Protein–RNA interactions for Protein: Q04121

NHX1, Endosomal/prevacuolar sodium/hydrogen exchanger, yeastyeast

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NHX1Q04121 MIC10YCL057C-A 294 nt11.02□□□□□ -0.65
NHX1Q04121 WSC2YNL283C 1512 nt11.02□□□□□ -0.65
NHX1Q04121 SNG1YGR197C 1644 nt11.02□□□□□ -0.65
NHX1Q04121 ADO1YJR105W 1023 nt11.01□□□□□ -0.65
NHX1Q04121 HUA1YGR268C 597 nt11□□□□□ -0.65
NHX1Q04121 AHT1YHR093W 549 nt11□□□□□ -0.65
NHX1Q04121 YPR064WYPR064W 420 nt10.99□□□□□ -0.65
NHX1Q04121 SPT8YLR055C 1809 nt10.99□□□□□ -0.65
NHX1Q04121 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.98□□□□□ -0.65
NHX1Q04121 STB1YNL309W 1263 nt10.98□□□□□ -0.65
NHX1Q04121 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.97□□□□□ -0.65
NHX1Q04121 SPC25YER018C 666 nt10.96□□□□□ -0.65
NHX1Q04121 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.96□□□□□ -0.65
NHX1Q04121 ANP1YEL036C 1503 nt10.94□□□□□ -0.66
NHX1Q04121 TAD3YLR316C 969 nt10.92□□□□□ -0.66
NHX1Q04121 GPI16YHR188C 1833 nt10.92□□□□□ -0.66
NHX1Q04121 CCT4YDL143W 1587 nt10.9□□□□□ -0.67
NHX1Q04121 FEN2YCR028C 1539 nt10.89□□□□□ -0.67
NHX1Q04121 VPS60YDR486C 690 nt10.88□□□□□ -0.67
NHX1Q04121 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.87□□□□□ -0.67
NHX1Q04121 YJL225CYJL225C 5277 nt10.86□□□□□ -0.67
NHX1Q04121 RAX1YOR301W 1308 nt10.85□□□□□ -0.67
NHX1Q04121 SWE1YJL187C 2460 nt10.85□□□□□ -0.67
NHX1Q04121 ALG3YBL082C 1377 nt10.83□□□□□ -0.68
NHX1Q04121 SWC5YBR231C 912 nt10.83□□□□□ -0.68
NHX1Q04121 BNA2YJR078W 1362 nt10.8□□□□□ -0.68
NHX1Q04121 YIR016WYIR016W 798 nt10.8□□□□□ -0.68
NHX1Q04121 BDH1YAL060W 1149 nt10.78□□□□□ -0.68
NHX1Q04121 MIC12YBR262C 321 nt10.77□□□□□ -0.69
NHX1Q04121 YLR415CYLR415C 339 nt10.74□□□□□ -0.69
NHX1Q04121 CCA1YER168C 1641 nt10.73□□□□□ -0.69
NHX1Q04121 YSP3YOR003W 1437 nt10.69□□□□□ -0.7
NHX1Q04121 HHO1YPL127C 777 nt10.66□□□□□ -0.7
NHX1Q04121 YGR201CYGR201C 678 nt10.62□□□□□ -0.71
NHX1Q04121 PEX25YPL112C 1185 nt10.62□□□□□ -0.71
NHX1Q04121 XDJ1YLR090W 1380 nt10.62□□□□□ -0.71
NHX1Q04121 YNL115CYNL115C 1935 nt10.62□□□□□ -0.71
NHX1Q04121 AGP1YCL025C 1902 nt10.62□□□□□ -0.71
NHX1Q04121 YDR094WYDR094W 336 nt10.61□□□□□ -0.71
NHX1Q04121 YFR018CYFR018C 1092 nt10.61□□□□□ -0.71
NHX1Q04121 YFL066CYFL066C 1179 nt10.59□□□□□ -0.71
NHX1Q04121 UBX6YJL048C 1191 nt10.58□□□□□ -0.72
NHX1Q04121 NME1NME1 340 nt10.57□□□□□ -0.72
NHX1Q04121 TIM17YJL143W 477 nt10.56□□□□□ -0.72
NHX1Q04121 PRE6YOL038W 765 nt10.56□□□□□ -0.72
NHX1Q04121 SHM2YLR058C 1410 nt10.56□□□□□ -0.72
NHX1Q04121 GDH3YAL062W 1374 nt10.55□□□□□ -0.72
NHX1Q04121 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.53□□□□□ -0.72
