Protein–RNA interactions for Protein: Q02260

SMD1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 146 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMD1Q02260 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt7.55□□□□□ -1.2
SMD1Q02260 DDR2YOL052C-A 186 nt7.55□□□□□ -1.2
SMD1Q02260 GLK1YCL040W 1503 nt7.55□□□□□ -1.2
SMD1Q02260 GAL1YBR020W 1587 nt7.54□□□□□ -1.2
SMD1Q02260 DIC1YLR348C 897 nt7.54□□□□□ -1.2
SMD1Q02260 MIC10YCL057C-A 294 nt7.53□□□□□ -1.2
SMD1Q02260 TRM5YHR070W 1500 nt7.52□□□□□ -1.2
SMD1Q02260 ALG12YNR030W 1656 nt7.52□□□□□ -1.21
SMD1Q02260 ANP1YEL036C 1503 nt7.52□□□□□ -1.21
SMD1Q02260 GID7YCL039W 2238 nt7.51□□□□□ -1.21
SMD1Q02260 FUR4YBR021W 1902 nt7.5□□□□□ -1.21
SMD1Q02260 CCA1YER168C 1641 nt7.49□□□□□ -1.21
SMD1Q02260 SPC25YER018C 666 nt7.48□□□□□ -1.21
SMD1Q02260 YLR235CYLR235C 399 nt7.48□□□□□ -1.21
SMD1Q02260 BNA2YJR078W 1362 nt7.46□□□□□ -1.21
SMD1Q02260 MIC12YBR262C 321 nt7.46□□□□□ -1.22
SMD1Q02260 GPI16YHR188C 1833 nt7.44□□□□□ -1.22
SMD1Q02260 STB1YNL309W 1263 nt7.44□□□□□ -1.22
SMD1Q02260 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt7.43□□□□□ -1.22
SMD1Q02260 YEL076CYEL076C 651 nt7.43□□□□□ -1.22
SMD1Q02260 YLR464WYLR464W 651 nt7.43□□□□□ -1.22
SMD1Q02260 TIM23YNR017W 669 nt7.43□□□□□ -1.22
SMD1Q02260 FEN2YCR028C 1539 nt7.42□□□□□ -1.22
SMD1Q02260 PRP4YPR178W 1398 nt7.42□□□□□ -1.22
SMD1Q02260 WSC2YNL283C 1512 nt7.42□□□□□ -1.22
SMD1Q02260 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt7.41□□□□□ -1.22
SMD1Q02260 AHT1YHR093W 549 nt7.4□□□□□ -1.22
SMD1Q02260 HSL7YBR133C 2484 nt7.39□□□□□ -1.23
SMD1Q02260 MET2YNL277W 1461 nt7.39□□□□□ -1.23
SMD1Q02260 YLR179CYLR179C 606 nt7.39□□□□□ -1.23
SMD1Q02260 AAC1YMR056C 930 nt7.39□□□□□ -1.23
SMD1Q02260 DPS1YLL018C 1674 nt7.38□□□□□ -1.23
SMD1Q02260 NPP1YCR026C 2229 nt7.38□□□□□ -1.23
SMD1Q02260 BSP1YPR171W 1731 nt7.38□□□□□ -1.23
SMD1Q02260 YGR201CYGR201C 678 nt7.37□□□□□ -1.23
SMD1Q02260 YIR016WYIR016W 798 nt7.37□□□□□ -1.23
SMD1Q02260 BMT6YLR063W 1098 nt7.37□□□□□ -1.23
SMD1Q02260 HHO1YPL127C 777 nt7.37□□□□□ -1.23
SMD1Q02260 YAT1YAR035W 2064 nt7.37□□□□□ -1.23
SMD1Q02260 CCT4YDL143W 1587 nt7.37□□□□□ -1.23
SMD1Q02260 SFP1YLR403W 2052 nt7.36□□□□□ -1.23
SMD1Q02260 YCL074WYCL074W 927 nt7.36□□□□□ -1.23
SMD1Q02260 HEL2YDR266C 1920 nt7.36□□□□□ -1.23
SMD1Q02260 YKR005CYKR005C 1578 nt7.34□□□□□ -1.23
SMD1Q02260 PTH1YHR189W 573 nt7.34□□□□□ -1.23
SMD1Q02260 YKL030WYKL030W 606 nt7.34□□□□□ -1.23
SMD1Q02260 VPS60YDR486C 690 nt7.33□□□□□ -1.24
SMD1Q02260 YPR064WYPR064W 420 nt7.33□□□□□ -1.24
