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Protein–RNA interactions for Protein: P53900
GIM3, Prefoldin subunit 4, yeast
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129 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
GIM3
P53900
IMT3
tM(CAU)J3
72 nt
9.51
□□□□□ -0.89
GIM3
P53900
IMT1
tM(CAU)O1
72 nt
9.51
□□□□□ -0.89
GIM3
P53900
IMT2
tM(CAU)P
72 nt
9.51
□□□□□ -0.89
GIM3
P53900
ATF2
YGR177C
1608 nt
9.5
□□□□□ -0.89
GIM3
P53900
SNG1
YGR197C
1644 nt
9.5
□□□□□ -0.89
GIM3
P53900
MET2
YNL277W
1461 nt
9.5
□□□□□ -0.89
GIM3
P53900
BNA2
YJR078W
1362 nt
9.49
□□□□□ -0.89
GIM3
P53900
BMT6
YLR063W
1098 nt
9.48
□□□□□ -0.89
GIM3
P53900
CCA1
YER168C
1641 nt
9.48
□□□□□ -0.89
GIM3
P53900
MIC10
YCL057C-A
294 nt
9.47
□□□□□ -0.89
GIM3
P53900
GAL1
YBR020W
1587 nt
9.46
□□□□□ -0.89
GIM3
P53900
DIC1
YLR348C
897 nt
9.46
□□□□□ -0.9
GIM3
P53900
PRP4
YPR178W
1398 nt
9.46
□□□□□ -0.9
GIM3
P53900
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YDL086C-A
435 nt
9.45
□□□□□ -0.9
GIM3
P53900
YEL076C-A
YEL076C-A
651 nt
9.45
□□□□□ -0.9
GIM3
P53900
YEL076C
YEL076C
651 nt
9.45
□□□□□ -0.9
GIM3
P53900
YLR464W
YLR464W
651 nt
9.45
□□□□□ -0.9
GIM3
P53900
AAC1
YMR056C
930 nt
9.45
□□□□□ -0.9
GIM3
P53900
LPX1
YOR084W
1164 nt
9.45
□□□□□ -0.9
GIM3
P53900
YPR011C
YPR011C
981 nt
9.44
□□□□□ -0.9
GIM3
P53900
TRM5
YHR070W
1500 nt
9.44
□□□□□ -0.9
GIM3
P53900
ESBP6
YNL125C
2022 nt
9.44
□□□□□ -0.9
GIM3
P53900
ANP1
YEL036C
1503 nt
9.41
□□□□□ -0.9
GIM3
P53900
WSC2
YNL283C
1512 nt
9.39
□□□□□ -0.91
GIM3
P53900
DPS1
YLL018C
1674 nt
9.39
□□□□□ -0.91
GIM3
P53900
MIC12
YBR262C
321 nt
9.37
□□□□□ -0.91
GIM3
P53900
YAT1
YAR035W
2064 nt
9.36
□□□□□ -0.91
GIM3
P53900
NPP1
YCR026C
2229 nt
9.36
□□□□□ -0.91
GIM3
P53900
YLR235C
YLR235C
399 nt
9.35
□□□□□ -0.91
GIM3
P53900
GPI16
YHR188C
1833 nt
9.35
□□□□□ -0.91
GIM3
P53900
YCL074W
YCL074W
927 nt
9.34
□□□□□ -0.91
GIM3
P53900
SPC25
YER018C
666 nt
9.34
□□□□□ -0.91
GIM3
P53900
STB1
YNL309W
1263 nt
9.34
□□□□□ -0.91
GIM3
P53900
YKR005C
YKR005C
1578 nt
9.33
□□□□□ -0.92
GIM3
P53900
YDR524C-B
YDR524C-B
201 nt
9.33
□□□□□ -0.92
GIM3
P53900
DUS1
YML080W
1272 nt
9.32
□□□□□ -0.92
GIM3
P53900
ILV2
YMR108W
2064 nt
9.32
□□□□□ -0.92
GIM3
P53900
SFP1
YLR403W
2052 nt
9.31
□□□□□ -0.92
GIM3
P53900
HHO1
YPL127C
777 nt
9.3
□□□□□ -0.92
GIM3
P53900
DTR1
YBR180W
1719 nt
9.3
□□□□□ -0.92
GIM3
P53900
FEN2
YCR028C
1539 nt
9.3
□□□□□ -0.92
GIM3
P53900
TIM23
YNR017W
669 nt
9.29
□□□□□ -0.92
GIM3
P53900
RDN25-1
RDN25-1
3396 nt
9.29
□□□□□ -0.92
GIM3
P53900
RDN25-2
RDN25-2
3396 nt
9.29
□□□□□ -0.92
GIM3
P53900
YGR201C
YGR201C
678 nt
9.28
□□□□□ -0.92
GIM3
P53900
IRC24
YIR036C
792 nt
9.27
□□□□□ -0.93
GIM3
P53900
HEL2
YDR266C
1920 nt
9.27
□□□□□ -0.93
GIM3
P53900
YGR259C
YGR259C
441 nt
9.26
□□□□□ -0.93
GIM3
P53900
YLR179C
YLR179C
606 nt
9.26
□□□□□ -0.93
GIM3
P53900
HSL7
YBR133C
2484 nt
9.25
□□□□□ -0.93
GIM3
P53900
NAR1
YNL240C
1476 nt
9.22
□□□□□ -0.93
GIM3
P53900
YIR016W
YIR016W
798 nt
9.22
□□□□□ -0.93
GIM3
P53900
HEM14
YER014W
1620 nt
9.21
□□□□□ -0.93
GIM3
P53900
CCT4
YDL143W
1587 nt
9.2
□□□□□ -0.94
GIM3
P53900
AGP1
YCL025C
1902 nt
9.2
□□□□□ -0.94
GIM3
P53900
VPS60
YDR486C
690 nt
9.19
□□□□□ -0.94
GIM3
P53900
SWC5
YBR231C
912 nt
9.19
□□□□□ -0.94
GIM3
P53900
PTH1
YHR189W
573 nt
9.18
□□□□□ -0.94
GIM3
P53900
AHT1
YHR093W
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9.17
□□□□□ -0.94
GIM3
P53900
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YPR064W
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9.17
□□□□□ -0.94
GIM3
P53900
RFC1
YOR217W
2586 nt
9.16
□□□□□ -0.94
GIM3
P53900
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YKL030W
606 nt
9.14
□□□□□ -0.95
GIM3
P53900
CYT2
YKL087C
675 nt
9.14