NHX1Q04121 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.53□□□□□ -0.72
NHX1Q04121 FUR4YBR021W 1902 nt10.51□□□□□ -0.73
NHX1Q04121 DUS1YML080W 1272 nt10.51□□□□□ -0.73
NHX1Q04121 AVT6YER119C 1347 nt10.51□□□□□ -0.73
NHX1Q04121 DUT1YBR252W 444 nt10.5□□□□□ -0.73
NHX1Q04121 VPS75YNL246W 795 nt10.48□□□□□ -0.73
NHX1Q04121 RRT5YFR032C 870 nt10.47□□□□□ -0.73
NHX1Q04121 GOR1YNL274C 1053 nt10.47□□□□□ -0.73
NHX1Q04121 NIT1YIL164C 600 nt10.45□□□□□ -0.74
NHX1Q04121 HSP60YLR259C 1719 nt10.44□□□□□ -0.74
NHX1Q04121 PAU16YKL224C 372 nt10.44□□□□□ -0.74
NHX1Q04121 SGT2YOR007C 1041 nt10.43□□□□□ -0.74
NHX1Q04121 BOR1YNL275W 1731 nt10.43□□□□□ -0.74
NHX1Q04121 GLK1YCL040W 1503 nt10.43□□□□□ -0.74
NHX1Q04121 YCL074WYCL074W 927 nt10.42□□□□□ -0.74
NHX1Q04121 DAT1YML113W 747 nt10.39□□□□□ -0.75
NHX1Q04121 STR3YGL184C 1398 nt10.38□□□□□ -0.75
NHX1Q04121 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.36□□□□□ -0.75
NHX1Q04121 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.36□□□□□ -0.75
NHX1Q04121 PAU7YAR020C 168 nt10.34□□□□□ -0.75
NHX1Q04121 UME6YDR207C 2511 nt10.34□□□□□ -0.75
NHX1Q04121 AQY2YLL052C 450 nt10.33□□□□□ -0.76
NHX1Q04121 RPM1RPM1 483 nt10.32□□□□□ -0.76
NHX1Q04121 PRP4YPR178W 1398 nt10.31□□□□□ -0.76
NHX1Q04121 MIR1YJR077C 936 nt10.31□□□□□ -0.76
NHX1Q04121 YCR102CYCR102C 1107 nt10.3□□□□□ -0.76
NHX1Q04121 YKR005CYKR005C 1578 nt10.28□□□□□ -0.76
NHX1Q04121 SHB17YKR043C 816 nt10.26□□□□□ -0.77
NHX1Q04121 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.25□□□□□ -0.77
NHX1Q04121 NBP35YGL091C 987 nt10.25□□□□□ -0.77
NHX1Q04121 YGR259CYGR259C 441 nt10.24□□□□□ -0.77
NHX1Q04121 DPS1YLL018C 1674 nt10.23□□□□□ -0.77
NHX1Q04121 YDR010CYDR010C 333 nt10.23□□□□□ -0.77
NHX1Q04121 THI74YDR438W 1113 nt10.23□□□□□ -0.77
NHX1Q04121 NAT4YMR069W 858 nt10.22□□□□□ -0.77
NHX1Q04121 BMT6YLR063W 1098 nt10.21□□□□□ -0.77
NHX1Q04121 UBA4YHR111W 1323 nt10.19□□□□□ -0.78
NHX1Q04121 RTN2YDL204W 1182 nt10.18□□□□□ -0.78
NHX1Q04121 MSF1YPR047W 1410 nt10.16□□□□□ -0.78
NHX1Q04121 AAC1YMR056C 930 nt10.15□□□□□ -0.78
NHX1Q04121 RET2YFR051C 1641 nt10.15□□□□□ -0.79
NHX1Q04121 TIR3YIL011W 810 nt10.13□□□□□ -0.79
NHX1Q04121 SHH4YLR164W 507 nt10.13□□□□□ -0.79
NHX1Q04121 YSR3YKR053C 1215 nt10.12□□□□□ -0.79
NHX1Q04121 PHO89YBR296C 1725 nt10.11□□□□□ -0.79
NHX1Q04121 ARP6YLR085C 1317 nt10.1□□□□□ -0.79
NHX1Q04121 SFA1YDL168W 1161 nt10.1□□□□□ -0.79
NHX1Q04121 IRC24YIR036C 792 nt10.09□□□□□ -0.79
NHX1Q04121 SNF1YDR477W 1902 nt10.08□□□□□ -0.8
NHX1Q04121 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.08□□□□□ -0.8
NHX1Q04121 PLB1YMR008C 1995 nt10.08□□□□□ -0.8
NHX1Q04121 ALG12YNR030W 1656 nt10.06□□□□□ -0.8
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