Protein–RNA interactions for Protein: P62310

LSM3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM3P62310 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LSM3P62310 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LSM3P62310 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LSM3P62310 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LSM3P62310 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LSM3P62310 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LSM3P62310 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LSM3P62310 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LSM3P62310 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LSM3P62310 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LSM3P62310 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LSM3P62310 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LSM3P62310 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LSM3P62310 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LSM3P62310 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LSM3P62310 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LSM3P62310 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LSM3P62310 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LSM3P62310 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LSM3P62310 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LSM3P62310 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LSM3P62310 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LSM3P62310 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LSM3P62310 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LSM3P62310 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LSM3P62310 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LSM3P62310 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
LSM3P62310 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LSM3P62310 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LSM3P62310 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LSM3P62310 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LSM3P62310 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LSM3P62310 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LSM3P62310 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LSM3P62310 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LSM3P62310 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LSM3P62310 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LSM3P62310 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LSM3P62310 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LSM3P62310 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LSM3P62310 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LSM3P62310 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LSM3P62310 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LSM3P62310 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LSM3P62310 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LSM3P62310 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LSM3P62310 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LSM3P62310 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LSM3P62310 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LSM3P62310 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LSM3P62310 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LSM3P62310 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LSM3P62310 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LSM3P62310 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LSM3P62310 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LSM3P62310 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LSM3P62310 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LSM3P62310 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LSM3P62310 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LSM3P62310 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LSM3P62310 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LSM3P62310 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LSM3P62310 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LSM3P62310 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LSM3P62310 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LSM3P62310 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LSM3P62310 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LSM3P62310 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LSM3P62310 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LSM3P62310 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LSM3P62310 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LSM3P62310 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LSM3P62310 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LSM3P62310 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LSM3P62310 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LSM3P62310 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LSM3P62310 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LSM3P62310 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LSM3P62310 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LSM3P62310 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LSM3P62310 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LSM3P62310 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LSM3P62310 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LSM3P62310 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LSM3P62310 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LSM3P62310 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LSM3P62310 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LSM3P62310 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LSM3P62310 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LSM3P62310 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LSM3P62310 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LSM3P62310 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LSM3P62310 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LSM3P62310 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LSM3P62310 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LSM3P62310 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LSM3P62310 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LSM3P62310 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LSM3P62310 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LSM3P62310 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms