Protein–RNA interactions for Protein: P53900

GIM3, Prefoldin subunit 4, yeastyeast

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GIM3P53900 IMT3tM(CAU)J3 72 nt9.51□□□□□ -0.89
GIM3P53900 IMT1tM(CAU)O1 72 nt9.51□□□□□ -0.89
GIM3P53900 IMT2tM(CAU)P 72 nt9.51□□□□□ -0.89
GIM3P53900 ATF2YGR177C 1608 nt9.5□□□□□ -0.89
GIM3P53900 SNG1YGR197C 1644 nt9.5□□□□□ -0.89
GIM3P53900 MET2YNL277W 1461 nt9.5□□□□□ -0.89
GIM3P53900 BNA2YJR078W 1362 nt9.49□□□□□ -0.89
GIM3P53900 BMT6YLR063W 1098 nt9.48□□□□□ -0.89
GIM3P53900 CCA1YER168C 1641 nt9.48□□□□□ -0.89
GIM3P53900 MIC10YCL057C-A 294 nt9.47□□□□□ -0.89
GIM3P53900 GAL1YBR020W 1587 nt9.46□□□□□ -0.89
GIM3P53900 DIC1YLR348C 897 nt9.46□□□□□ -0.9
GIM3P53900 PRP4YPR178W 1398 nt9.46□□□□□ -0.9
GIM3P53900 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt9.45□□□□□ -0.9
GIM3P53900 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt9.45□□□□□ -0.9
GIM3P53900 YEL076CYEL076C 651 nt9.45□□□□□ -0.9
GIM3P53900 YLR464WYLR464W 651 nt9.45□□□□□ -0.9
GIM3P53900 AAC1YMR056C 930 nt9.45□□□□□ -0.9
GIM3P53900 LPX1YOR084W 1164 nt9.45□□□□□ -0.9
GIM3P53900 YPR011CYPR011C 981 nt9.44□□□□□ -0.9
GIM3P53900 TRM5YHR070W 1500 nt9.44□□□□□ -0.9
GIM3P53900 ESBP6YNL125C 2022 nt9.44□□□□□ -0.9
GIM3P53900 ANP1YEL036C 1503 nt9.41□□□□□ -0.9
GIM3P53900 WSC2YNL283C 1512 nt9.39□□□□□ -0.91
GIM3P53900 DPS1YLL018C 1674 nt9.39□□□□□ -0.91
GIM3P53900 MIC12YBR262C 321 nt9.37□□□□□ -0.91
GIM3P53900 YAT1YAR035W 2064 nt9.36□□□□□ -0.91
GIM3P53900 NPP1YCR026C 2229 nt9.36□□□□□ -0.91
GIM3P53900 YLR235CYLR235C 399 nt9.35□□□□□ -0.91
GIM3P53900 GPI16YHR188C 1833 nt9.35□□□□□ -0.91
GIM3P53900 YCL074WYCL074W 927 nt9.34□□□□□ -0.91
GIM3P53900 SPC25YER018C 666 nt9.34□□□□□ -0.91
GIM3P53900 STB1YNL309W 1263 nt9.34□□□□□ -0.91
GIM3P53900 YKR005CYKR005C 1578 nt9.33□□□□□ -0.92
GIM3P53900 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt9.33□□□□□ -0.92
GIM3P53900 DUS1YML080W 1272 nt9.32□□□□□ -0.92
GIM3P53900 ILV2YMR108W 2064 nt9.32□□□□□ -0.92
GIM3P53900 SFP1YLR403W 2052 nt9.31□□□□□ -0.92
GIM3P53900 HHO1YPL127C 777 nt9.3□□□□□ -0.92
GIM3P53900 DTR1YBR180W 1719 nt9.3□□□□□ -0.92
GIM3P53900 FEN2YCR028C 1539 nt9.3□□□□□ -0.92
GIM3P53900 TIM23YNR017W 669 nt9.29□□□□□ -0.92
GIM3P53900 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.29□□□□□ -0.92
GIM3P53900 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.29□□□□□ -0.92
GIM3P53900 YGR201CYGR201C 678 nt9.28□□□□□ -0.92
GIM3P53900 IRC24YIR036C 792 nt9.27□□□□□ -0.93
GIM3P53900 HEL2YDR266C 1920 nt9.27□□□□□ -0.93
GIM3P53900 YGR259CYGR259C 441 nt9.26□□□□□ -0.93
