YAR020C 168 nt10.51□□□□□ -0.73
LDB18Q07887 NAT4YMR069W 858 nt10.5□□□□□ -0.73
LDB18Q07887 AVT6YER119C 1347 nt10.5□□□□□ -0.73
LDB18Q07887 MIR1YJR077C 936 nt10.49□□□□□ -0.73
LDB18Q07887 NIT1YIL164C 600 nt10.48□□□□□ -0.73
LDB18Q07887 GOR1YNL274C 1053 nt10.48□□□□□ -0.73
LDB18Q07887 AGP1YCL025C 1902 nt10.48□□□□□ -0.73
LDB18Q07887 SGT2YOR007C 1041 nt10.47□□□□□ -0.73
LDB18Q07887 THI74YDR438W 1113 nt10.45□□□□□ -0.74
LDB18Q07887 MSF1YPR047W 1410 nt10.41□□□□□ -0.74
LDB18Q07887 DAT1YML113W 747 nt10.41□□□□□ -0.74
LDB18Q07887 DUS1YML080W 1272 nt10.4□□□□□ -0.74
LDB18Q07887 SHB17YKR043C 816 nt10.38□□□□□ -0.75
LDB18Q07887 DUT1YBR252W 444 nt10.38□□□□□ -0.75
LDB18Q07887 YCR102CYCR102C 1107 nt10.35□□□□□ -0.75
LDB18Q07887 UBA4YHR111W 1323 nt10.34□□□□□ -0.75
LDB18Q07887 YDR010CYDR010C 333 nt10.33□□□□□ -0.76
LDB18Q07887 YCL074WYCL074W 927 nt10.32□□□□□ -0.76
LDB18Q07887 FUR4YBR021W 1902 nt10.29□□□□□ -0.76
LDB18Q07887 YSR3YKR053C 1215 nt10.29□□□□□ -0.76
LDB18Q07887 STR3YGL184C 1398 nt10.28□□□□□ -0.76
LDB18Q07887 RET2YFR051C 1641 nt10.28□□□□□ -0.76
LDB18Q07887 YGL034CYGL034C 366 nt10.26□□□□□ -0.77
LDB18Q07887 AQY2YLL052C 450 nt10.25□□□□□ -0.77
LDB18Q07887 PHO89YBR296C 1725 nt10.24□□□□□ -0.77
LDB18Q07887 YCR087WYCR087W 516 nt10.23□□□□□ -0.77
LDB18Q07887 NBP35YGL091C 987 nt10.23□□□□□ -0.77
LDB18Q07887 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.23□□□□□ -0.77
LDB18Q07887 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.23□□□□□ -0.77
LDB18Q07887 SBA1YKL117W 651 nt10.2□□□□□ -0.78
LDB18Q07887 XYL2YLR070C 1071 nt10.2□□□□□ -0.78
LDB18Q07887 UME6YDR207C 2511 nt10.2□□□□□ -0.78
LDB18Q07887 TIR3YIL011W 810 nt10.17□□□□□ -0.78
LDB18Q07887 SFA1YDL168W 1161 nt10.15□□□□□ -0.78
LDB18Q07887 MRP20YDR405W 792 nt10.15□□□□□ -0.78
LDB18Q07887 HSP60YLR259C 1719 nt10.14□□□□□ -0.79
LDB18Q07887 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.14□□□□□ -0.79
LDB18Q07887 AIM45YPR004C 1035 nt10.13□□□□□ -0.79
LDB18Q07887 RBG1YAL036C 1110 nt10.11□□□□□ -0.79
LDB18Q07887 COQ2YNR041C 1119 nt10.11□□□□□ -0.79
LDB18Q07887 RTN2YDL204W 1182 nt10.1□□□□□ -0.79
LDB18Q07887 LSC2YGR244C 1284 nt10.1□□□□□ -0.79
LDB18Q07887 SHH4YLR164W 507 nt10.1□□□□□ -0.79
LDB18Q07887 NDI1YML120C 1542 nt10.1□□□□□ -0.79
LDB18Q07887 YKR005CYKR005C 1578 nt10.09□□□□□ -0.79
LDB18Q07887 BOR1YNL275W 1731 nt10.09□□□□□ -0.79
LDB18Q07887 PRP4YPR178W 1398 nt10.09□□□□□ -0.79
LDB18Q07887 YGR259CYGR259C 441 nt10.08□□□□□ -0.8
LDB18Q07887 ARP6YLR085C 1317 nt10.07□□□□□ -0.8
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