Protein–RNA interactions for Protein: P53999

SUB1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUB1P53999 HNRNPM-216ENST00000602219 1809 nt11.13□□□□□ -0.634e-13■■■■■ 111.6
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SUB1P53999 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.671e-11■■■■■ 111.2
SUB1P53999 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.51e-7■■■■■ 110.7
SUB1P53999 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.651e-7■■■■■ 110.7
SUB1P53999 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.651e-7■■■■■ 110.7
SUB1P53999 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.691e-7■■■■■ 110.7
SUB1P53999 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.741e-7■■■■■ 110.7
SUB1P53999 SEC13-216ENST00000479868 2374 ntTSL 1 (best)10.44□□□□□ -0.741e-7■■■■■ 110.7
SUB1P53999 SEC13-219ENST00000492602 393 ntTSL 33.8□□□□□ -1.81e-7■■■■■ 110.7
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SUB1P53999 EXOC4-201ENST00000253861 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.254e-19■■■■■ 109.9
SUB1P53999 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.255e-10■■■■■ 109.5
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SUB1P53999 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.555e-11■■■■■ 108.8
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SUB1P53999 MINOS1-201ENST00000322753 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.022e-10■■■■■ 105.1
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SUB1P53999 ASNS-202ENST00000394308 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.096e-8■■■■■ 95.1
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SUB1P53999 ATP5F1-205ENST00000483994 678 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.092e-20■■■■■ 94.9
SUB1P53999 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.289e-17■■■■■ 94.1
SUB1P53999 SELENOH-203ENST00000533321 1454 ntTSL 1 (best)12.71□□□□□ -0.389e-17■■■■■ 94.1
SUB1P53999 SELENOH-202ENST00000528798 469 ntTSL 211.85□□□□□ -0.519e-17■■■■■ 94.1
SUB1P53999 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.529e-17■■■■■ 94.1
SUB1P53999 SELENOH-205ENST00000534386 1039 ntTSL 210.96□□□□□ -0.659e-17■■■■■ 94.1
SUB1P53999 AP001931.1-201ENST00000531074 580 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.959e-17■■■■■ 94.1
SUB1P53999 TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.049e-17■■■■■ 94.1
SUB1P53999 HNRNPC-204ENST00000449098 1599 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.932e-37■■■■■ 93.4
SUB1P53999 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.311e-7■■■■■ 93
SUB1P53999 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.61e-7■■■■■ 93
SUB1P53999 HNRNPDL-201ENST00000295470 3781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.971e-7■■■■■ 93
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SUB1P53999 EIF3H-201ENST00000276682 2041 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.337e-11■■■■■ 92.9
SUB1P53999 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.737e-11■■■■■ 92.9
SUB1P53999 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.383e-14■■■■■ 92.8
SUB1P53999 TRA2B-214ENST00000487615 4485 ntTSL 1 (best)10.13□□□□□ -0.793e-14■■■■■ 92.8
SUB1P53999 TRA2B-206ENST00000456380 1697 ntTSL 58.91□□□□□ -0.983e-14■■■■■ 92.8
SUB1P53999 TRA2B-204ENST00000414862 710 ntTSL 35.31□□□□□ -1.563e-14■■■■■ 92.8
SUB1P53999 TRA2B-209ENST00000466832 2414 ntTSL 24.66□□□□□ -1.663e-14■■■■■ 92.8
SUB1P53999 TRA2B-207ENST00000463328 2780 ntTSL 24.33□□□□□ -1.723e-14■■■■■ 92.8
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