SMD1Q02260 AGP1YCL025C 1902 nt7.33□□□□□ -1.24
SMD1Q02260 ESBP6YNL125C 2022 nt7.32□□□□□ -1.24
SMD1Q02260 IRC24YIR036C 792 nt7.31□□□□□ -1.24
SMD1Q02260 RDN25-1RDN25-1 3396 nt7.3□□□□□ -1.24
SMD1Q02260 RDN25-2RDN25-2 3396 nt7.3□□□□□ -1.24
SMD1Q02260 SPP1YPL138C 1062 nt7.29□□□□□ -1.24
SMD1Q02260 YGR259CYGR259C 441 nt7.28□□□□□ -1.24
SMD1Q02260 TAD3YLR316C 969 nt7.28□□□□□ -1.24
SMD1Q02260 DUS1YML080W 1272 nt7.28□□□□□ -1.24
SMD1Q02260 SWC5YBR231C 912 nt7.28□□□□□ -1.24
SMD1Q02260 UBX6YJL048C 1191 nt7.27□□□□□ -1.25
SMD1Q02260 XDJ1YLR090W 1380 nt7.26□□□□□ -1.25
SMD1Q02260 ALG3YBL082C 1377 nt7.26□□□□□ -1.25
SMD1Q02260 NAR1YNL240C 1476 nt7.24□□□□□ -1.25
SMD1Q02260 STR3YGL184C 1398 nt7.23□□□□□ -1.25
SMD1Q02260 CMP2YML057W 1815 nt7.23□□□□□ -1.25
SMD1Q02260 ILV2YMR108W 2064 nt7.22□□□□□ -1.25
SMD1Q02260 SNF1YDR477W 1902 nt7.21□□□□□ -1.25
SMD1Q02260 GOR1YNL274C 1053 nt7.21□□□□□ -1.26
SMD1Q02260 BIO5YNR056C 1686 nt7.2□□□□□ -1.26
SMD1Q02260 PBP1YGR178C 2169 nt7.19□□□□□ -1.26
SMD1Q02260 DTR1YBR180W 1719 nt7.18□□□□□ -1.26
SMD1Q02260 RDN18-1RDN18-1 1800 nt7.18□□□□□ -1.26
SMD1Q02260 RDN18-2RDN18-2 1800 nt7.18□□□□□ -1.26
SMD1Q02260 GDH3YAL062W 1374 nt7.18□□□□□ -1.26
SMD1Q02260 YLR415CYLR415C 339 nt7.17□□□□□ -1.26
SMD1Q02260 AVT6YER119C 1347 nt7.17□□□□□ -1.26
SMD1Q02260 RTN2YDL204W 1182 nt7.16□□□□□ -1.26
SMD1Q02260 CYT2YKL087C 675 nt7.16□□□□□ -1.26
SMD1Q02260 BDH1YAL060W 1149 nt7.16□□□□□ -1.26
SMD1Q02260 RFC1YOR217W 2586 nt7.15□□□□□ -1.26
SMD1Q02260 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt7.14□□□□□ -1.27
SMD1Q02260 RTG1YOL067C 534 nt7.14□□□□□ -1.27
SMD1Q02260 TIM17YJL143W 477 nt7.12□□□□□ -1.27
SMD1Q02260 DAT1YML113W 747 nt7.12□□□□□ -1.27
SMD1Q02260 DUT1YBR252W 444 nt7.11□□□□□ -1.27
SMD1Q02260 HMG2YLR450W 3138 nt7.11□□□□□ -1.27
SMD1Q02260 SHM2YLR058C 1410 nt7.1□□□□□ -1.27
SMD1Q02260 AQY2YLL052C 450 nt7.09□□□□□ -1.27
SMD1Q02260 YSP3YOR003W 1437 nt7.09□□□□□ -1.28
SMD1Q02260 TPO4YOR273C 1980 nt7.08□□□□□ -1.28
SMD1Q02260 GTB1YDR221W 2109 nt7.08□□□□□ -1.28
SMD1Q02260 HUA1YGR268C 597 nt7.07□□□□□ -1.28
SMD1Q02260 YCR102CYCR102C 1107 nt7.06□□□□□ -1.28
SMD1Q02260 ARP6YLR085C 1317 nt7.05□□□□□ -1.28
SMD1Q02260 NBP35YGL091C 987 nt7.05□□□□□ -1.28
SMD1Q02260 MRPL8YJL063C 717 nt7.04□□□□□ -1.28
SMD1Q02260 NIT1YIL164C 600 nt7.03□□□□□ -1.28
SMD1Q02260 GAL2YLR081W 1725 nt7.03□□□□□ -1.28
SMD1Q02260 URA8YJR103W 1737 nt7.02□□□□□ -1.29
SMD1Q02260 HEM14YER014W 1620 nt7.01□□□□□ -1.29
SMD1Q02260 UGA4YDL210W 1716 nt7.01□□□□□ -1.29
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