Protein–RNA interactions for Protein: Q04712

RRN11, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN11, yeastyeast

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN11Q04712 YFR018CYFR018C 1092 nt10.45□□□□□ -0.74
RRN11Q04712 BIO4YNR057C 714 nt10.45□□□□□ -0.74
RRN11Q04712 NCP1YHR042W 2076 nt10.44□□□□□ -0.74
RRN11Q04712 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.43□□□□□ -0.74
RRN11Q04712 AHT1YHR093W 549 nt10.43□□□□□ -0.74
RRN11Q04712 FTR1YER145C 1215 nt10.42□□□□□ -0.74
RRN11Q04712 WSC2YNL283C 1512 nt10.4□□□□□ -0.74
RRN11Q04712 PAU16YKL224C 372 nt10.4□□□□□ -0.74
RRN11Q04712 GAL1YBR020W 1587 nt10.37□□□□□ -0.75
RRN11Q04712 DDR2YOL052C-A 186 nt10.36□□□□□ -0.75
RRN11Q04712 ERF2YLR246W 1080 nt10.35□□□□□ -0.75
RRN11Q04712 TRM5YHR070W 1500 nt10.33□□□□□ -0.76
RRN11Q04712 YFL067WYFL067W 528 nt10.33□□□□□ -0.76
RRN11Q04712 YLR415CYLR415C 339 nt10.32□□□□□ -0.76
RRN11Q04712 STB1YNL309W 1263 nt10.32□□□□□ -0.76
RRN11Q04712 GPI16YHR188C 1833 nt10.32□□□□□ -0.76
RRN11Q04712 PEX25YPL112C 1185 nt10.31□□□□□ -0.76
RRN11Q04712 SWC5YBR231C 912 nt10.31□□□□□ -0.76
RRN11Q04712 YFL054CYFL054C 1941 nt10.3□□□□□ -0.76
RRN11Q04712 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.29□□□□□ -0.76
RRN11Q04712 PRE6YOL038W 765 nt10.29□□□□□ -0.76
RRN11Q04712 SPC25YER018C 666 nt10.28□□□□□ -0.76
RRN11Q04712 CCT4YDL143W 1587 nt10.27□□□□□ -0.76
RRN11Q04712 NAT4YMR069W 858 nt10.24□□□□□ -0.77
RRN11Q04712 SPT8YLR055C 1809 nt10.23□□□□□ -0.77
RRN11Q04712 GLK1YCL040W 1503 nt10.23□□□□□ -0.77
RRN11Q04712 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.23□□□□□ -0.77
RRN11Q04712 BDH1YAL060W 1149 nt10.23□□□□□ -0.77
RRN11Q04712 CRR1YLR213C 1269 nt10.23□□□□□ -0.77
RRN11Q04712 ATF2YGR177C 1608 nt10.22□□□□□ -0.77
RRN11Q04712 YNL115CYNL115C 1935 nt10.22□□□□□ -0.77
RRN11Q04712 YFL066CYFL066C 1179 nt10.21□□□□□ -0.77
RRN11Q04712 YSP3YOR003W 1437 nt10.21□□□□□ -0.78
RRN11Q04712 ALG12YNR030W 1656 nt10.2□□□□□ -0.78
RRN11Q04712 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.19□□□□□ -0.78
RRN11Q04712 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.19□□□□□ -0.78
RRN11Q04712 HEM12YDR047W 1089 nt10.19□□□□□ -0.78
RRN11Q04712 VPS60YDR486C 690 nt10.19□□□□□ -0.78
RRN11Q04712 FEN2YCR028C 1539 nt10.16□□□□□ -0.78
RRN11Q04712 SSN3YPL042C 1668 nt10.15□□□□□ -0.79
RRN11Q04712 VPS75YNL246W 795 nt10.14□□□□□ -0.79
RRN11Q04712 ANP1YEL036C 1503 nt10.13□□□□□ -0.79
RRN11Q04712 PAU7YAR020C 168 nt10.12□□□□□ -0.79
RRN11Q04712 SNG1YGR197C 1644 nt10.11□□□□□ -0.79
RRN11Q04712 LYS4YDR234W 2082 nt10.1□□□□□ -0.79
RRN11Q04712 TIM17YJL143W 477 nt10.09□□□□□ -0.79
RRN11Q04712 ALG3YBL082C 1377 nt10.09□□□□□ -0.79
RRN11Q04712 SBA1YKL117W 651 nt10.08□□□□□ -0.8
