Protein–RNA interactions for Protein: Q00578

SSL2, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, yeastyeast

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Length 843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSL2Q00578 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt12.15□□□□□ -0.46
SSL2Q00578 DDR2YOL052C-A 186 nt12.14□□□□□ -0.47
SSL2Q00578 GLK1YCL040W 1503 nt12.11□□□□□ -0.47
SSL2Q00578 AGP1YCL025C 1902 nt12.11□□□□□ -0.47
SSL2Q00578 UME6YDR207C 2511 nt12.09□□□□□ -0.47
SSL2Q00578 STB1YNL309W 1263 nt12.07□□□□□ -0.48
SSL2Q00578 TIM23YNR017W 669 nt12.07□□□□□ -0.48
SSL2Q00578 WSC2YNL283C 1512 nt12.06□□□□□ -0.48
SSL2Q00578 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt12.06□□□□□ -0.48
SSL2Q00578 SPC25YER018C 666 nt12.05□□□□□ -0.48
SSL2Q00578 MIC12YBR262C 321 nt12.05□□□□□ -0.48
SSL2Q00578 FEN2YCR028C 1539 nt12.03□□□□□ -0.48
SSL2Q00578 YLR179CYLR179C 606 nt12.03□□□□□ -0.48
SSL2Q00578 YLR235CYLR235C 399 nt12.03□□□□□ -0.48
SSL2Q00578 AQY1YPR192W 918 nt12.02□□□□□ -0.49
SSL2Q00578 VPS60YDR486C 690 nt11.99□□□□□ -0.49
SSL2Q00578 AHT1YHR093W 549 nt11.99□□□□□ -0.49
SSL2Q00578 ALG3YBL082C 1377 nt11.99□□□□□ -0.49
SSL2Q00578 ALG12YNR030W 1656 nt11.96□□□□□ -0.5
SSL2Q00578 YIR016WYIR016W 798 nt11.94□□□□□ -0.5
SSL2Q00578 CCT4YDL143W 1587 nt11.93□□□□□ -0.5
SSL2Q00578 BNA2YJR078W 1362 nt11.92□□□□□ -0.5
SSL2Q00578 GPI16YHR188C 1833 nt11.92□□□□□ -0.5
SSL2Q00578 YKL030WYKL030W 606 nt11.91□□□□□ -0.5
SSL2Q00578 DUT1YBR252W 444 nt11.91□□□□□ -0.5
SSL2Q00578 PRP4YPR178W 1398 nt11.91□□□□□ -0.5
SSL2Q00578 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.9□□□□□ -0.5
SSL2Q00578 YEL076CYEL076C 651 nt11.9□□□□□ -0.5
SSL2Q00578 YLR464WYLR464W 651 nt11.9□□□□□ -0.5
SSL2Q00578 XDJ1YLR090W 1380 nt11.9□□□□□ -0.5
SSL2Q00578 MCH5YOR306C 1566 nt11.88□□□□□ -0.51
SSL2Q00578 DPS1YLL018C 1674 nt11.87□□□□□ -0.51
SSL2Q00578 RTG1YOL067C 534 nt11.86□□□□□ -0.51
SSL2Q00578 HHO1YPL127C 777 nt11.85□□□□□ -0.51
SSL2Q00578 SNF1YDR477W 1902 nt11.85□□□□□ -0.51
SSL2Q00578 YKR005CYKR005C 1578 nt11.84□□□□□ -0.51
SSL2Q00578 RDN18-1RDN18-1 1800 nt11.83□□□□□ -0.52
SSL2Q00578 RDN18-2RDN18-2 1800 nt11.83□□□□□ -0.52
SSL2Q00578 DUS1YML080W 1272 nt11.79□□□□□ -0.52
SSL2Q00578 YCL074WYCL074W 927 nt11.78□□□□□ -0.52
SSL2Q00578 YPR064WYPR064W 420 nt11.78□□□□□ -0.52
SSL2Q00578 SWC5YBR231C 912 nt11.78□□□□□ -0.52
SSL2Q00578 BIO5YNR056C 1686 nt11.78□□□□□ -0.52
SSL2Q00578 TAD3YLR316C 969 nt11.77□□□□□ -0.53
SSL2Q00578 BDH1YAL060W 1149 nt11.76□□□□□ -0.53
SSL2Q00578 AAC1YMR056C 930 nt11.76□□□□□ -0.53
SSL2Q00578 STR3YGL184C 1398 nt11.73□□□□□ -0.53
