Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYF1Q04048 YLR415CYLR415C 339 nt13.19□□□□□ -0.3
SYF1Q04048 TRM5YHR070W 1500 nt13.18□□□□□ -0.3
SYF1Q04048 STB1YNL309W 1263 nt13.14□□□□□ -0.31
SYF1Q04048 MSF1YPR047W 1410 nt13.13□□□□□ -0.31
SYF1Q04048 CCT4YDL143W 1587 nt13.11□□□□□ -0.31
SYF1Q04048 SPC25YER018C 666 nt13.1□□□□□ -0.31
SYF1Q04048 THI74YDR438W 1113 nt13.08□□□□□ -0.32
SYF1Q04048 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt13.08□□□□□ -0.32
SYF1Q04048 DDR2YOL052C-A 186 nt13.07□□□□□ -0.32
SYF1Q04048 MIR1YJR077C 936 nt13.06□□□□□ -0.32
SYF1Q04048 YHL050CYHL050C 2094 nt13.05□□□□□ -0.32
SYF1Q04048 GPI16YHR188C 1833 nt13.05□□□□□ -0.32
SYF1Q04048 SWC5YBR231C 912 nt13.05□□□□□ -0.32
SYF1Q04048 ATF2YGR177C 1608 nt13.03□□□□□ -0.32
SYF1Q04048 VPS60YDR486C 690 nt13.01□□□□□ -0.33
SYF1Q04048 VPS75YNL246W 795 nt13□□□□□ -0.33
SYF1Q04048 YFL067WYFL067W 528 nt12.99□□□□□ -0.33
SYF1Q04048 YMR244WYMR244W 1068 nt12.97□□□□□ -0.33
SYF1Q04048 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt12.96□□□□□ -0.33
SYF1Q04048 ERF2YLR246W 1080 nt12.96□□□□□ -0.33
SYF1Q04048 ALG3YBL082C 1377 nt12.95□□□□□ -0.34
SYF1Q04048 FEN2YCR028C 1539 nt12.93□□□□□ -0.34
SYF1Q04048 SPT8YLR055C 1809 nt12.91□□□□□ -0.34
SYF1Q04048 PAU7YAR020C 168 nt12.91□□□□□ -0.34
SYF1Q04048 DAT1YML113W 747 nt12.91□□□□□ -0.34
SYF1Q04048 CRR1YLR213C 1269 nt12.87□□□□□ -0.35
SYF1Q04048 ANP1YEL036C 1503 nt12.87□□□□□ -0.35
SYF1Q04048 GLR1YPL091W 1452 nt12.85□□□□□ -0.35
SYF1Q04048 YGL034CYGL034C 366 nt12.82□□□□□ -0.36
SYF1Q04048 YIR016WYIR016W 798 nt12.81□□□□□ -0.36
SYF1Q04048 SNG1YGR197C 1644 nt12.8□□□□□ -0.36
SYF1Q04048 UBA4YHR111W 1323 nt12.8□□□□□ -0.36
SYF1Q04048 SEC11YIR022W 504 nt12.79□□□□□ -0.36
SYF1Q04048 TIM17YJL143W 477 nt12.79□□□□□ -0.36
SYF1Q04048 HEM12YDR047W 1089 nt12.78□□□□□ -0.36
SYF1Q04048 MIC10YCL057C-A 294 nt12.76□□□□□ -0.37
SYF1Q04048 SHB17YKR043C 816 nt12.74□□□□□ -0.37
SYF1Q04048 NDI1YML120C 1542 nt12.73□□□□□ -0.37
SYF1Q04048 YSR3YKR053C 1215 nt12.73□□□□□ -0.37
SYF1Q04048 RBG2YGR173W 1107 nt12.72□□□□□ -0.37
SYF1Q04048 RBG1YAL036C 1110 nt12.7□□□□□ -0.38
SYF1Q04048 XYL2YLR070C 1071 nt12.7□□□□□ -0.38
SYF1Q04048 SHM2YLR058C 1410 nt12.69□□□□□ -0.38
SYF1Q04048 NCP1YHR042W 2076 nt12.68□□□□□ -0.38
SYF1Q04048 LYS4YDR234W 2082 nt12.67□□□□□ -0.38
SYF1Q04048 BDF1YLR399C 2061 nt12.63□□□□□ -0.39
SYF1Q04048 PCH2YBR186W 1695 nt12.62□□□□□ -0.39
SYF1Q04048 YDR010CYDR010C 333 nt12.62□□□□□ -0.39
SYF1Q04048 XDJ1YLR090W 1380 nt12.61□□□□□ -0.39
SYF1Q04048 SGT2YOR007C 1041 nt12.6□□□□□ -0.39