RRN11Q04712 BNA2YJR078W 1362 nt10.08□□□□□ -0.8
RRN11Q04712 THI74YDR438W 1113 nt10.07□□□□□ -0.8
RRN11Q04712 MSF1YPR047W 1410 nt10.07□□□□□ -0.8
RRN11Q04712 SWE1YJL187C 2460 nt10.05□□□□□ -0.8
RRN11Q04712 YIR016WYIR016W 798 nt10.05□□□□□ -0.8
RRN11Q04712 MIC10YCL057C-A 294 nt10.04□□□□□ -0.8
RRN11Q04712 MIR1YJR077C 936 nt10.02□□□□□ -0.81
RRN11Q04712 GID7YCL039W 2238 nt9.97□□□□□ -0.81
RRN11Q04712 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt9.96□□□□□ -0.82
RRN11Q04712 MET2YNL277W 1461 nt9.96□□□□□ -0.82
RRN11Q04712 XDJ1YLR090W 1380 nt9.94□□□□□ -0.82
RRN11Q04712 RAX1YOR301W 1308 nt9.94□□□□□ -0.82
RRN11Q04712 HEL2YDR266C 1920 nt9.92□□□□□ -0.82
RRN11Q04712 SHM2YLR058C 1410 nt9.91□□□□□ -0.82
RRN11Q04712 FRE6YLL051C 2139 nt9.91□□□□□ -0.82
RRN11Q04712 DAT1YML113W 747 nt9.91□□□□□ -0.82
RRN11Q04712 HSP60YLR259C 1719 nt9.9□□□□□ -0.82
RRN11Q04712 HSL7YBR133C 2484 nt9.9□□□□□ -0.83
RRN11Q04712 UBA4YHR111W 1323 nt9.89□□□□□ -0.83
RRN11Q04712 YSR3YKR053C 1215 nt9.89□□□□□ -0.83
RRN11Q04712 NAR1YNL240C 1476 nt9.88□□□□□ -0.83
RRN11Q04712 YGR201CYGR201C 678 nt9.88□□□□□ -0.83
RRN11Q04712 HHO1YPL127C 777 nt9.88□□□□□ -0.83
RRN11Q04712 MIC12YBR262C 321 nt9.88□□□□□ -0.83
RRN11Q04712 GDH3YAL062W 1374 nt9.88□□□□□ -0.83
RRN11Q04712 SHB17YKR043C 816 nt9.87□□□□□ -0.83
RRN11Q04712 YAT1YAR035W 2064 nt9.87□□□□□ -0.83
RRN11Q04712 YGL034CYGL034C 366 nt9.86□□□□□ -0.83
RRN11Q04712 YCR087WYCR087W 516 nt9.85□□□□□ -0.83
RRN11Q04712 SGT2YOR007C 1041 nt9.84□□□□□ -0.83
RRN11Q04712 SFP1YLR403W 2052 nt9.84□□□□□ -0.83
RRN11Q04712 CMP2YML057W 1815 nt9.84□□□□□ -0.83
RRN11Q04712 NPP1YCR026C 2229 nt9.83□□□□□ -0.84
RRN11Q04712 GLR1YPL091W 1452 nt9.82□□□□□ -0.84
RRN11Q04712 AVT6YER119C 1347 nt9.8□□□□□ -0.84
RRN11Q04712 NDI1YML120C 1542 nt9.79□□□□□ -0.84
RRN11Q04712 GOR1YNL274C 1053 nt9.79□□□□□ -0.84
RRN11Q04712 PHO89YBR296C 1725 nt9.77□□□□□ -0.85
RRN11Q04712 NIT1YIL164C 600 nt9.77□□□□□ -0.85
RRN11Q04712 FUR4YBR021W 1902 nt9.77□□□□□ -0.85
RRN11Q04712 RBG1YAL036C 1110 nt9.76□□□□□ -0.85
RRN11Q04712 YMR244WYMR244W 1068 nt9.76□□□□□ -0.85
RRN11Q04712 CCA1YER168C 1641 nt9.75□□□□□ -0.85
RRN11Q04712 XYL2YLR070C 1071 nt9.75□□□□□ -0.85
RRN11Q04712 RET2YFR051C 1641 nt9.74□□□□□ -0.85
RRN11Q04712 YDR010CYDR010C 333 nt9.73□□□□□ -0.85
RRN11Q04712 MRP20YDR405W 792 nt9.73□□□□□ -0.85
RRN11Q04712 AIM45YPR004C 1035 nt9.71□□□□□ -0.86
RRN11Q04712 YCR102CYCR102C 1107 nt9.7□□□□□ -0.86
RRN11Q04712 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.7□□□□□ -0.86
RRN11Q04712 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.7□□□□□ -0.86
RRN11Q04712 BSP1YPR171W 1731 nt9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.7 ms