SSL2Q00578 YGR201CYGR201C 678 nt11.73□□□□□ -0.53
SSL2Q00578 YGR259CYGR259C 441 nt11.69□□□□□ -0.54
SSL2Q00578 PBP1YGR178C 2169 nt11.64□□□□□ -0.55
SSL2Q00578 NAR1YNL240C 1476 nt11.63□□□□□ -0.55
SSL2Q00578 GDH3YAL062W 1374 nt11.63□□□□□ -0.55
SSL2Q00578 AVT6YER119C 1347 nt11.62□□□□□ -0.55
SSL2Q00578 BMT6YLR063W 1098 nt11.61□□□□□ -0.55
SSL2Q00578 SHM2YLR058C 1410 nt11.6□□□□□ -0.55
SSL2Q00578 YSP3YOR003W 1437 nt11.6□□□□□ -0.55
SSL2Q00578 AQY2YLL052C 450 nt11.57□□□□□ -0.56
SSL2Q00578 YLR415CYLR415C 339 nt11.56□□□□□ -0.56
SSL2Q00578 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.55□□□□□ -0.56
SSL2Q00578 IRC24YIR036C 792 nt11.55□□□□□ -0.56
SSL2Q00578 NIT1YIL164C 600 nt11.54□□□□□ -0.56
SSL2Q00578 GOR1YNL274C 1053 nt11.52□□□□□ -0.57
SSL2Q00578 CYT2YKL087C 675 nt11.45□□□□□ -0.58
SSL2Q00578 YNL115CYNL115C 1935 nt11.44□□□□□ -0.58
SSL2Q00578 HUA1YGR268C 597 nt11.43□□□□□ -0.58
SSL2Q00578 DAT1YML113W 747 nt11.43□□□□□ -0.58
SSL2Q00578 SGT2YOR007C 1041 nt11.43□□□□□ -0.58
SSL2Q00578 NBP35YGL091C 987 nt11.42□□□□□ -0.58
SSL2Q00578 TIM17YJL143W 477 nt11.42□□□□□ -0.58
SSL2Q00578 RTN2YDL204W 1182 nt11.41□□□□□ -0.58
SSL2Q00578 YFL066CYFL066C 1179 nt11.4□□□□□ -0.58
SSL2Q00578 PLB1YMR008C 1995 nt11.37□□□□□ -0.59
SSL2Q00578 YAT1YAR035W 2064 nt11.37□□□□□ -0.59
SSL2Q00578 PEX25YPL112C 1185 nt11.36□□□□□ -0.59
SSL2Q00578 ARP6YLR085C 1317 nt11.32□□□□□ -0.6
SSL2Q00578 MRPL8YJL063C 717 nt11.3□□□□□ -0.6
SSL2Q00578 SHH4YLR164W 507 nt11.3□□□□□ -0.6
SSL2Q00578 YCR102CYCR102C 1107 nt11.28□□□□□ -0.6
SSL2Q00578 PRM5YIL117C 957 nt11.28□□□□□ -0.6
SSL2Q00578 PRE6YOL038W 765 nt11.28□□□□□ -0.6
SSL2Q00578 ADO1YJR105W 1023 nt11.22□□□□□ -0.61
SSL2Q00578 HIF1YLL022C 1158 nt11.22□□□□□ -0.61
SSL2Q00578 VPS75YNL246W 795 nt11.22□□□□□ -0.61
SSL2Q00578 YFR018CYFR018C 1092 nt11.19□□□□□ -0.62
SSL2Q00578 UTR1YJR049C 1593 nt11.19□□□□□ -0.62
SSL2Q00578 HSL7YBR133C 2484 nt11.15□□□□□ -0.62
SSL2Q00578 YJL225CYJL225C 5277 nt11.15□□□□□ -0.63
SSL2Q00578 YDR010CYDR010C 333 nt11.14□□□□□ -0.63
SSL2Q00578 PRO1YDR300C 1287 nt11.12□□□□□ -0.63
SSL2Q00578 TIR3YIL011W 810 nt11.12□□□□□ -0.63
SSL2Q00578 ALD4YOR374W 1560 nt11.11□□□□□ -0.63
SSL2Q00578 GAP1YKR039W 1809 nt11.1□□□□□ -0.63
SSL2Q00578 CMP2YML057W 1815 nt11.09□□□□□ -0.63
SSL2Q00578 SFA1YDL168W 1161 nt11.09□□□□□ -0.63
SSL2Q00578 POM34YLR018C 900 nt11.09□□□□□ -0.63
SSL2Q00578 RPC82YPR190C 1965 nt11.08□□□□□ -0.64
SSL2Q00578 RDN25-1RDN25-1 3396 nt11.05□□□□□ -0.64
SSL2Q00578 RDN25-2RDN25-2 3396 nt11.05□□□□□ -0.64
SSL2Q00578 LSC2YGR244C 1284 nt11.05□□□□□ -0.64
SSL2Q00578 SHB17YKR043C 816 nt11.05□□□□□ -0.64
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