GIM3P53900 YLR179CYLR179C 606 nt9.26□□□□□ -0.93
GIM3P53900 HSL7YBR133C 2484 nt9.25□□□□□ -0.93
GIM3P53900 NAR1YNL240C 1476 nt9.22□□□□□ -0.93
GIM3P53900 YIR016WYIR016W 798 nt9.22□□□□□ -0.93
GIM3P53900 HEM14YER014W 1620 nt9.21□□□□□ -0.93
GIM3P53900 CCT4YDL143W 1587 nt9.2□□□□□ -0.94
GIM3P53900 AGP1YCL025C 1902 nt9.2□□□□□ -0.94
GIM3P53900 VPS60YDR486C 690 nt9.19□□□□□ -0.94
GIM3P53900 SWC5YBR231C 912 nt9.19□□□□□ -0.94
GIM3P53900 PTH1YHR189W 573 nt9.18□□□□□ -0.94
GIM3P53900 AHT1YHR093W 549 nt9.17□□□□□ -0.94
GIM3P53900 YPR064WYPR064W 420 nt9.17□□□□□ -0.94
GIM3P53900 RFC1YOR217W 2586 nt9.16□□□□□ -0.94
GIM3P53900 YKL030WYKL030W 606 nt9.14□□□□□ -0.95
GIM3P53900 CYT2YKL087C 675 nt9.14□□□□□ -0.95
GIM3P53900 BIO5YNR056C 1686 nt9.13□□□□□ -0.95
GIM3P53900 SNF1YDR477W 1902 nt9.13□□□□□ -0.95
GIM3P53900 GOR1YNL274C 1053 nt9.12□□□□□ -0.95
GIM3P53900 RTN2YDL204W 1182 nt9.11□□□□□ -0.95
GIM3P53900 XDJ1YLR090W 1380 nt9.11□□□□□ -0.95
GIM3P53900 STR3YGL184C 1398 nt9.09□□□□□ -0.95
GIM3P53900 ALG3YBL082C 1377 nt9.09□□□□□ -0.95
GIM3P53900 CMP2YML057W 1815 nt9.08□□□□□ -0.96
GIM3P53900 GAL2YLR081W 1725 nt9.08□□□□□ -0.96
GIM3P53900 PBP1YGR178C 2169 nt9.06□□□□□ -0.96
GIM3P53900 TAD3YLR316C 969 nt9.06□□□□□ -0.96
GIM3P53900 AVT6YER119C 1347 nt9.05□□□□□ -0.96
GIM3P53900 RSC4YKR008W 1878 nt9.03□□□□□ -0.96
GIM3P53900 AQY2YLL052C 450 nt9.02□□□□□ -0.97
GIM3P53900 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.02□□□□□ -0.97
GIM3P53900 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.02□□□□□ -0.97
GIM3P53900 GDH3YAL062W 1374 nt9.01□□□□□ -0.97
GIM3P53900 SPP1YPL138C 1062 nt9□□□□□ -0.97
GIM3P53900 YLR415CYLR415C 339 nt8.97□□□□□ -0.97
GIM3P53900 HMG2YLR450W 3138 nt8.97□□□□□ -0.97
GIM3P53900 TIM17YJL143W 477 nt8.96□□□□□ -0.98
GIM3P53900 GTB1YDR221W 2109 nt8.96□□□□□ -0.98
GIM3P53900 DAT1YML113W 747 nt8.92□□□□□ -0.98
GIM3P53900 DUT1YBR252W 444 nt8.92□□□□□ -0.98
GIM3P53900 TPO4YOR273C 1980 nt8.91□□□□□ -0.98
GIM3P53900 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt8.9□□□□□ -0.98
GIM3P53900 NDI1YML120C 1542 nt8.9□□□□□ -0.99
GIM3P53900 SHM2YLR058C 1410 nt8.89□□□□□ -0.99
GIM3P53900 URA8YJR103W 1737 nt8.88□□□□□ -0.99
GIM3P53900 TOK1YJL093C 2076 nt8.87□□□□□ -0.99
GIM3P53900 YCR102CYCR102C 1107 nt8.87□□□□□ -0.99
GIM3P53900 BDH1YAL060W 1149 nt8.87□□□□□ -0.99
GIM3P53900 MCM5YLR274W 2328 nt8.87□□□□□ -0.99
GIM3P53900 UGA4YDL210W 1716 nt8.85□□□□□ -0.99
GIM3P53900 MAS1YLR163C 1389 nt8.85□□□□□ -0.99
GIM3P53900 ARP6YLR085C 1317 nt8.84□□□□□ -0.99
GIM3P53900 ALD4YOR374W 1560 nt8.82□□□□□ -1
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13 ms