□□□□□ -0.95
GIM3
P53900
BIO5
YNR056C
1686 nt
9.13
□□□□□ -0.95
GIM3
P53900
SNF1
YDR477W
1902 nt
9.13
□□□□□ -0.95
GIM3
P53900
GOR1
YNL274C
1053 nt
9.12
□□□□□ -0.95
GIM3
P53900
RTN2
YDL204W
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□□□□□ -0.95
GIM3
P53900
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YLR090W
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9.11
□□□□□ -0.95
GIM3
P53900
STR3
YGL184C
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9.09
□□□□□ -0.95
GIM3
P53900
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YBL082C
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9.09
□□□□□ -0.95
GIM3
P53900
CMP2
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9.08
□□□□□ -0.96
GIM3
P53900
GAL2
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9.08
□□□□□ -0.96
GIM3
P53900
PBP1
YGR178C
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9.06
□□□□□ -0.96
GIM3
P53900
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YLR316C
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9.06
□□□□□ -0.96
GIM3
P53900
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GIM3
P53900
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GIM3
P53900
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GIM3
P53900
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RDN18-1
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□□□□□ -0.97
GIM3
P53900
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RDN18-2
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□□□□□ -0.97
GIM3
P53900
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GIM3
P53900
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9
□□□□□ -0.97
GIM3
P53900
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YLR415C
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□□□□□ -0.97
GIM3
P53900
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□□□□□ -0.97
GIM3
P53900
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GIM3
P53900
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YDR221W
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□□□□□ -0.98
GIM3
P53900
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YML113W
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□□□□□ -0.98
GIM3
P53900
DUT1
YBR252W
444 nt
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□□□□□ -0.98
GIM3
P53900
TPO4
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1980 nt
8.91
□□□□□ -0.98
GIM3
P53900
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tL(GAG)G
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8.9
□□□□□ -0.98
GIM3
P53900
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1542 nt
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□□□□□ -0.99
GIM3
P53900
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YLR058C
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□□□□□ -0.99
GIM3
P53900
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YJR103W
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8.88
□□□□□ -0.99
GIM3
P53900
TOK1
YJL093C
2076 nt
8.87
□□□□□ -0.99
GIM3
P53900
YCR102C
YCR102C
1107 nt
8.87
□□□□□ -0.99
GIM3
P53900
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YAL060W
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□□□□□ -0.99
GIM3
P53900
MCM5
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□□□□□ -0.99
GIM3
P53900
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□□□□□ -0.99
GIM3
P53900
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□□□□□ -0.99
GIM3
P53900
ARP6
YLR085C
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□□□□□ -0.99
GIM3
P53900
ALD4
YOR374W
1560 nt
8.82
□□□□□ -1
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