SYF1Q04048 PHO89YBR296C 1725 nt12.57□□□□□ -0.4
SYF1Q04048 BNA2YJR078W 1362 nt12.56□□□□□ -0.4
SYF1Q04048 PAC11YDR488C 1602 nt12.56□□□□□ -0.4
SYF1Q04048 NIT1YIL164C 600 nt12.55□□□□□ -0.4
SYF1Q04048 GDH3YAL062W 1374 nt12.54□□□□□ -0.4
SYF1Q04048 RET2YFR051C 1641 nt12.52□□□□□ -0.4
SYF1Q04048 YCR087WYCR087W 516 nt12.52□□□□□ -0.41
SYF1Q04048 BOP3YNL042W 1191 nt12.52□□□□□ -0.41
SYF1Q04048 GUT2YIL155C 1950 nt12.51□□□□□ -0.41
SYF1Q04048 YMR226CYMR226C 804 nt12.5□□□□□ -0.41
SYF1Q04048 AIM45YPR004C 1035 nt12.5□□□□□ -0.41
SYF1Q04048 NVJ2YPR091C 2313 nt12.49□□□□□ -0.41
SYF1Q04048 TAT1YBR069C 1860 nt12.48□□□□□ -0.41
SYF1Q04048 MIC12YBR262C 321 nt12.46□□□□□ -0.41
SYF1Q04048 RTF1YGL244W 1677 nt12.45□□□□□ -0.42
SYF1Q04048 MRP20YDR405W 792 nt12.44□□□□□ -0.42
SYF1Q04048 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt12.44□□□□□ -0.42
SYF1Q04048 HHO1YPL127C 777 nt12.43□□□□□ -0.42
SYF1Q04048 RAX1YOR301W 1308 nt12.4□□□□□ -0.42
SYF1Q04048 SAM1YLR180W 1149 nt12.39□□□□□ -0.43
SYF1Q04048 YGR201CYGR201C 678 nt12.37□□□□□ -0.43
SYF1Q04048 COQ2YNR041C 1119 nt12.37□□□□□ -0.43
SYF1Q04048 AVT6YER119C 1347 nt12.37□□□□□ -0.43
SYF1Q04048 YLR111WYLR111W 333 nt12.34□□□□□ -0.43
SYF1Q04048 PIB2YGL023C 1908 nt12.33□□□□□ -0.44
SYF1Q04048 GOR1YNL274C 1053 nt12.29□□□□□ -0.44
SYF1Q04048 SFA1YDL168W 1161 nt12.28□□□□□ -0.44
SYF1Q04048 YCR102CYCR102C 1107 nt12.25□□□□□ -0.45
SYF1Q04048 PTK1YKL198C 1989 nt12.24□□□□□ -0.45
SYF1Q04048 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt12.23□□□□□ -0.45
SYF1Q04048 SDH5YOL071W 489 nt12.23□□□□□ -0.45
SYF1Q04048 RPL4BYDR012W 1089 nt12.21□□□□□ -0.45
SYF1Q04048 RPL4AYBR031W 1089 nt12.21□□□□□ -0.45
SYF1Q04048 RAD51YER095W 1203 nt12.19□□□□□ -0.46
SYF1Q04048 DUT1YBR252W 444 nt12.19□□□□□ -0.46
SYF1Q04048 CLB6YGR109C 1143 nt12.16□□□□□ -0.46
SYF1Q04048 YFL054CYFL054C 1941 nt12.13□□□□□ -0.47
SYF1Q04048 RPS14BYJL191W 417 nt12.13□□□□□ -0.47
SYF1Q04048 RAD23YEL037C 1197 nt12.11□□□□□ -0.47
SYF1Q04048 AGP1YCL025C 1902 nt12.11□□□□□ -0.47
SYF1Q04048 RPM1RPM1 483 nt12.1□□□□□ -0.47
SYF1Q04048 SHH4YLR164W 507 nt12.08□□□□□ -0.48
SYF1Q04048 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt12.08□□□□□ -0.48
SYF1Q04048 UTH1YKR042W 1098 nt12.07□□□□□ -0.48
SYF1Q04048 TOM6YOR045W 186 nt12.06□□□□□ -0.48
SYF1Q04048 CCA1YER168C 1641 nt12.05□□□□□ -0.48
SYF1Q04048 YNR029CYNR029C 1290 nt12.05□□□□□ -0.48
SYF1Q04048 STE4YOR212W 1272 nt12.05□□□□□ -0.48
SYF1Q04048 NBP35YGL091C 987 nt12.04□□□□□ -0.48
SYF1Q04048 TIR3YIL011W 810 nt12.04□□□□□ -0.48
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